Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3P4

VPS8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS8Q8N3P4 LINC01031-201ENST00000420807 779 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
VPS8Q8N3P4 LINC01093-201ENST00000506479 634 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
VPS8Q8N3P4 AC010609.1-201ENST00000519375 569 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
VPS8Q8N3P4 AC078922.1-201ENST00000547547 434 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
VPS8Q8N3P4 PPIAL4A-201ENST00000577856 660 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
VPS8Q8N3P4 RN7SL475P-201ENST00000583379 298 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
VPS8Q8N3P4 IGFL2-AS1-206ENST00000601263 446 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
VPS8Q8N3P4 Metazoa_SRP.134-201ENST00000610965 327 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
VPS8Q8N3P4 Metazoa_SRP.81-201ENST00000618466 316 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
VPS8Q8N3P4 SCML2-202ENST00000398048 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
VPS8Q8N3P4 AC044839.1-206ENST00000635559 1324 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
VPS8Q8N3P4 C1QTNF7-201ENST00000295297 4516 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
VPS8Q8N3P4 AL139384.2-201ENST00000613809 3590 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
VPS8Q8N3P4 ATM-215ENST00000530958 5718 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
VPS8Q8N3P4 AC092821.3-202ENST00000641304 2767 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
VPS8Q8N3P4 KCNJ16-205ENST00000586462 1897 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
VPS8Q8N3P4 AL353753.1-201ENST00000612217 2320 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
VPS8Q8N3P4 NRK-201ENST00000243300 8062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
VPS8Q8N3P4 OR6N2-202ENST00000641131 3455 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 OR56A4-201ENST00000330728 1209 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 TERB2-201ENST00000340827 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 RNA5SP188-201ENST00000362916 129 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 RNA5SP77-201ENST00000365394 120 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 TINAG-203ENST00000370869 782 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 AC245036.1-201ENST00000391727 309 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 AC003045.1-201ENST00000398779 713 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 AL391419.1-201ENST00000398901 1275 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 AL592146.1-201ENST00000433869 1126 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 RARRES2P3-201ENST00000457739 473 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 LINC01618-201ENST00000514957 727 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 AC069234.2-202ENST00000535720 583 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 AC022872.1-201ENST00000568391 781 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 OR1E3-201ENST00000575608 948 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 RN7SL366P-201ENST00000577957 292 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 MRPL57P1-201ENST00000621486 265 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 AC111152.1-202ENST00000635848 339 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 OR56A4-203ENST00000641279 1209 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 SAMMSON-214ENST00000641395 1264 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 AC124312.1-201ENST00000551312 1325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 SAGE3P-201ENST00000619800 1635 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 NRXN3-207ENST00000554719 4156 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 ZCCHC2-204ENST00000586834 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 ADA2-201ENST00000262607 3925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 LRRC37A3-203ENST00000339474 2589 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 BBOX1-205ENST00000529202 1725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 PDE4DIP-205ENST00000369354 8262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 ARHGAP21-201ENST00000320481 4343 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 LINC01699-201ENST00000319701 259 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 THEM7P-201ENST00000419556 672 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 AL133465.1-201ENST00000432942 512 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 AL354893.1-201ENST00000433735 348 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 CLNS1AP1-201ENST00000435954 682 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 NDUFB3-204ENST00000454214 547 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 H3F3AP5-201ENST00000475267 429 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 AC078785.1-205ENST00000491578 482 ntTSL 4 BASIC10.26□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 AC139272.1-201ENST00000505516 640 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 AC131392.1-201ENST00000506490 633 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 AC110716.1-201ENST00000506934 607 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 C5orf64-204ENST00000507461 535 ntTSL 4 BASIC10.26□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 SUMO2P7-201ENST00000511179 285 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 AC112242.1-201ENST00000515805 406 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 IGHV7-34-1-201ENST00000519200 350 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 AC097467.3-216ENST00000599555 1293 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 LINC02495-203ENST00000636704 242 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 CSDE1-201ENST00000261443 3228 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 SECISBP2L-201ENST00000261847 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 RNASE9-209ENST00000557068 2703 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 IL31RA-201ENST00000297015 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 ZNF211-205ENST00000391703 2239 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 SLC10A7-204ENST00000502607 1638 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 RANBP3L-204ENST00000515759 1532 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 SPARCL1-205ENST00000503414 2520 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 MELK-207ENST00000536860 2342 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 GOLT1B-201ENST00000229314 3227 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 OR51J1-201ENST00000332043 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 EEF1AKMT1-201ENST00000382754 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 GGA1-205ENST00000405147 575 ntTSL 4 BASIC10.25□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 BMP6P1-201ENST00000431230 679 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 AP006216.1-201ENST00000439104 419 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 AL354989.1-201ENST00000448245 635 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 SNORA74.1-201ENST00000516320 180 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 AL121579.2-201ENST00000555466 590 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 OR7A11P-201ENST00000597719 953 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 AC011443.1-201ENST00000599484 365 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 AC073046.2-201ENST00000604756 527 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 IGKV2OR2-1-201ENST00000605129 304 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 SMAGP-208ENST00000605627 577 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 OR56B1-201ENST00000317121 2075 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 PEX13-201ENST00000295030 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 NOS1-206ENST00000618760 12283 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 OR5M2P-202ENST00000641241 4242 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 GOLGA6L6-201ENST00000619213 4013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 BICC1-202ENST00000373886 5475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 AP005131.1-201ENST00000585366 4745 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 MRE11-201ENST00000323929 6897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 AL133243.4-201ENST00000623116 3109 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 RASGEF1B-214ENST00000638048 2386 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 AC062022.1-201ENST00000451026 1684 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 CLTC-210ENST00000579456 2301 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
VPS8Q8N3P4 IPO5-222ENST00000490680 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
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