Protein–RNA interactions for Protein: P09629

HOXB7, Homeobox protein Hox-B7, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB7P09629 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HOXB7P09629 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HOXB7P09629 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HOXB7P09629 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HOXB7P09629 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
HOXB7P09629 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HOXB7P09629 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HOXB7P09629 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HOXB7P09629 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HOXB7P09629 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HOXB7P09629 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HOXB7P09629 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HOXB7P09629 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HOXB7P09629 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HOXB7P09629 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HOXB7P09629 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HOXB7P09629 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HOXB7P09629 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HOXB7P09629 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HOXB7P09629 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HOXB7P09629 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HOXB7P09629 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HOXB7P09629 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HOXB7P09629 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HOXB7P09629 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HOXB7P09629 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HOXB7P09629 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HOXB7P09629 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
HOXB7P09629 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HOXB7P09629 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HOXB7P09629 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HOXB7P09629 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HOXB7P09629 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HOXB7P09629 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HOXB7P09629 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HOXB7P09629 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HOXB7P09629 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HOXB7P09629 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HOXB7P09629 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HOXB7P09629 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HOXB7P09629 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HOXB7P09629 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HOXB7P09629 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HOXB7P09629 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HOXB7P09629 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HOXB7P09629 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
HOXB7P09629 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HOXB7P09629 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HOXB7P09629 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HOXB7P09629 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HOXB7P09629 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HOXB7P09629 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HOXB7P09629 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HOXB7P09629 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HOXB7P09629 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HOXB7P09629 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HOXB7P09629 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HOXB7P09629 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HOXB7P09629 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HOXB7P09629 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HOXB7P09629 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
HOXB7P09629 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HOXB7P09629 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HOXB7P09629 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HOXB7P09629 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HOXB7P09629 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
HOXB7P09629 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HOXB7P09629 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
HOXB7P09629 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HOXB7P09629 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HOXB7P09629 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HOXB7P09629 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HOXB7P09629 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HOXB7P09629 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HOXB7P09629 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HOXB7P09629 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HOXB7P09629 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HOXB7P09629 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HOXB7P09629 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HOXB7P09629 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HOXB7P09629 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HOXB7P09629 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HOXB7P09629 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HOXB7P09629 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HOXB7P09629 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
HOXB7P09629 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HOXB7P09629 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HOXB7P09629 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HOXB7P09629 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HOXB7P09629 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
HOXB7P09629 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HOXB7P09629 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HOXB7P09629 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HOXB7P09629 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HOXB7P09629 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
HOXB7P09629 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HOXB7P09629 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HOXB7P09629 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HOXB7P09629 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HOXB7P09629 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms