Protein–RNA interactions for Protein: O75293

GADD45B, Growth arrest and DNA damage-inducible protein GADD45 beta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45BO75293 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GADD45BO75293 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GADD45BO75293 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GADD45BO75293 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GADD45BO75293 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GADD45BO75293 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GADD45BO75293 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GADD45BO75293 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GADD45BO75293 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GADD45BO75293 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GADD45BO75293 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GADD45BO75293 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GADD45BO75293 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GADD45BO75293 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GADD45BO75293 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GADD45BO75293 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GADD45BO75293 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GADD45BO75293 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GADD45BO75293 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GADD45BO75293 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GADD45BO75293 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GADD45BO75293 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GADD45BO75293 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GADD45BO75293 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GADD45BO75293 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GADD45BO75293 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GADD45BO75293 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GADD45BO75293 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GADD45BO75293 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GADD45BO75293 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GADD45BO75293 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GADD45BO75293 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GADD45BO75293 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GADD45BO75293 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GADD45BO75293 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GADD45BO75293 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GADD45BO75293 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GADD45BO75293 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GADD45BO75293 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GADD45BO75293 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GADD45BO75293 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GADD45BO75293 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GADD45BO75293 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GADD45BO75293 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GADD45BO75293 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GADD45BO75293 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GADD45BO75293 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GADD45BO75293 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GADD45BO75293 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GADD45BO75293 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GADD45BO75293 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GADD45BO75293 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GADD45BO75293 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GADD45BO75293 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GADD45BO75293 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GADD45BO75293 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GADD45BO75293 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GADD45BO75293 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GADD45BO75293 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GADD45BO75293 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GADD45BO75293 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GADD45BO75293 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GADD45BO75293 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GADD45BO75293 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GADD45BO75293 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GADD45BO75293 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GADD45BO75293 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GADD45BO75293 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GADD45BO75293 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GADD45BO75293 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GADD45BO75293 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GADD45BO75293 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GADD45BO75293 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GADD45BO75293 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GADD45BO75293 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GADD45BO75293 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GADD45BO75293 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GADD45BO75293 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GADD45BO75293 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GADD45BO75293 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GADD45BO75293 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GADD45BO75293 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GADD45BO75293 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GADD45BO75293 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GADD45BO75293 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GADD45BO75293 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GADD45BO75293 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GADD45BO75293 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GADD45BO75293 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GADD45BO75293 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GADD45BO75293 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GADD45BO75293 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GADD45BO75293 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GADD45BO75293 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GADD45BO75293 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GADD45BO75293 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GADD45BO75293 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GADD45BO75293 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GADD45BO75293 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GADD45BO75293 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms