Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 RGS6-204ENST00000404301 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 RGS6-206ENST00000407322 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 SPARCL1-205ENST00000503414 2520 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 KCNMB2-204ENST00000432997 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 TBX5-AS1-201ENST00000528549 3620 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 C14orf2-203ENST00000553430 1659 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 LINC02208-201ENST00000506769 2803 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 HEATR1-202ENST00000366581 6538 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 AP003119.3-201ENST00000566747 4192 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 NOS1-206ENST00000618760 12283 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 AC027279.4-201ENST00000624371 2072 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 CPM-202ENST00000546373 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 IFT74-204ENST00000443698 2163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 CA5B-201ENST00000318636 6835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 CACNA1D-224ENST00000637424 6856 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 HDAC9-218ENST00000456174 2307 ntTSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 FGF9-201ENST00000382353 4220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 MAPK10-392ENST00000642103 3126 ntAPPRIS P2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 ZNF718-201ENST00000510175 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 CPSF4L-201ENST00000344935 647 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-694P-201ENST00000364071 147 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 PPCS-201ENST00000372556 984 ntTSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 PPCS-204ENST00000372562 966 ntTSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 TXNDC8-203ENST00000374511 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 RFPL3S-201ENST00000382084 1117 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 RN7SKP273-201ENST00000411392 314 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 GACAT1-201ENST00000419650 577 ntTSL 4 BASIC9.44□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 MTND1P32-201ENST00000433043 938 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 LINC01918-202ENST00000438148 415 ntTSL 3 BASIC9.44□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 AL450003.1-201ENST00000439447 455 ntTSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 GSAP-208ENST00000441833 737 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 SEPT14P24-201ENST00000447236 180 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 AL034380.1-201ENST00000448791 306 ntTSL 3 BASIC9.44□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 MTAPP1-201ENST00000489154 819 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 RPS27AP16-201ENST00000492222 470 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 RN7SL569P-201ENST00000494652 288 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 LINC02462-201ENST00000503009 430 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 AC104137.1-201ENST00000503625 385 ntTSL 3 BASIC9.44□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 OR7E129P-201ENST00000504655 968 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 AK4P6-201ENST00000505168 528 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 AC084871.1-201ENST00000508020 628 ntTSL 3 BASIC9.44□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 ENPP7P3-201ENST00000509123 241 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 GNGT2-205ENST00000511673 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 AC104123.1-202ENST00000511775 581 ntTSL 4 BASIC9.44□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 AC112192.1-201ENST00000515086 553 ntTSL 4 BASIC9.44□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-319P-201ENST00000516025 108 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 RNA5SP303-201ENST00000516192 130 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 IGHVII-22-1-201ENST00000517888 265 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 AC003991.2-201ENST00000520993 576 ntTSL 4 BASIC9.44□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 AC008708.2-201ENST00000522956 1124 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 AP005597.3-201ENST00000532369 799 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 AC025419.1-203ENST00000540652 726 ntTSL 3 BASIC9.44□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 AL590560.1-203ENST00000544342 408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 ELOCP32-201ENST00000548625 324 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 AC079313.2-202ENST00000552053 511 ntTSL 3 BASIC9.44□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 AC015722.1-201ENST00000557499 385 ntTSL 3 BASIC9.44□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 AC024270.1-201ENST00000559181 404 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 AL157402.2-201ENST00000566394 416 ntTSL 3 BASIC9.44□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 LINC01633-201ENST00000566476 1091 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 AC007221.1-201ENST00000570038 796 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 AC074051.3-201ENST00000570238 358 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 MIR3689C-201ENST00000581239 72 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 NDUFV2-AS1-202ENST00000583081 399 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 RPL10P15-201ENST00000585756 315 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 AC015911.3-201ENST00000592908 849 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 AC073137.1-201ENST00000605636 634 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 AL590705.1-201ENST00000607322 484 ntTSL 4 BASIC9.44□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 AF250324.2-201ENST00000608299 610 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 AC018926.2-201ENST00000611214 498 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 pRNA.12-201ENST00000614353 90 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 pRNA.3-201ENST00000615048 90 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 Metazoa_SRP.115-201ENST00000619303 284 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 AL589666.2-201ENST00000624603 618 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 VIPR1-AS1-221ENST00000626992 602 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 AL583852.1-201ENST00000635018 572 ntTSL 4 BASIC9.44□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 MIR3191-201ENST00000636300 76 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 AC244258.1-201ENST00000637553 1071 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 AC068137.3-201ENST00000639191 341 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 STRADA-246ENST00000640397 1045 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 AC073869.6-201ENST00000640656 341 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 LINC00690-201ENST00000429949 1365 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 GIMAP2-201ENST00000223293 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 RN7SKP23-201ENST00000625159 4301 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 ANGPT1-206ENST00000520734 1526 ntTSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 ITM2A-202ENST00000434584 1698 ntTSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 DLG2-203ENST00000376104 5139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 KIT-201ENST00000288135 5186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 PKIA-201ENST00000352966 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 XRCC6P2-201ENST00000457831 1822 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 ZNF655-222ENST00000493277 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 AMBN-203ENST00000613447 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 AL513318.2-201ENST00000602579 2012 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 PSG9-209ENST00000621109 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 FCGR3A-201ENST00000367967 2086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.44□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 SLC35A3-207ENST00000533028 14759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 MAPK10-281ENST00000641170 3070 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 AC109361.1-201ENST00000513220 3526 ntTSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 PTPN3-203ENST00000412145 8765 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 ATP2B4-204ENST00000367218 8918 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
CSPP1Q1MSJ5 BUB3-203ENST00000368865 7828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.1 ms