Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 AC239804.1-201ENST00000466343 869 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
ACADSBP45954 AC129807.1-201ENST00000471614 591 ntTSL 4 BASIC7.19□□□□□ -1.26
ACADSBP45954 AC018639.1-201ENST00000492994 442 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
ACADSBP45954 AC007106.1-201ENST00000509666 600 ntTSL 4 BASIC7.19□□□□□ -1.26
ACADSBP45954 AC099805.1-205ENST00000521794 837 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
ACADSBP45954 AC105430.1-202ENST00000567477 483 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
ACADSBP45954 AL512605.1-201ENST00000588215 1263 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
ACADSBP45954 CSNK1A1-210ENST00000606719 835 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
ACADSBP45954 FP325318.1-201ENST00000616097 1263 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
ACADSBP45954 Metazoa_SRP.96-201ENST00000621315 318 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
ACADSBP45954 AC120057.5-201ENST00000623840 154 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
ACADSBP45954 FGA-201ENST00000302053 3678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
ACADSBP45954 KAT6B-204ENST00000372724 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
ACADSBP45954 AC093829.1-201ENST00000506662 1618 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
ACADSBP45954 MIER3-205ENST00000409421 2152 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
ACADSBP45954 NDUFS1-201ENST00000233190 11819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
ACADSBP45954 LINC00624-201ENST00000619867 3088 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
ACADSBP45954 LARS-212ENST00000510191 3737 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
ACADSBP45954 AC078880.4-201ENST00000617627 1749 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
ACADSBP45954 AC068389.1-202ENST00000526470 3564 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
ACADSBP45954 MEF2C-254ENST00000637732 3347 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
ACADSBP45954 HABP2-201ENST00000351270 3009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
ACADSBP45954 Z97989.1-201ENST00000531702 2421 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
ACADSBP45954 PTPRT-209ENST00000612229 11285 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
ACADSBP45954 HERC4-211ENST00000492996 3385 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
ACADSBP45954 HMGCR-209ENST00000511206 3395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
ACADSBP45954 LRP2BP-203ENST00000510776 3055 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
ACADSBP45954 SRSF11-202ENST00000370950 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
ACADSBP45954 PRUNE1-202ENST00000368934 2214 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
ACADSBP45954 LRBA-201ENST00000357115 9899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
ACADSBP45954 OR4D11-201ENST00000313253 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.18□□□□□ -1.26
ACADSBP45954 RNA5SP152-201ENST00000365184 110 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
ACADSBP45954 PAK3-203ENST00000372007 8940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
ACADSBP45954 LDHAP5-201ENST00000394996 622 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
ACADSBP45954 AL136100.1-201ENST00000407696 330 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
ACADSBP45954 RN7SKP91-201ENST00000410852 288 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
ACADSBP45954 ELMO1-AS1-201ENST00000419535 528 ntTSL 4 BASIC7.18□□□□□ -1.26
ACADSBP45954 AC016745.1-201ENST00000422178 508 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
ACADSBP45954 AC009303.1-201ENST00000426307 352 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
ACADSBP45954 RPS10P21-201ENST00000430654 475 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
ACADSBP45954 BACH1-IT2-201ENST00000436529 806 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
ACADSBP45954 AC068759.1-201ENST00000447709 470 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
ACADSBP45954 AL157896.1-201ENST00000451617 790 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
ACADSBP45954 AC016822.1-201ENST00000457975 439 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
ACADSBP45954 AC093895.1-201ENST00000506480 821 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
ACADSBP45954 OR10J9P-201ENST00000511932 987 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
ACADSBP45954 AP000426.1-201ENST00000518749 361 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
ACADSBP45954 ZNF706-212ENST00000520984 782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
ACADSBP45954 WBP2NL-210ENST00000543212 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
ACADSBP45954 AC092375.1-201ENST00000550410 637 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
ACADSBP45954 LINC02207-201ENST00000554530 1256 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
ACADSBP45954 AC010327.4-201ENST00000585911 857 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
ACADSBP45954 AC010333.3-201ENST00000615100 402 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
ACADSBP45954 AC106782.7-201ENST00000624024 418 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
ACADSBP45954 AC133555.5-201ENST00000624430 418 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
ACADSBP45954 NBPF9-205ENST00000613595 4527 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
ACADSBP45954 ZHX3-205ENST00000432768 3551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
ACADSBP45954 ASNSP6-201ENST00000592770 1618 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
ACADSBP45954 LGI1-219ENST00000636155 1618 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
ACADSBP45954 DEUP1-209ENST00000531792 1656 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
ACADSBP45954 STIL-201ENST00000337817 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
ACADSBP45954 KIF14-202ENST00000614960 6838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
ACADSBP45954 GPCPD1-201ENST00000379019 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
ACADSBP45954 LINC01772-201ENST00000457898 3245 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
ACADSBP45954 AC005839.1-201ENST00000624148 3213 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
ACADSBP45954 ITGA1-201ENST00000282588 10757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
ACADSBP45954 AC010168.2-201ENST00000562691 5428 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
ACADSBP45954 RACGAP1-221ENST00000551016 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
ACADSBP45954 SERPINB11-205ENST00000544088 1846 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
ACADSBP45954 HMGN2P46-204ENST00000409454 1923 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
ACADSBP45954 NXF2B-205ENST00000618881 3193 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
ACADSBP45954 PTK2-228ENST00000521059 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
ACADSBP45954 ACOT13-201ENST00000230048 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
ACADSBP45954 SPATA31B1P-201ENST00000434692 4016 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
ACADSBP45954 RIPOR2-207ENST00000540914 3614 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
ACADSBP45954 CTPS1-201ENST00000372616 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
ACADSBP45954 PIK3CB-201ENST00000289153 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
ACADSBP45954 SPP2-201ENST00000168148 1024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
ACADSBP45954 LACRT-201ENST00000257867 551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
ACADSBP45954 LALBA-201ENST00000301046 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
ACADSBP45954 RNA5SP442-201ENST00000365050 107 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
ACADSBP45954 S100A1-202ENST00000368696 522 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
ACADSBP45954 DEFB132-201ENST00000382376 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
ACADSBP45954 IGKV3-7-201ENST00000390247 445 ntAPPRIS P1 BASIC7.17□□□□□ -1.26
ACADSBP45954 RNA5SP474-201ENST00000391234 90 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
ACADSBP45954 AL079341.1-201ENST00000404701 1207 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
ACADSBP45954 SETP22-201ENST00000412243 957 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
ACADSBP45954 AC010978.1-202ENST00000427050 893 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
ACADSBP45954 ETF1P1-206ENST00000427296 984 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
ACADSBP45954 PAICSP2-201ENST00000429118 1150 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
ACADSBP45954 RPL3P11-201ENST00000434028 1146 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
ACADSBP45954 OSBPL10-AS1-206ENST00000447181 575 ntTSL 4 BASIC7.17□□□□□ -1.26
ACADSBP45954 AC099328.2-201ENST00000465347 455 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
ACADSBP45954 ADAM3A-209ENST00000497806 1245 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
ACADSBP45954 PTTG2-201ENST00000504686 691 ntAPPRIS P1 BASIC7.17□□□□□ -1.26
ACADSBP45954 AC026785.3-201ENST00000511182 285 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
ACADSBP45954 AC017007.1-201ENST00000511960 415 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
ACADSBP45954 AC022509.1-203ENST00000541940 708 ntTSL 4 BASIC7.17□□□□□ -1.26
ACADSBP45954 AC138123.2-201ENST00000550324 579 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
ACADSBP45954 LRFN5-203ENST00000554120 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.6 ms