Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 CCDC77-210ENST00000540180 1652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SGCZQ96LD1 GRIA4-212ENST00000530497 5059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
SGCZQ96LD1 AP2B1-217ENST00000618940 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
SGCZQ96LD1 PSMD5-AS1-213ENST00000640327 3531 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
SGCZQ96LD1 MDM4-204ENST00000367183 9098 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
SGCZQ96LD1 DYDC2-201ENST00000256039 1842 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SGCZQ96LD1 DCX-203ENST00000371993 9231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SGCZQ96LD1 LINC01492-201ENST00000411575 3738 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
SGCZQ96LD1 NME8-203ENST00000440017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
SGCZQ96LD1 ZMYND11-204ENST00000381604 4066 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SGCZQ96LD1 GFPT1-202ENST00000361060 8632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
SGCZQ96LD1 ABL2-201ENST00000344730 6910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
SGCZQ96LD1 SP110-203ENST00000358662 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
SGCZQ96LD1 AC023818.2-201ENST00000623817 2304 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SGCZQ96LD1 KLHL4-201ENST00000373114 2445 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
SGCZQ96LD1 MPP7-201ENST00000337532 5080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SGCZQ96LD1 ARHGAP42P4-201ENST00000549782 2934 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SGCZQ96LD1 MAPK10-207ENST00000395166 3085 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SGCZQ96LD1 CEP41-213ENST00000489512 3161 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SGCZQ96LD1 PDZK1P1-201ENST00000401008 3498 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SGCZQ96LD1 TMEM132B-201ENST00000299308 10906 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SGCZQ96LD1 KIDINS220-201ENST00000256707 7361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SGCZQ96LD1 SYNPO2-202ENST00000429713 9920 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SGCZQ96LD1 FANCL-201ENST00000233741 1683 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SGCZQ96LD1 ATP6V1G3-201ENST00000281087 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SGCZQ96LD1 DEFB4A-201ENST00000302247 380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SGCZQ96LD1 ATP6V1G3-202ENST00000309309 678 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SGCZQ96LD1 VEPH1-201ENST00000362010 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SGCZQ96LD1 DNAJC6-203ENST00000395325 5743 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SGCZQ96LD1 FANCL-202ENST00000402135 1698 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SGCZQ96LD1 RN7SKP85-201ENST00000411349 318 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SGCZQ96LD1 AC007349.3-201ENST00000415356 872 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SGCZQ96LD1 IL5RA-204ENST00000418488 5521 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SGCZQ96LD1 AL451047.1-201ENST00000424451 814 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SGCZQ96LD1 AL031428.1-201ENST00000427154 666 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SGCZQ96LD1 IFT74-202ENST00000429045 1462 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SGCZQ96LD1 G6PC2-204ENST00000429379 645 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SGCZQ96LD1 AC007563.3-201ENST00000433233 371 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SGCZQ96LD1 AC104698.1-201ENST00000435671 276 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SGCZQ96LD1 ARPP21-217ENST00000436702 561 ntTSL 4 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SGCZQ96LD1 AC114755.4-201ENST00000439114 443 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SGCZQ96LD1 AL359313.1-201ENST00000447311 2293 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SGCZQ96LD1 CYCSP44-201ENST00000448560 313 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SGCZQ96LD1 BX284613.1-201ENST00000452221 1641 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SGCZQ96LD1 PSPC1P2-201ENST00000455130 225 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SGCZQ96LD1 RPSAP7-201ENST00000456871 885 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SGCZQ96LD1 EZH2-203ENST00000460911 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SGCZQ96LD1 PABPC1P10-201ENST00000464731 381 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SGCZQ96LD1 AC008967.1-201ENST00000504843 163 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SGCZQ96LD1 LINC02236-201ENST00000508881 552 ntTSL 4 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SGCZQ96LD1 AC239584.1-201ENST00000510419 732 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SGCZQ96LD1 RPS23-208ENST00000512493 443 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SGCZQ96LD1 UGT2B24P-201ENST00000514441 1597 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SGCZQ96LD1 AC005699.1-203ENST00000515286 688 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SGCZQ96LD1 AC113423.2-201ENST00000517582 545 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SGCZQ96LD1 IGHVIII-26-1-201ENST00000520387 250 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SGCZQ96LD1 C11orf65-206ENST00000529391 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SGCZQ96LD1 AC023080.1-201ENST00000551663 931 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SGCZQ96LD1 CKS1BP1-201ENST00000555221 240 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SGCZQ96LD1 AC090971.3-201ENST00000557871 1041 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SGCZQ96LD1 HNRNPA1P71-201ENST00000559135 950 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SGCZQ96LD1 AC027176.2-201ENST00000559166 746 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SGCZQ96LD1 LYRM1-208ENST00000567954 460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SGCZQ96LD1 HACD3-211ENST00000569894 1471 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SGCZQ96LD1 PDE6G-203ENST00000571224 526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SGCZQ96LD1 AC087301.1-201ENST00000579037 321 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SGCZQ96LD1 AP001496.3-201ENST00000580230 913 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SGCZQ96LD1 AC015801.1-201ENST00000585651 153 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SGCZQ96LD1 ZNF525-206ENST00000593918 590 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SGCZQ96LD1 AC092960.1-201ENST00000604762 351 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SGCZQ96LD1 Metazoa_SRP.195-201ENST00000612667 287 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SGCZQ96LD1 AL512506.1-201ENST00000613918 449 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SGCZQ96LD1 EAPP-205ENST00000618169 1237 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SGCZQ96LD1 AL512624.2-201ENST00000621705 2566 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SGCZQ96LD1 ZRANB2-AS2-220ENST00000623721 1133 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SGCZQ96LD1 AC020978.9-201ENST00000624380 1141 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SGCZQ96LD1 AC021766.1-201ENST00000624404 741 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SGCZQ96LD1 AL009031.1-201ENST00000632346 1026 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SGCZQ96LD1 AC087565.2-201ENST00000637695 952 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SGCZQ96LD1 MKL2-201ENST00000318282 8608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SGCZQ96LD1 GRIK2-206ENST00000413795 4876 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SGCZQ96LD1 ADGRL3-207ENST00000507625 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SGCZQ96LD1 GPRIN3-202ENST00000609438 14244 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SGCZQ96LD1 HLF-210ENST00000575345 3589 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SGCZQ96LD1 TTLL5-207ENST00000554510 2624 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SGCZQ96LD1 KIAA0040-202ENST00000444639 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
SGCZQ96LD1 IPCEF1-201ENST00000265198 6689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
SGCZQ96LD1 ATOX1-203ENST00000521264 4341 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SGCZQ96LD1 CSDE1-218ENST00000610726 4312 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SGCZQ96LD1 NEMP2-202ENST00000409150 6168 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SGCZQ96LD1 KIAA0391-201ENST00000250377 6118 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SGCZQ96LD1 NLRC4-204ENST00000404025 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SGCZQ96LD1 AC008505.1-203ENST00000637345 1766 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SGCZQ96LD1 TDRKH-201ENST00000368822 3093 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SGCZQ96LD1 FCHSD2-203ENST00000409314 4509 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SGCZQ96LD1 OR2T35-202ENST00000641268 2957 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SGCZQ96LD1 NPIPB15-201ENST00000429990 1428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SGCZQ96LD1 MGC32805-205ENST00000510972 1424 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
SGCZQ96LD1 AP004243.1-201ENST00000529108 1433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SGCZQ96LD1 PSG9-206ENST00000593948 1429 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.1 ms