Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 ACTR6P1-201ENST00000514311 1104 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
FAM187BQ17R55 AC010834.1-201ENST00000517998 696 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
FAM187BQ17R55 ZNF706-212ENST00000520984 782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
FAM187BQ17R55 AC022075.2-201ENST00000535911 562 ntTSL 4 BASIC7.41□□□□□ -1.22
FAM187BQ17R55 AC084033.1-201ENST00000550830 633 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
FAM187BQ17R55 AL138974.1-201ENST00000551227 741 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
FAM187BQ17R55 AC103968.1-201ENST00000557841 573 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
FAM187BQ17R55 AC087286.3-201ENST00000561409 953 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
FAM187BQ17R55 AC084782.2-201ENST00000561934 839 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
FAM187BQ17R55 AL390718.1-201ENST00000566904 506 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
FAM187BQ17R55 DSG1-AS1-202ENST00000578477 588 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
FAM187BQ17R55 AC091133.5-201ENST00000603088 301 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
FAM187BQ17R55 OR1N2-202ENST00000616791 993 ntAPPRIS P2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
FAM187BQ17R55 Metazoa_SRP.77-201ENST00000616915 252 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
FAM187BQ17R55 SLC12A6-201ENST00000290209 7286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
FAM187BQ17R55 ERC1-204ENST00000397203 9118 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
FAM187BQ17R55 KIF1B-203ENST00000377083 5885 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
FAM187BQ17R55 GRAMD1B-207ENST00000529750 7723 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
FAM187BQ17R55 AC010132.4-201ENST00000569883 1368 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
FAM187BQ17R55 RASGRP3-203ENST00000407811 4210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
FAM187BQ17R55 FANCD2P2-201ENST00000437591 1400 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
FAM187BQ17R55 CSDE1-218ENST00000610726 4312 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
FAM187BQ17R55 LINC00293-204ENST00000521715 1498 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
FAM187BQ17R55 AC109361.1-201ENST00000513220 3526 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
FAM187BQ17R55 SLC12A1-202ENST00000380993 4707 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
FAM187BQ17R55 MOB4-201ENST00000233892 3785 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
FAM187BQ17R55 YOD1-202ENST00000367084 6291 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
FAM187BQ17R55 AMY1A-201ENST00000370083 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
FAM187BQ17R55 LINC00922-203ENST00000569736 1760 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
FAM187BQ17R55 WNK3-203ENST00000375169 11172 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
FAM187BQ17R55 RPL7L1-201ENST00000304734 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
FAM187BQ17R55 AC244100.2-202ENST00000612584 3878 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
FAM187BQ17R55 DUXAP8-203ENST00000437781 2398 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
FAM187BQ17R55 TRAF5-202ENST00000336184 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
FAM187BQ17R55 LINC02197-201ENST00000502659 2767 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
FAM187BQ17R55 CDH12-208ENST00000522262 3028 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
FAM187BQ17R55 IL1RAP-202ENST00000317757 5413 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
FAM187BQ17R55 ABLIM1-214ENST00000533213 7606 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
FAM187BQ17R55 ZSCAN5A-201ENST00000391713 3562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
FAM187BQ17R55 RNA5SP308-201ENST00000362532 115 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
FAM187BQ17R55 RNA5SP321-201ENST00000362722 111 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
FAM187BQ17R55 RNU1-55P-201ENST00000365510 158 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
FAM187BQ17R55 S100A1-202ENST00000368696 522 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
FAM187BQ17R55 NALCN-202ENST00000376200 1126 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
FAM187BQ17R55 AL663061.1-201ENST00000416625 580 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
FAM187BQ17R55 TRGV5P-201ENST00000419915 354 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
FAM187BQ17R55 OR13C7-201ENST00000424348 959 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
FAM187BQ17R55 AC016766.1-201ENST00000429636 714 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
FAM187BQ17R55 AL139231.1-201ENST00000431001 312 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
FAM187BQ17R55 SNRPBP1-201ENST00000443634 282 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
