Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 FBXW10-202ENST00000308799 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
TCOF1Q13428 AL031985.1-201ENST00000392713 418 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
TCOF1Q13428 MIR937-201ENST00000401271 86 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
TCOF1Q13428 RNU4ATAC2P-201ENST00000408674 126 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
TCOF1Q13428 AL713922.1-201ENST00000416477 747 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
TCOF1Q13428 BX510359.3-201ENST00000422168 306 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
TCOF1Q13428 MAGI2-AS3-210ENST00000448636 798 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
TCOF1Q13428 LINC01789-202ENST00000455614 491 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
TCOF1Q13428 MLF1-205ENST00000469452 1098 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
TCOF1Q13428 RN7SL561P-201ENST00000488553 281 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
TCOF1Q13428 GM2AP2-201ENST00000491764 562 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
TCOF1Q13428 ODF1-202ENST00000518835 368 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
TCOF1Q13428 AP002954.1-201ENST00000526274 425 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
TCOF1Q13428 AC145285.4-201ENST00000568183 540 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
TCOF1Q13428 BUB1P1-201ENST00000603541 607 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
TCOF1Q13428 AL357140.4-201ENST00000636827 412 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
TCOF1Q13428 AC079776.5-201ENST00000641920 211 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
TCOF1Q13428 AC011455.2-201ENST00000599320 3336 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
TCOF1Q13428 FAM13A-218ENST00000511976 3579 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
TCOF1Q13428 DCSTAMP-201ENST00000297581 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
TCOF1Q13428 ARHGEF38-201ENST00000265154 1437 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
TCOF1Q13428 WDR48-201ENST00000302313 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
TCOF1Q13428 SP140-205ENST00000420434 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
TCOF1Q13428 ZNF559-212ENST00000592896 1488 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
TCOF1Q13428 FBXO43-201ENST00000428847 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
TCOF1Q13428 AL160408.3-201ENST00000442382 3564 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
TCOF1Q13428 C14orf37-201ENST00000267485 6495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
TCOF1Q13428 ZNF37BP-202ENST00000452075 8637 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
TCOF1Q13428 SGMS1-AS1-201ENST00000443374 12400 ntTSL 4 BASIC9.93□□□□□ -0.82
TCOF1Q13428 LPIN1-202ENST00000396097 5690 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
TCOF1Q13428 AC125603.4-201ENST00000621942 2699 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
TCOF1Q13428 TAF13-201ENST00000338366 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
TCOF1Q13428 AL512622.1-201ENST00000414106 481 ntTSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
TCOF1Q13428 AC096639.1-201ENST00000456240 347 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
TCOF1Q13428 AC124945.1-201ENST00000485133 188 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
TCOF1Q13428 AC027309.1-201ENST00000519976 528 ntTSL 4 BASIC9.93□□□□□ -0.82
TCOF1Q13428 ASB8-203ENST00000535988 679 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
TCOF1Q13428 AC092375.1-201ENST00000550410 637 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
TCOF1Q13428 AC020978.2-201ENST00000563203 428 ntTSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
TCOF1Q13428 AC008521.2-201ENST00000591021 259 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
TCOF1Q13428 MEGF10-201ENST00000274473 7594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
TCOF1Q13428 ADGRG7-201ENST00000273352 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
TCOF1Q13428 SYNJ1-201ENST00000357345 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
TCOF1Q13428 ARMCX3-207ENST00000537169 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
TCOF1Q13428 DNAJC5G-203ENST00000404433 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
TCOF1Q13428 CDC40-203ENST00000368932 3933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
TCOF1Q13428 EIF2A-202ENST00000406576 1795 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
TCOF1Q13428 ATXN1-201ENST00000244769 10602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
TCOF1Q13428 ETS1-202ENST00000392668 5139 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
TCOF1Q13428 GUCY2C-201ENST00000261170 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
