Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccl20O89093 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccl20O89093 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccl20O89093 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccl20O89093 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccl20O89093 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccl20O89093 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccl20O89093 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccl20O89093 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccl20O89093 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccl20O89093 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccl20O89093 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccl20O89093 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccl20O89093 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccl20O89093 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccl20O89093 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccl20O89093 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccl20O89093 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccl20O89093 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccl20O89093 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccl20O89093 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccl20O89093 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccl20O89093 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccl20O89093 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccl20O89093 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccl20O89093 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccl20O89093 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccl20O89093 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccl20O89093 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccl20O89093 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccl20O89093 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccl20O89093 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccl20O89093 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccl20O89093 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccl20O89093 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccl20O89093 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccl20O89093 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccl20O89093 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccl20O89093 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccl20O89093 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccl20O89093 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccl20O89093 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccl20O89093 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccl20O89093 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccl20O89093 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccl20O89093 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccl20O89093 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccl20O89093 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccl20O89093 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccl20O89093 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccl20O89093 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccl20O89093 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccl20O89093 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccl20O89093 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccl20O89093 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccl20O89093 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccl20O89093 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccl20O89093 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccl20O89093 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccl20O89093 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccl20O89093 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccl20O89093 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccl20O89093 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccl20O89093 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccl20O89093 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccl20O89093 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccl20O89093 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccl20O89093 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccl20O89093 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccl20O89093 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccl20O89093 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ccl20O89093 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ccl20O89093 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ccl20O89093 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ccl20O89093 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ccl20O89093 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccl20O89093 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccl20O89093 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccl20O89093 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccl20O89093 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccl20O89093 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccl20O89093 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccl20O89093 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccl20O89093 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccl20O89093 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccl20O89093 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccl20O89093 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccl20O89093 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccl20O89093 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccl20O89093 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccl20O89093 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccl20O89093 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccl20O89093 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccl20O89093 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccl20O89093 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccl20O89093 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccl20O89093 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccl20O89093 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccl20O89093 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccl20O89093 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms