Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 NUDT6-203ENST00000502270 678 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 INPP4B-206ENST00000506217 673 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 LINC02039-201ENST00000507428 566 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 FGB-207ENST00000509493 1164 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AC113352.1-201ENST00000513196 666 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 LINC02497-201ENST00000515292 507 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 GPX8-208ENST00000515370 1036 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AC112198.4-201ENST00000515450 351 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 CCAR2-208ENST00000521301 337 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 LINC00534-203ENST00000523406 812 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AC012574.1-201ENST00000523874 252 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AP003102.1-201ENST00000525638 661 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AP004833.3-201ENST00000531893 322 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AP003049.2-201ENST00000532992 540 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AC068339.2-201ENST00000534395 618 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AP002991.1-201ENST00000539305 574 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 NR1H4-204ENST00000546380 565 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AL357172.1-201ENST00000556016 593 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AC020891.2-201ENST00000559672 776 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AC104072.1-201ENST00000568817 668 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 TTN-AS1-210ENST00000578746 677 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 ZNF585B-207ENST00000586320 403 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AC012254.4-201ENST00000588843 273 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AC090525.3-201ENST00000605601 189 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AL096855.2-201ENST00000605785 369 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AL080250.1-202ENST00000607221 915 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 PRKCQ-AS1-213ENST00000613985 883 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AC016999.2-201ENST00000614692 556 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AL137078.2-201ENST00000615740 318 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 CKLF-CMTM1-206ENST00000616804 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AC233702.2-201ENST00000618784 583 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AC245041.1-201ENST00000619523 826 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AC245452.5-201ENST00000620649 780 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AL353608.4-201ENST00000624487 1188 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 OR8D2-201ENST00000624618 1051 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 PRKCQ-AS1-218ENST00000624974 1132 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 VIPR1-AS1-221ENST00000626992 602 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AC068631.1-215ENST00000630331 490 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 LINC01359-205ENST00000634604 1050 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 KLF8-206ENST00000640927 1150 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 CASC19-212ENST00000641153 1287 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 CASC19-274ENST00000642018 970 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 FKTN-202ENST00000357998 2404 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 TRPM3-208ENST00000377105 5957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 VPS13B-202ENST00000357162 14019 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 KIAA1257-205ENST00000515659 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 CASC15-207ENST00000607048 1634 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 PALMD-203ENST00000605497 1942 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 ARHGAP12-204ENST00000375250 4914 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 SENP1-201ENST00000448372 4679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 FAM114A2-210ENST00000520313 1394 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AL390726.6-202ENST00000635962 1365 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 MID1-205ENST00000380785 6092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 DCX-203ENST00000371993 9231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 NBPF14-209ENST00000620240 2656 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 FAR2-202ENST00000536681 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 RBM44-206ENST00000611254 1427 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 SPAG9-209ENST00000510283 4949 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 EIF2A-202ENST00000406576 1795 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 ITCH-201ENST00000262650 3089 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 MEF2C-221ENST00000514015 2772 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 RAPGEF6-208ENST00000509018 8357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 PMFBP1-202ENST00000355636 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 LINC01297-204ENST00000621052 4222 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 PPP2R5C-205ENST00000445439 1526 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 MEF2C-254ENST00000637732 3347 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 MFSD8-217ENST00000641178 4374 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 PHLDB2-211ENST00000481953 5474 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 BDNF-212ENST00000525528 4766 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 UBE2V1-202ENST00000371657 1973 ntTSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 NHEJ1-202ENST00000409720 1954 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 KRTAP6-2-201ENST00000334897 313 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 OR13H1-201ENST00000338616 927 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 GAGE2A-201ENST00000362097 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 CENPW-202ENST00000368326 443 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 TERF1P4-201ENST00000399580 1115 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AL096711.1-201ENST00000404780 554 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 U3.34-201ENST00000408198 212 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 RNA5SP498-201ENST00000411342 120 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 UQCRHP2-201ENST00000415651 288 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 FO393419.3-201ENST00000428741 282 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AC006333.1-204ENST00000429396 648 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 MRPL50P1-201ENST00000431951 384 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AJ006995.1-201ENST00000433344 572 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 GAPDHP32-201ENST00000433816 998 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AC092802.3-201ENST00000434207 420 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AC105052.2-201ENST00000434317 794 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AL358972.1-201ENST00000434356 466 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 RPL5P4-201ENST00000434805 886 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 HSD3BP5-201ENST00000434856 1132 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 P2RX6P-201ENST00000439119 468 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 LINC02384-202ENST00000441255 567 ntTSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AC104772.1-201ENST00000444764 862 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AC104457.2-201ENST00000446055 467 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AL136452.1-201ENST00000448495 439 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 RHEBP1-201ENST00000448647 556 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 RPL7P48-201ENST00000461513 746 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 CREM-242ENST00000490511 469 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 RPL5P11-201ENST00000498068 893 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 OR5H3P-201ENST00000502817 919 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.2 ms