Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC3

RAB23, Ras-related protein Rab-23, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB23Q9ULC3 LINC01811-201ENST00000415991 594 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
RAB23Q9ULC3 LIX1L-AS1-203ENST00000421764 287 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
RAB23Q9ULC3 PSMD10P2-201ENST00000432890 672 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
RAB23Q9ULC3 AL358074.1-201ENST00000444800 509 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
RAB23Q9ULC3 DPP10-AS1-202ENST00000448663 644 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
RAB23Q9ULC3 AC093627.1-201ENST00000465755 877 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
RAB23Q9ULC3 DPH5-211ENST00000488176 1034 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
RAB23Q9ULC3 AC096736.3-201ENST00000510753 993 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
RAB23Q9ULC3 OLR1-209ENST00000543993 822 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
RAB23Q9ULC3 AC137800.1-201ENST00000562976 573 ntTSL 4 BASIC7.05□□□□□ -1.28
RAB23Q9ULC3 AC015853.3-201ENST00000570974 478 ntTSL 4 BASIC7.05□□□□□ -1.28
RAB23Q9ULC3 AC010519.1-201ENST00000599924 344 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
RAB23Q9ULC3 HNF4A-AS1-202ENST00000609152 413 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
RAB23Q9ULC3 AC005514.1-201ENST00000623521 208 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
RAB23Q9ULC3 LINC01173-201ENST00000629370 331 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
RAB23Q9ULC3 SCN2A-215ENST00000637266 8610 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
RAB23Q9ULC3 AC244502.1-201ENST00000514473 1951 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
RAB23Q9ULC3 LINC00598-215ENST00000638084 1974 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
RAB23Q9ULC3 MAPK10-242ENST00000639242 3088 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
RAB23Q9ULC3 AC020743.2-201ENST00000639870 1370 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
RAB23Q9ULC3 ARPP21-220ENST00000441454 2880 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
RAB23Q9ULC3 ZNF780A-203ENST00000450241 7500 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
RAB23Q9ULC3 MFSD8-217ENST00000641178 4374 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
RAB23Q9ULC3 THAP9-201ENST00000302236 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
RAB23Q9ULC3 PPWD1-201ENST00000261308 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
RAB23Q9ULC3 PPWD1-214ENST00000535264 2195 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
RAB23Q9ULC3 HABP2-203ENST00000542051 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
RAB23Q9ULC3 DICER1-201ENST00000343455 10277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
RAB23Q9ULC3 UBE2V1-201ENST00000340309 2536 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
RAB23Q9ULC3 ADH7-202ENST00000437033 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
RAB23Q9ULC3 AIMP1-203ENST00000442366 2519 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
RAB23Q9ULC3 RGS7-201ENST00000348120 1980 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
RAB23Q9ULC3 FAM49B-226ENST00000523509 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
RAB23Q9ULC3 NLRP13-202ENST00000588751 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
RAB23Q9ULC3 PPP4R3CP-201ENST00000412172 3131 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
RAB23Q9ULC3 SETDB1-201ENST00000271640 4437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
RAB23Q9ULC3 CTNND1-218ENST00000528232 5745 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
RAB23Q9ULC3 GPATCH2L-201ENST00000261530 14007 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
RAB23Q9ULC3 SCARB2-207ENST00000638295 4507 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
RAB23Q9ULC3 ZNF793-207ENST00000587986 3869 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
RAB23Q9ULC3 EIF3L-203ENST00000412331 3220 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
RAB23Q9ULC3 OR2T33-202ENST00000641220 4118 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
RAB23Q9ULC3 AC006116.1-201ENST00000587908 2171 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
RAB23Q9ULC3 OR51L1-201ENST00000321543 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
RAB23Q9ULC3 CASP10-206ENST00000374650 1126 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
RAB23Q9ULC3 OR5D16-201ENST00000378396 987 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
RAB23Q9ULC3 LARP1P1-201ENST00000407692 292 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
RAB23Q9ULC3 NAP1L4P2-201ENST00000425958 899 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
RAB23Q9ULC3 AC115283.1-201ENST00000427353 400 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