TCOF1Q13428 ZNF675-201ENST00000359788 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
TCOF1Q13428 NOX1-202ENST00000372960 2418 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
TCOF1Q13428 SLCO1C1-207ENST00000540354 2529 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
TCOF1Q13428 KLHL32-207ENST00000620278 2642 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
TCOF1Q13428 FASLG-201ENST00000340030 917 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
TCOF1Q13428 LYPLA1P3-201ENST00000402650 695 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
TCOF1Q13428 AL049697.3-201ENST00000406493 982 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
TCOF1Q13428 HMGN1P20-201ENST00000411849 300 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
TCOF1Q13428 AC009518.1-202ENST00000415393 1229 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
TCOF1Q13428 VDAC1P2-201ENST00000423609 850 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
TCOF1Q13428 TVP23CP1-201ENST00000450317 639 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
TCOF1Q13428 GRIK1-AS1-205ENST00000455392 767 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
TCOF1Q13428 VPS25P1-201ENST00000455691 508 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
TCOF1Q13428 AC005699.1-204ENST00000509244 747 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
TCOF1Q13428 AC083906.1-201ENST00000509298 406 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
TCOF1Q13428 AC079209.1-202ENST00000521953 522 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
TCOF1Q13428 TRIM77BP-201ENST00000524985 1119 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
TCOF1Q13428 AC104151.1-201ENST00000563764 323 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
TCOF1Q13428 AC012358.3-204ENST00000599475 978 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
TCOF1Q13428 AC097467.3-216ENST00000599555 1293 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
TCOF1Q13428 AL049840.5-201ENST00000602827 552 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
TCOF1Q13428 FAM72A-208ENST00000607379 1139 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
TCOF1Q13428 TSHZ2-205ENST00000626626 670 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
TCOF1Q13428 LINC02495-203ENST00000636704 242 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
TCOF1Q13428 ZMYND11-209ENST00000402736 3950 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
TCOF1Q13428 TTTY4B-201ENST00000420149 1346 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
TCOF1Q13428 TTTY4-201ENST00000436568 1346 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
TCOF1Q13428 TTTY4C-201ENST00000456123 1346 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
TCOF1Q13428 SMG1-201ENST00000330588 1588 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
TCOF1Q13428 FAM71F1-207ENST00000485070 1574 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
TCOF1Q13428 MGAT4A-202ENST00000393487 8382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
TCOF1Q13428 CACNB4-254ENST00000637514 1880 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
TCOF1Q13428 UTY-210ENST00000538878 6574 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
TCOF1Q13428 AC106038.1-201ENST00000501194 3473 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
TCOF1Q13428 ACSL1-212ENST00000622937 4103 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
TCOF1Q13428 PLXDC2-203ENST00000377252 12468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
TCOF1Q13428 MED12-201ENST00000333646 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
TCOF1Q13428 CEBPZ-201ENST00000234170 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
TCOF1Q13428 AC107884.1-202ENST00000622955 2703 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
TCOF1Q13428 B3GNT2-202ENST00000405767 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
TCOF1Q13428 DUXAP8-203ENST00000437781 2398 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
TCOF1Q13428 LINC01822-201ENST00000435682 2098 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
TCOF1Q13428 CSNK1A1-204ENST00000504676 1772 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
TCOF1Q13428 HMBOX1-206ENST00000519047 1551 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
TCOF1Q13428 DMBT1-203ENST00000344338 7656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
TCOF1Q13428 DMBT1-205ENST00000368955 7656 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
TCOF1Q13428 OR4F17-201ENST00000318050 1054 ntAPPRIS P1 BASIC9.91□□□□□ -0.82
TCOF1Q13428 OR4F4-201ENST00000326183 1054 ntAPPRIS P1 BASIC9.91□□□□□ -0.82
TCOF1Q13428 OSTCP4-201ENST00000424397 449 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
TCOF1Q13428 GTF3AP6-201ENST00000432585 986 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92 ms