Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 AC226101.1-201ENST00000401483 387 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 CYCSP17-201ENST00000407870 315 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 AL713923.1-201ENST00000414071 378 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 VNN3-205ENST00000417437 1117 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 AP001628.1-201ENST00000431150 285 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 CR391992.1-201ENST00000438601 394 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 AL139135.2-201ENST00000445040 433 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 AC013727.1-202ENST00000455716 580 ntTSL 4 BASIC5.54□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 NMNAT1P3-201ENST00000457517 888 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 RN7SL216P-201ENST00000471607 298 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 SSR1-206ENST00000479365 1118 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 GLYCTK-AS1-203ENST00000493616 445 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 RN7SL187P-201ENST00000495587 303 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 AC113383.1-205ENST00000502253 792 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 AC087752.2-201ENST00000521219 281 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 AC103718.1-201ENST00000522667 683 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 AC026979.2-201ENST00000523733 583 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 AC068205.2-201ENST00000532864 771 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 AC078950.1-201ENST00000538349 550 ntTSL 4 BASIC5.54□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 PCED1B-AS1-202ENST00000547600 523 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 PCED1B-AS1-207ENST00000551432 522 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 PSMA6-204ENST00000553809 879 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 PSMA6-214ENST00000556506 763 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 FRG2IP-201ENST00000563581 781 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 AC018558.5-201ENST00000565840 952 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 AC020914.7-201ENST00000594477 545 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 GBA3-207ENST00000613293 1233 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 AC073263.3-201ENST00000624449 858 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 LINC01141-204ENST00000635564 1008 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 AC104461.1-201ENST00000637430 817 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 TRMT10A-202ENST00000394876 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 C2CD6-203ENST00000439802 1639 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 MAPK10-357ENST00000641831 2858 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 AL357568.1-201ENST00000421530 1963 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 ANKRD31-203ENST00000506364 6207 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 PPHLN1-207ENST00000432191 3377 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 PRLR-216ENST00000542609 1764 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 ATP5BP1-201ENST00000411980 1574 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 AC005034.3-201ENST00000604845 1747 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 IGF2BP3-201ENST00000258729 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 ABCB11-201ENST00000263817 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 LINC01793-201ENST00000409590 2036 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 TMED2-203ENST00000509052 1975 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 MRPS27-201ENST00000261413 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 KLHL28-202ENST00000396128 6545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 NFIA-201ENST00000357977 3200 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 THOC2-220ENST00000618150 3211 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 PIGN-220ENST00000638167 4195 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 FGF13-201ENST00000305414 1939 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 ESRRG-206ENST00000366938 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
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RTL8BQ17RB0 S100A1-202ENST00000368696 522 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 AL359922.1-201ENST00000404796 935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
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RTL8BQ17RB0 AC118754.1-201ENST00000416958 370 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
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RTL8BQ17RB0 AC096677.2-201ENST00000430471 598 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 AC245452.2-201ENST00000435222 392 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 ZNF138-205ENST00000440155 1066 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
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RTL8BQ17RB0 AL136528.1-201ENST00000443034 754 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 AC092421.1-201ENST00000448148 418 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 GOT2P2-201ENST00000450663 1251 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 SRP68P2-201ENST00000456184 254 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 AL135933.1-201ENST00000498657 802 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 RN7SKP242-201ENST00000515967 289 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
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RTL8BQ17RB0 ZNF706-212ENST00000520984 782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 IGHVIII-25-1-201ENST00000522143 241 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
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RTL8BQ17RB0 EIF4A3P1-201ENST00000578499 647 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 AP006587.6-201ENST00000582128 1091 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 Z99289.1-201ENST00000585373 807 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 AC067852.5-201ENST00000589299 310 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 EXOSC3P2-201ENST00000594464 497 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 Metazoa_SRP.57-201ENST00000597717 283 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 AL365259.1-201ENST00000606334 509 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 Z98949.1-217ENST00000609275 994 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 AC004839.1-201ENST00000610269 501 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 GLYATL1-219ENST00000612196 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 EDRF1-AS1-210ENST00000613304 569 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 AC017002.5-201ENST00000630717 871 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 MIR665-201ENST00000635949 72 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 LINC00682-204ENST00000637677 931 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 AC008957.3-201ENST00000624112 2242 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 AC110597.1-201ENST00000562669 3176 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 NUMB-203ENST00000359560 3309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 CDY5P-201ENST00000411487 1580 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 CDY9P-201ENST00000451397 1580 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 SLC26A7-202ENST00000309536 2656 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 CAST-203ENST00000338252 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 AXDND1-214ENST00000617277 3405 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 CD84-208ENST00000534968 7885 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 CTNNA2-202ENST00000361291 3071 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 BTN3A2-203ENST00000396934 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
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