Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 RPL31-202ENST00000409000 641 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 LINC00354-201ENST00000412119 347 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 AC000089.1-201ENST00000424559 801 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 AC010148.1-201ENST00000427619 707 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 EIF4A1P5-201ENST00000428062 1095 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 AL158212.1-201ENST00000428766 315 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 AC239367.3-201ENST00000428996 814 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 PAICSP2-201ENST00000429118 1150 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 RPS10P21-201ENST00000430654 475 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 NFIA-AS2-203ENST00000438559 1275 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 HMGN1P32-201ENST00000441744 256 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 AL121578.2-201ENST00000448797 447 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 AC026391.1-201ENST00000450677 537 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 AC012158.1-202ENST00000482431 1132 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 AC068647.2-202ENST00000485020 390 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 RN7SL561P-201ENST00000488553 281 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 AC084048.1-201ENST00000505494 640 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 AC093878.1-201ENST00000515630 432 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 AP005902.2-201ENST00000518393 307 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 COX6C-205ENST00000520468 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 TBCA-209ENST00000522370 435 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 BAALC-AS1-208ENST00000523614 582 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 AC022973.4-201ENST00000524100 917 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 SNRPCP6-201ENST00000528310 210 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 RACGAP1-216ENST00000548961 387 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 OR5BK1P-201ENST00000550421 823 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 C14orf119-202ENST00000554203 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 AC023906.3-201ENST00000559825 874 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 AL353593.3-201ENST00000602778 764 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 AC013731.1-201ENST00000604340 883 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 AP000577.1-201ENST00000624366 878 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 AC027559.1-201ENST00000636288 271 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 TDRD1-201ENST00000251864 4510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 CDH12-208ENST00000522262 3028 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 ADGRL3-207ENST00000507625 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 GABRB2-209ENST00000612710 2470 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 TMEM192-201ENST00000306480 10012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 DOCK11-201ENST00000276202 6625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 B3GNT5-206ENST00000465010 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 AC009220.2-201ENST00000489759 1751 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 RBMY1A3P-201ENST00000382670 1404 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 AL356479.1-203ENST00000411798 1440 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 SLC25A12-202ENST00000422440 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 AC092821.2-201ENST00000545710 2042 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 CMAHP-202ENST00000377993 1681 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 AL136317.2-201ENST00000619851 2254 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 NRP1-205ENST00000374823 3737 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 AC092701.1-201ENST00000623627 1551 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 AL596244.1-201ENST00000567068 3779 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 PPP1R12B-216ENST00000608999 15248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 LMO7-202ENST00000341547 7237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 ZNF333-203ENST00000540689 3595 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 DTHD1-206ENST00000639862 3819 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 CS-201ENST00000351328 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 ERLIN2-201ENST00000276461 6073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 AC105114.1-201ENST00000624795 1862 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 CACNA1D-224ENST00000637424 6856 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 TMEM68-219ENST00000617977 4512 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 OAT-201ENST00000368845 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 PCNX1-201ENST00000304743 12919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 SLC25A30-204ENST00000519676 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 RNF145-211ENST00000521606 2658 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 OR52H1-201ENST00000322653 1057 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 SEC61G-201ENST00000352861 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 RNA5SP382-201ENST00000363355 112 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 AL136100.1-201ENST00000407696 330 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 OR52N3P-201ENST00000413417 934 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 NFIA-AS2-202ENST00000421455 768 ntTSL 4 BASIC7.24□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 LINC00433-201ENST00000424165 888 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 GAPDHP57-201ENST00000424400 585 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 E2F6P1-201ENST00000428850 745 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 E2F6P3-201ENST00000441743 743 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 PGM5P3-AS1-202ENST00000442069 615 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 CRYZL1-217ENST00000445393 824 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 PFN1P11-201ENST00000445829 389 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 LINC00349-201ENST00000448748 841 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 LINC01098-201ENST00000507870 1034 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 AC023136.1-201ENST00000513093 1105 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 AC087273.2-201ENST00000519038 634 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 COX6C-210ENST00000524245 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 AC006262.2-201ENST00000599127 612 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 AC092902.3-201ENST00000610060 373 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 AC243919.1-201ENST00000613086 785 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 MIR6070-201ENST00000613967 103 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 OR1N1-202ENST00000619659 939 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 CT45A6-202ENST00000620654 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 SUPT7L-202ENST00000404798 4114 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 CTNND1-218ENST00000528232 5745 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 PMFBP1-202ENST00000355636 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 VIRMA-202ENST00000421249 3924 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 DAZ1-201ENST00000382510 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 IL1RAP-201ENST00000072516 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 DNA2-208ENST00000551118 3468 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 RNASE13-201ENST00000382951 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 LRRC37A3-203ENST00000339474 2589 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 AC104581.5-201ENST00000624171 7141 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 RAB27B-201ENST00000262094 7281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 SYTL4-203ENST00000372981 4847 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 ATF7IP-222ENST00000544627 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
APOBEC3GQ9HC16 USP37-201ENST00000258399 8032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.6 ms