Protein–RNA interactions for Protein: O00295

TULP2, Tubby-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP2O00295 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TULP2O00295 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TULP2O00295 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TULP2O00295 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TULP2O00295 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TULP2O00295 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TULP2O00295 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TULP2O00295 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TULP2O00295 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TULP2O00295 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TULP2O00295 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TULP2O00295 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TULP2O00295 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TULP2O00295 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TULP2O00295 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TULP2O00295 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TULP2O00295 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
TULP2O00295 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
TULP2O00295 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TULP2O00295 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TULP2O00295 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TULP2O00295 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TULP2O00295 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TULP2O00295 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TULP2O00295 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TULP2O00295 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TULP2O00295 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TULP2O00295 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TULP2O00295 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TULP2O00295 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TULP2O00295 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TULP2O00295 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TULP2O00295 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TULP2O00295 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TULP2O00295 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TULP2O00295 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TULP2O00295 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TULP2O00295 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TULP2O00295 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TULP2O00295 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TULP2O00295 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TULP2O00295 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TULP2O00295 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TULP2O00295 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TULP2O00295 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TULP2O00295 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TULP2O00295 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TULP2O00295 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TULP2O00295 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TULP2O00295 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TULP2O00295 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TULP2O00295 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TULP2O00295 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TULP2O00295 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TULP2O00295 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TULP2O00295 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TULP2O00295 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TULP2O00295 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TULP2O00295 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TULP2O00295 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TULP2O00295 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TULP2O00295 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TULP2O00295 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TULP2O00295 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TULP2O00295 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TULP2O00295 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TULP2O00295 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TULP2O00295 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TULP2O00295 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TULP2O00295 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TULP2O00295 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TULP2O00295 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TULP2O00295 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TULP2O00295 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TULP2O00295 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TULP2O00295 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TULP2O00295 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TULP2O00295 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TULP2O00295 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TULP2O00295 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TULP2O00295 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TULP2O00295 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TULP2O00295 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TULP2O00295 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TULP2O00295 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TULP2O00295 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TULP2O00295 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TULP2O00295 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TULP2O00295 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TULP2O00295 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TULP2O00295 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TULP2O00295 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TULP2O00295 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TULP2O00295 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TULP2O00295 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TULP2O00295 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TULP2O00295 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TULP2O00295 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TULP2O00295 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TULP2O00295 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms