Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 LINC01646-202ENST00000634256 1107 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PDK4Q16654 OR5P3-202ENST00000641167 1193 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PDK4Q16654 ZCCHC6-206ENST00000375963 5379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PDK4Q16654 KAT14-202ENST00000435364 3618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PDK4Q16654 TMEM230-204ENST00000379277 1536 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PDK4Q16654 CEACAM1-203ENST00000352591 3170 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PDK4Q16654 ATMIN-204ENST00000564241 4803 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PDK4Q16654 NUP210L-201ENST00000271854 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PDK4Q16654 ZNF532-214ENST00000589288 5585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PDK4Q16654 CR1-203ENST00000367051 7469 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PDK4Q16654 SBNO1-202ENST00000420886 10981 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PDK4Q16654 USP46-202ENST00000451218 4622 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PDK4Q16654 STAG1-201ENST00000236698 5951 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
PDK4Q16654 ZNF329-204ENST00000598312 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
PDK4Q16654 SYNE2-216ENST00000555002 11532 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
PDK4Q16654 CCDC125-202ENST00000396496 4198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PDK4Q16654 CASC11-201ENST00000502463 3301 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PDK4Q16654 AP002800.1-201ENST00000624982 2225 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PDK4Q16654 TRIM34-204ENST00000514226 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
PDK4Q16654 LRRTM4-205ENST00000409911 2976 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PDK4Q16654 OR7D4-202ENST00000641244 4968 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PDK4Q16654 SSX5-201ENST00000311798 1384 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PDK4Q16654 PAPPA-AS2-201ENST00000438048 1854 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PDK4Q16654 SMC1A-202ENST00000375340 9930 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
PDK4Q16654 OR8B8-202ENST00000642064 3914 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PDK4Q16654 ZNF658B-201ENST00000602828 3408 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PDK4Q16654 OR4K1-201ENST00000285600 1076 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PDK4Q16654 NUDT5-202ENST00000378937 919 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PDK4Q16654 RNA5SP53-201ENST00000391299 120 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PDK4Q16654 NRIR-202ENST00000414795 506 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PDK4Q16654 RPL23AP18-201ENST00000416139 468 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PDK4Q16654 AL031767.1-201ENST00000426374 386 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PDK4Q16654 AC006333.1-204ENST00000429396 648 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PDK4Q16654 SEPT7-AS1-203ENST00000437235 3810 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PDK4Q16654 HGF-206ENST00000444829 1184 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
PDK4Q16654 AP001469.2-201ENST00000444966 390 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PDK4Q16654 AL731661.2-201ENST00000448824 806 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
PDK4Q16654 LINC01795-201ENST00000454367 813 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PDK4Q16654 AC068196.1-201ENST00000456895 833 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PDK4Q16654 AL391863.1-202ENST00000457427 612 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PDK4Q16654 SEC62-AS1-201ENST00000479626 346 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PDK4Q16654 RPL12P7-201ENST00000493832 494 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PDK4Q16654 AC106760.2-201ENST00000504159 619 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PDK4Q16654 AC011410.1-201ENST00000524175 705 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PDK4Q16654 OR52K3P-201ENST00000531655 943 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PDK4Q16654 ONECUT1-202ENST00000560699 996 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PDK4Q16654 AC026458.1-201ENST00000564330 438 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PDK4Q16654 LINC01919-201ENST00000578610 568 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PDK4Q16654 RN7SL697P-201ENST00000582484 299 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PDK4Q16654 AC024451.4-201ENST00000602578 752 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PDK4Q16654 AC007255.2-201ENST00000604053 631 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PDK4Q16654 PCA3_2.1-201ENST00000612507 409 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PDK4Q16654 AP005212.3-201ENST00000619964 528 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PDK4Q16654 AL353747.4-202ENST00000625787 674 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PDK4Q16654 PAICS-201ENST00000264221 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
PDK4Q16654 OR51I2-202ENST00000641930 3302 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PDK4Q16654 CLEC4E-201ENST00000299663 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
PDK4Q16654 CTNNA2-202ENST00000361291 3071 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PDK4Q16654 A1CF-206ENST00000395489 9517 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PDK4Q16654 DPY19L1P1-201ENST00000417811 2594 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PDK4Q16654 ATG12-202ENST00000500945 1430 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
PDK4Q16654 ALG10-201ENST00000266483 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
PDK4Q16654 AC005225.5-201ENST00000623547 2225 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PDK4Q16654 LINC00939-201ENST00000502479 4972 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
PDK4Q16654 ATP5BP1-201ENST00000411980 1574 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PDK4Q16654 MUC4-215ENST00000475231 16273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PDK4Q16654 LINC01440-201ENST00000416190 1340 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PDK4Q16654 AP000547.3-204ENST00000588548 2523 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PDK4Q16654 MR1-209ENST00000617803 7584 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PDK4Q16654 AC005332.9-201ENST00000620266 2921 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PDK4Q16654 PATJ-203ENST00000371158 8505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PDK4Q16654 TPRG1-204ENST00000433971 2296 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PDK4Q16654 EIF4A2-205ENST00000440191 1889 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
PDK4Q16654 AC020658.2-201ENST00000559030 4020 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PDK4Q16654 BRCA1-210ENST00000471181 5936 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
PDK4Q16654 ZBTB8B-201ENST00000609129 12834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PDK4Q16654 ZNF329-203ENST00000597186 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PDK4Q16654 BCO2-214ENST00000532593 1647 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PDK4Q16654 NSD3-206ENST00000527502 4471 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
PDK4Q16654 PIK3C3-202ENST00000398870 9206 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PDK4Q16654 NBEA-207ENST00000537702 4089 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PDK4Q16654 LIMA1-202ENST00000394943 3669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
PDK4Q16654 AP003486.1-201ENST00000525716 3994 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
PDK4Q16654 MECOM-209ENST00000472280 3593 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PDK4Q16654 TSPAN14-207ENST00000429989 16183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
PDK4Q16654 ZNF880-202ENST00000422689 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PDK4Q16654 UQCC1-208ENST00000397554 3638 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PDK4Q16654 SEL1L3-203ENST00000502949 3500 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PDK4Q16654 TTC39B-207ENST00000507993 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PDK4Q16654 OR5AU1-201ENST00000304418 1199 ntAPPRIS P1 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PDK4Q16654 S100A1-202ENST00000368696 522 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
PDK4Q16654 S100A7L2-201ENST00000368725 339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PDK4Q16654 C1orf162-202ENST00000369718 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PDK4Q16654 SNORA70.9-201ENST00000384370 135 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
PDK4Q16654 NPM1P31-201ENST00000399021 764 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
PDK4Q16654 AP001468.1-201ENST00000415026 557 ntTSL 4 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PDK4Q16654 AC007568.1-201ENST00000422912 471 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
PDK4Q16654 AL139415.1-201ENST00000424862 352 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
PDK4Q16654 EIF4A1P5-201ENST00000428062 1095 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
PDK4Q16654 RPL14P5-201ENST00000436474 730 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
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