FAM187BQ17R55 PFN1P11-201ENST00000445829 389 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
FAM187BQ17R55 RPL26P30-201ENST00000453533 435 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
FAM187BQ17R55 RN7SL393P-201ENST00000463588 296 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
FAM187BQ17R55 RN7SL37P-201ENST00000490461 307 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
FAM187BQ17R55 AC021088.1-201ENST00000506519 805 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
FAM187BQ17R55 AC091849.1-201ENST00000509920 121 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
FAM187BQ17R55 AC010634.1-201ENST00000513925 540 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
FAM187BQ17R55 AC011352.2-201ENST00000514574 1016 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
FAM187BQ17R55 LINC01484-201ENST00000517733 555 ntTSL 4 BASIC7.4□□□□□ -1.22
FAM187BQ17R55 AZIN1-AS1-211ENST00000520455 480 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
FAM187BQ17R55 AP001831.1-201ENST00000524610 411 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
FAM187BQ17R55 AL445383.1-201ENST00000554689 874 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
FAM187BQ17R55 AL096869.1-201ENST00000557622 559 ntTSL 4 BASIC7.4□□□□□ -1.22
FAM187BQ17R55 AC007495.2-201ENST00000562822 459 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
FAM187BQ17R55 AC136285.2-201ENST00000562873 378 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
FAM187BQ17R55 LINC01477-201ENST00000566101 1226 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
FAM187BQ17R55 ANP32BP1-202ENST00000568553 737 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
FAM187BQ17R55 NUDT7-206ENST00000568787 678 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
FAM187BQ17R55 MIR3157-201ENST00000578688 85 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
FAM187BQ17R55 AC024267.2-201ENST00000582737 417 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
FAM187BQ17R55 RPL29P33-201ENST00000587474 316 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
FAM187BQ17R55 AC040963.1-201ENST00000591900 564 ntTSL 4 BASIC7.4□□□□□ -1.22
FAM187BQ17R55 ZNF137P-202ENST00000597158 308 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
FAM187BQ17R55 Z98949.1-213ENST00000608921 856 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
FAM187BQ17R55 Z98949.1-217ENST00000609275 994 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
FAM187BQ17R55 PRL-202ENST00000615510 1268 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
FAM187BQ17R55 AC022960.2-201ENST00000616300 666 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
FAM187BQ17R55 Metazoa_SRP.129-201ENST00000619776 251 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
FAM187BQ17R55 MIR6813-201ENST00000621638 56 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
FAM187BQ17R55 OR51B2-201ENST00000624187 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
FAM187BQ17R55 TEX41-255ENST00000626404 610 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
FAM187BQ17R55 CLUHP10-201ENST00000631979 980 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
FAM187BQ17R55 ZNF257-203ENST00000594947 3874 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.4□□□□□ -1.22
FAM187BQ17R55 MYOF-202ENST00000359263 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
FAM187BQ17R55 DTNA-226ENST00000596745 1508 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
FAM187BQ17R55 CABYR-207ENST00000486759 1664 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
FAM187BQ17R55 OR1L8-202ENST00000641027 2024 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.23
FAM187BQ17R55 AC114401.1-201ENST00000484222 2084 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
FAM187BQ17R55 BDNF-AS-201ENST00000499008 2324 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
FAM187BQ17R55 AC022075.1-201ENST00000500682 2830 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
FAM187BQ17R55 LINC01108-201ENST00000427276 3152 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
FAM187BQ17R55 CCDC125-203ENST00000396499 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
FAM187BQ17R55 OR51M1-203ENST00000642046 4092 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.23
FAM187BQ17R55 KIAA1549L-201ENST00000265654 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
FAM187BQ17R55 NFATC3-202ENST00000346183 6040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
FAM187BQ17R55 APOOL-203ENST00000622540 6466 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
FAM187BQ17R55 NEUROD4-201ENST00000242994 3953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
FAM187BQ17R55 CDHR3-201ENST00000317716 3813 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
FAM187BQ17R55 LINC01087-201ENST00000431979 3516 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
FAM187BQ17R55 JAM3-202ENST00000441717 3363 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.9 ms