RAB23Q9ULC3 KCND3-AS1-202ENST00000427471 583 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
RAB23Q9ULC3 AC011752.1-201ENST00000451476 494 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
RAB23Q9ULC3 AC234771.3-201ENST00000454984 622 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
RAB23Q9ULC3 AC021006.1-201ENST00000489849 553 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
RAB23Q9ULC3 SCARNA6-201ENST00000515982 265 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
RAB23Q9ULC3 AC027117.1-201ENST00000520646 667 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
RAB23Q9ULC3 AC078922.1-201ENST00000547547 434 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
RAB23Q9ULC3 AC004551.1-201ENST00000552784 575 ntTSL 4 BASIC7.04□□□□□ -1.28
RAB23Q9ULC3 AC026770.1-201ENST00000558994 581 ntTSL 4 BASIC7.04□□□□□ -1.28
RAB23Q9ULC3 AC007614.3-201ENST00000564875 654 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
RAB23Q9ULC3 PPIAL4A-201ENST00000577856 660 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
RAB23Q9ULC3 RPL17-208ENST00000580261 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
RAB23Q9ULC3 AC243756.1-201ENST00000584068 660 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
RAB23Q9ULC3 DYNLL1P1-201ENST00000595442 269 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
RAB23Q9ULC3 MIR6862-1-201ENST00000613016 70 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
RAB23Q9ULC3 MIR6862-2-201ENST00000614755 70 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
RAB23Q9ULC3 LINC00969-332ENST00000630874 738 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
RAB23Q9ULC3 AC027559.1-201ENST00000636288 271 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
RAB23Q9ULC3 TXNIP-204ENST00000582401 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
RAB23Q9ULC3 AL049647.1-201ENST00000319682 1789 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
RAB23Q9ULC3 EIF2A-202ENST00000406576 1795 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
RAB23Q9ULC3 MYO3B-203ENST00000409044 5448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
RAB23Q9ULC3 C18orf54-206ENST00000620105 5693 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
RAB23Q9ULC3 SORBS1-202ENST00000306402 5858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
RAB23Q9ULC3 OR2AH1P-202ENST00000641232 2744 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
RAB23Q9ULC3 TMEM132B-201ENST00000299308 10906 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
RAB23Q9ULC3 AC110716.2-201ENST00000563865 3945 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
RAB23Q9ULC3 SLC1A2-202ENST00000395750 11538 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
RAB23Q9ULC3 PAIP1-202ENST00000338972 1814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
RAB23Q9ULC3 NBPF26-204ENST00000615145 2656 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
RAB23Q9ULC3 ODF2L-202ENST00000317336 4376 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
RAB23Q9ULC3 BLNK-203ENST00000413476 1599 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
RAB23Q9ULC3 LINC01205-201ENST00000489670 1331 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
RAB23Q9ULC3 SPRY3-201ENST00000302805 9019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
RAB23Q9ULC3 EPG5-201ENST00000282041 12633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
RAB23Q9ULC3 SORCS1-210ENST00000622431 6701 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
RAB23Q9ULC3 CNTN3-201ENST00000263665 4948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
RAB23Q9ULC3 AL022068.1-201ENST00000636202 1875 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
RAB23Q9ULC3 ADGRB3-201ENST00000238918 2927 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
RAB23Q9ULC3 AL357153.1-201ENST00000500016 2941 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
RAB23Q9ULC3 ARHGAP42P4-201ENST00000549782 2934 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
RAB23Q9ULC3 RORA-203ENST00000335670 10844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
RAB23Q9ULC3 SPRY1-201ENST00000339241 2348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
RAB23Q9ULC3 CASP10-208ENST00000448480 1603 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
RAB23Q9ULC3 RNA5SP433-201ENST00000364491 114 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
RAB23Q9ULC3 RGS5-202ENST00000367903 934 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
RAB23Q9ULC3 IGLV5-52-201ENST00000390289 379 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
RAB23Q9ULC3 KRTAP3-1-201ENST00000391588 594 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
RAB23Q9ULC3 AL359715.1-201ENST00000404330 555 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
RAB23Q9ULC3 VNN3-205ENST00000417437 1117 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
RAB23Q9ULC3 RHEBP1-201ENST00000448647 556 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.8 ms