Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 ADGRL3-205ENST00000506746 4935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 CEBPZ-201ENST00000234170 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 RNF217-AS1-201ENST00000439075 4507 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 UNC5D-201ENST00000287272 8662 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 OFD1P10Y-201ENST00000434110 1433 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 CREM-218ENST00000460270 1416 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 CCDC93-201ENST00000319432 6896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 CCDC93-202ENST00000376300 6899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 PSG5-202ENST00000366175 1766 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 RAD54B-202ENST00000336148 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 GJC1-202ENST00000426548 7640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 BBOX1-201ENST00000263182 1886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 EVI2A-203ENST00000462804 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 THAP12P1-201ENST00000398672 2203 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 CSNK1G3-210ENST00000521364 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 ST7-213ENST00000432298 1956 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 MBD3L1-201ENST00000305625 748 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 GSTA1-201ENST00000334575 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 RNA5SP463-201ENST00000363030 120 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 SNORD56.4-201ENST00000363883 71 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 CRYZ-203ENST00000370871 1292 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 RNY3P9-201ENST00000384727 106 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 AL139806.1-201ENST00000403057 1002 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 NPM1P38-201ENST00000403835 865 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 XKRYP4-201ENST00000414395 483 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 AKR1B15-201ENST00000423958 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 RBMY2JP-201ENST00000425544 1059 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 AL355607.1-201ENST00000427745 295 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 AC130472.1-201ENST00000427885 309 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 PRPS1P2-201ENST00000430496 937 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 AL021707.2-201ENST00000431924 786 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 AC140479.1-201ENST00000440423 337 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 AC245047.2-201ENST00000441060 530 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 AC073174.1-201ENST00000444155 415 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 AP001469.2-201ENST00000444966 390 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 LINC00448-202ENST00000448411 433 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 XKRYP5-201ENST00000449659 483 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 TNR-IT1-201ENST00000455447 630 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 AC073636.1-202ENST00000457756 558 ntTSL 4 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 MRPS33-203ENST00000467334 622 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 RN7SL91P-201ENST00000469313 291 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 ST20-201ENST00000478497 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 QTRT2-215ENST00000493014 1046 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 RPL12P7-201ENST00000493832 494 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 AC107956.2-201ENST00000496042 454 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 RPS26P24-201ENST00000497656 331 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 CCDC169-211ENST00000503173 837 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 GBA3-201ENST00000503442 1232 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 GAPDHP71-201ENST00000511530 1003 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 AC024132.3-201ENST00000513616 649 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 AC106791.1-201ENST00000514616 827 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 RFPL4AP3-201ENST00000515267 345 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 RN7SKP141-201ENST00000516167 338 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 AC117834.1-202ENST00000521203 561 ntTSL 4 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 HAUS1P3-201ENST00000523909 662 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 AP001636.2-201ENST00000525517 696 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 AP001372.3-201ENST00000530510 609 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 FOXG1-AS1-203ENST00000551395 602 ntTSL 4 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 AC009558.2-201ENST00000558258 396 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 AC120498.6-201ENST00000564700 338 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 AC114947.2-202ENST00000569313 643 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 AC026254.4-201ENST00000581118 454 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 AC114488.2-207ENST00000585660 700 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 AC012370.2-201ENST00000597541 1080 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 MARK3P1-201ENST00000604796 643 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 AC073387.2-201ENST00000604797 784 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 RNU4-5P-201ENST00000607255 135 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 AL353626.1-201ENST00000613429 507 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 Metazoa_SRP.189-201ENST00000614219 303 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 AC106875.2-201ENST00000617634 596 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 MIR6761-201ENST00000617899 72 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 AC007204.1-201ENST00000621794 555 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 AC120349.3-201ENST00000624377 529 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 AL353608.4-201ENST00000624487 1188 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 AC119674.1-201ENST00000641611 1210 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 SPATA2P1-201ENST00000431223 2055 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 AF131215.2-201ENST00000531549 1710 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 NEPNP-201ENST00000404786 1371 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 CPSF6-202ENST00000435070 6616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 KIFAP3-203ENST00000367767 2718 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 LINC01142-201ENST00000440404 1457 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 IQCA1-204ENST00000409907 3281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 ZNF844-202ENST00000441304 2036 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 AC091806.1-201ENST00000452690 3000 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 LGALS17A-201ENST00000412609 2562 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 AADAT-202ENST00000353187 2101 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 AC090220.1-201ENST00000593078 1699 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 CBR4-201ENST00000306193 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 FBXL21-201ENST00000297158 1305 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 NEK2P4-201ENST00000425793 1329 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 GTDC1-203ENST00000392867 2408 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 UG0898H09-202ENST00000623646 7040 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 TMEM116-201ENST00000355445 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 FER-209ENST00000618353 1420 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 RBM23-203ENST00000359890 10040 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 TNFSF11-202ENST00000358545 1520 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 LINC00269-201ENST00000399711 2173 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 SYNPR-204ENST00000460711 2383 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 LINC01095-202ENST00000507726 1715 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
PDCD1Q15116 CCL28-201ENST00000361115 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
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