Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 DMD-228ENST00000541735 7080 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 AL449283.1-201ENST00000602631 3403 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 CASC18-202ENST00000548557 2503 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 CBWD6-203ENST00000456520 1608 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 UPRT-207ENST00000530743 1636 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 KIAA2012-205ENST00000541917 3543 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 KCNMA1-AS1-202ENST00000429850 3566 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 SLC22A25-201ENST00000306494 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 LINC01741-201ENST00000427173 1666 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 AC013562.1-201ENST00000519427 1722 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 DNHD1-201ENST00000254579 14862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 PHF5A-201ENST00000216252 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 IFT43-201ENST00000238628 816 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 FCAR-204ENST00000359272 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 RNA5SP188-201ENST00000362916 129 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 SNORA70.8-201ENST00000384231 136 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 RNA5SP18-201ENST00000390935 121 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 BCL2L15-202ENST00000393316 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 AC121334.1-201ENST00000396414 802 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 CES5AP1-201ENST00000400418 859 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 TMA16P2-201ENST00000413187 601 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 AL445218.1-202ENST00000427695 845 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 AC074257.1-201ENST00000446340 585 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 RPSAP7-201ENST00000456871 885 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 MARK2P8-201ENST00000476069 952 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 AC140125.3-202ENST00000504362 348 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 OR7E163P-201ENST00000505943 894 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 AC138965.1-201ENST00000509329 348 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 AC097173.2-201ENST00000518701 474 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 IGLV10-67-201ENST00000519446 325 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 AC013546.1-201ENST00000523232 564 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 OR5D2P-201ENST00000524390 911 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 AC104241.1-201ENST00000530039 628 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 OR7E2P-201ENST00000533071 889 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 AC025171.4-201ENST00000607250 1047 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 AC023310.4-201ENST00000613130 650 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 AC135050.6-202ENST00000613584 392 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 ELMO2P1-202ENST00000614283 794 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 AL157762.1-201ENST00000619612 415 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 AC016582.3-206ENST00000636547 207 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 ATP10D-201ENST00000273859 6655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 EEF1A1P9-201ENST00000514975 1383 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 SETD2-202ENST00000409792 8142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 TFDP2-222ENST00000495310 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 EEF1A1P2-201ENST00000553854 1447 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 KLHL13-202ENST00000371876 5331 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 AC092070.2-203ENST00000598377 3644 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 LRRC31-201ENST00000264676 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 PUS3-203ENST00000530811 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 CCAR1-201ENST00000265872 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 IKZF3-210ENST00000377958 1837 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 MTOR-202ENST00000376838 4017 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 EMSY-201ENST00000334736 5508 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 NOL4-203ENST00000538587 1979 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 ZMYM4-201ENST00000314607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 GZMA-201ENST00000274306 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 GPR15-201ENST00000284311 1252 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 OR2G3-201ENST00000320002 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 S100A4-201ENST00000354332 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 RN7SKP211-201ENST00000363328 315 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 RNA5SP472-201ENST00000363868 119 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 C1orf146-202ENST00000370375 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 AC113608.1-201ENST00000398740 305 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 FTOP1-201ENST00000419363 861 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 AL390840.1-201ENST00000420303 988 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 GAPDHP46-201ENST00000424043 994 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 TPRG1-AS2-201ENST00000425454 479 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 RPL6P2-201ENST00000425480 783 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 AL445307.1-201ENST00000446476 602 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 OR51P1P-201ENST00000447547 942 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 RPS26P11-201ENST00000463445 348 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 SNRPCP3-201ENST00000474888 476 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 LINC02024-202ENST00000493545 483 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 LINC02223-203ENST00000514771 781 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 ZNF726-203ENST00000525354 806 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 AL591767.1-201ENST00000557160 568 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 AC007494.1-201ENST00000562293 760 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 TMEM202-202ENST00000567679 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 LINC01255-203ENST00000587189 591 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 RPSAP66-201ENST00000592196 606 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 LINC00854-204ENST00000594691 649 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 OR5AH1P-201ENST00000595968 283 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 AC108451.2-201ENST00000603875 538 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 AC008385.1-201ENST00000604421 355 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 AL445465.1-206ENST00000609544 528 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 Metazoa_SRP.124-201ENST00000610352 345 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 Metazoa_SRP.39-201ENST00000614194 271 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 AL354733.2-202ENST00000615485 742 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 AC005790.1-201ENST00000619774 450 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 PFN1P2-202ENST00000621347 397 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 AL356599.1-202ENST00000626919 218 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 FGFR2-218ENST00000478859 3990 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 KIAA1109-201ENST00000264501 15896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 TM2D2-203ENST00000456845 3295 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 SLC16A4-201ENST00000369779 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 ALS2CR12-207ENST00000439709 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 AC232271.1-201ENST00000602455 2715 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 SEPT7-AS1-203ENST00000437235 3810 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 AC090220.1-201ENST00000593078 1699 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HLA-DMAP28067 GNRH1-201ENST00000276414 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.4 ms