Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 NRXN1-211ENST00000406859 2553 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF214-204ENST00000536068 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 RNASE6-201ENST00000304677 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 OR51L1-201ENST00000321543 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 OR2T10-201ENST00000330500 1049 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 RNU11-6P-201ENST00000391127 133 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 AC087276.2-201ENST00000394183 183 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 KCNJ13-202ENST00000409779 1099 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 VN1R51P-201ENST00000411675 945 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 SSR1P2-201ENST00000415208 787 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 RPSAP1-201ENST00000421328 880 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 LMLN-AS1-201ENST00000423460 542 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 LINC01980-202ENST00000425195 491 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 AL136980.1-201ENST00000426764 543 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 AC004039.1-201ENST00000431165 502 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 MRPL50P1-201ENST00000431951 384 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 MED28P4-201ENST00000433137 572 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 AC105052.2-201ENST00000434317 794 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 SUMO2P8-201ENST00000434672 286 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 LINC00533-201ENST00000456103 537 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 AL592464.2-201ENST00000457440 607 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 AC018475.1-201ENST00000478358 465 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 ST20-201ENST00000478497 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 AC110772.1-201ENST00000503037 474 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 AC006487.2-201ENST00000503624 577 ntTSL 4 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 OR7E163P-201ENST00000505943 894 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 IGLV1-62-201ENST00000518003 441 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 VBP1-203ENST00000535916 944 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 EGLN3P1-201ENST00000541727 720 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 RAD51AP1-213ENST00000544927 787 ntTSL 4 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 AC079362.1-202ENST00000547089 278 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 AC084759.1-201ENST00000561168 290 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 C15orf65-201ENST00000569691 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 MIR4685-201ENST00000578185 69 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 AC130324.2-201ENST00000580873 638 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 AC005884.2-201ENST00000593107 247 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF92P2-201ENST00000600543 1059 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 RN7SL778P-201ENST00000607160 297 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 AC097460.3-201ENST00000623099 442 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 AC069542.2-201ENST00000624816 216 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 TSHZ2-205ENST00000626626 670 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 LAMTOR5-AS1-248ENST00000630488 703 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 ATF6-201ENST00000367942 7496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 AC022819.1-201ENST00000563495 3910 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 AL133320.1-201ENST00000621423 2352 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 TPD52-203ENST00000448733 4339 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 HEPH-202ENST00000343002 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 BDNF-209ENST00000420794 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM230-204ENST00000379277 1536 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 RHOJ-201ENST00000316754 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 IL5RA-204ENST00000418488 5521 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 COQ10B-202ENST00000409010 1355 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 GATAD2B-204ENST00000634544 2342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM132B-201ENST00000299308 10906 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 RBM46-201ENST00000281722 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 CORIN-201ENST00000273857 4852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 AHI1-204ENST00000367800 5921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 MAGT1-201ENST00000358075 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 REG1CP-201ENST00000377435 1705 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 AC013562.1-201ENST00000519427 1722 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 CLEC3A-201ENST00000299642 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 AC121758.1-201ENST00000557452 3942 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 PDGFC-203ENST00000502773 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 ACTA2-AS1-201ENST00000437930 2450 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 TFDP2-222ENST00000495310 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF770-201ENST00000356321 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 ATP10D-203ENST00000504445 2550 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 SMC1A-201ENST00000322213 9784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 AC006116.1-201ENST00000587908 2171 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 HIST1H1A-201ENST00000244573 648 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 ADK-201ENST00000286621 1169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 RNU6-618P-201ENST00000363518 112 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 KLRC2-201ENST00000381901 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 KLRC2-202ENST00000381902 1221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 TRAV12-1-201ENST00000390433 340 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 AC017048.1-201ENST00000412153 495 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 GTF2IP5-201ENST00000414608 731 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 AL031005.1-201ENST00000416959 723 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 CLIC4P3-201ENST00000422221 752 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 AL445218.1-202ENST00000427695 845 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 AL512637.2-201ENST00000431287 1256 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 CETN4P-201ENST00000432407 469 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 NIP7P1-201ENST00000433227 512 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 AC019185.3-201ENST00000438805 323 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 LINC00354-202ENST00000440860 376 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 AC115618.2-201ENST00000453810 450 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 AC010976.1-211ENST00000454503 644 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 AL357143.1-201ENST00000457239 934 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 AC009411.2-201ENST00000458359 539 ntTSL 4 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 RPL23P10-201ENST00000468780 412 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 LINC01182-201ENST00000503532 582 ntTSL 4 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 AC010468.3-201ENST00000508225 458 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 AC090458.1-203ENST00000527757 546 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 AC018523.1-201ENST00000534211 512 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 AL139354.1-201ENST00000554319 645 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 YWHAZP1-201ENST00000556286 722 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 AC013283.1-201ENST00000557282 492 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 NR2F2-AS1-205ENST00000559505 1005 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 RPS7P1-201ENST00000571702 585 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PPARGC1AQ9UBK2 MIR4786-201ENST00000583954 80 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
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