Protein–RNA interactions for Protein: O94759

TRPM2, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPM2O94759 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRPM2O94759 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRPM2O94759 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRPM2O94759 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRPM2O94759 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRPM2O94759 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRPM2O94759 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRPM2O94759 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRPM2O94759 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRPM2O94759 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRPM2O94759 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRPM2O94759 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRPM2O94759 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRPM2O94759 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
TRPM2O94759 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRPM2O94759 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
TRPM2O94759 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRPM2O94759 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRPM2O94759 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRPM2O94759 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRPM2O94759 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRPM2O94759 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRPM2O94759 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRPM2O94759 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRPM2O94759 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
TRPM2O94759 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRPM2O94759 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRPM2O94759 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRPM2O94759 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRPM2O94759 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRPM2O94759 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRPM2O94759 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRPM2O94759 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TRPM2O94759 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TRPM2O94759 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TRPM2O94759 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TRPM2O94759 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
TRPM2O94759 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
TRPM2O94759 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TRPM2O94759 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TRPM2O94759 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TRPM2O94759 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TRPM2O94759 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TRPM2O94759 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
TRPM2O94759 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
TRPM2O94759 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
TRPM2O94759 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
TRPM2O94759 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
TRPM2O94759 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.19
TRPM2O94759 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
TRPM2O94759 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
TRPM2O94759 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TRPM2O94759 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TRPM2O94759 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TRPM2O94759 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
TRPM2O94759 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRPM2O94759 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRPM2O94759 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRPM2O94759 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRPM2O94759 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
TRPM2O94759 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRPM2O94759 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRPM2O94759 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRPM2O94759 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRPM2O94759 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRPM2O94759 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
TRPM2O94759 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRPM2O94759 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRPM2O94759 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRPM2O94759 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRPM2O94759 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRPM2O94759 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRPM2O94759 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRPM2O94759 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRPM2O94759 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRPM2O94759 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRPM2O94759 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRPM2O94759 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRPM2O94759 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRPM2O94759 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
TRPM2O94759 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRPM2O94759 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRPM2O94759 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRPM2O94759 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRPM2O94759 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRPM2O94759 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TRPM2O94759 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TRPM2O94759 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TRPM2O94759 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TRPM2O94759 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TRPM2O94759 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TRPM2O94759 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TRPM2O94759 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TRPM2O94759 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TRPM2O94759 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TRPM2O94759 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TRPM2O94759 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TRPM2O94759 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TRPM2O94759 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
TRPM2O94759 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms