Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 SDHC-208ENST00000513009 369 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 AC133963.2-201ENST00000513686 578 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 AC109588.1-202ENST00000515720 880 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 TMEM97P2-201ENST00000517841 403 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 AC244502.1-205ENST00000535351 571 ntTSL 4 BASIC9.58□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 HAGLR-211ENST00000549329 609 ntTSL 4 BASIC9.58□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 AC034102.1-201ENST00000552016 604 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 APAF1-211ENST00000552268 1143 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 LINC02322-201ENST00000554773 338 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 LINC02290-203ENST00000556662 577 ntTSL 4 BASIC9.58□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 AC022166.1-201ENST00000567851 581 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 AC007346.1-201ENST00000569208 867 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 AC087499.3-201ENST00000578210 717 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 AC022069.1-201ENST00000582910 658 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 AC090213.1-201ENST00000586841 546 ntTSL 4 BASIC9.58□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 AL121985.1-203ENST00000588034 556 ntTSL 4 BASIC9.58□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 AL020997.3-201ENST00000602843 359 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 BUB1P1-201ENST00000603541 607 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 AC016877.3-201ENST00000606778 504 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 OR4M2-201ENST00000614722 1133 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 Metazoa_SRP.27-201ENST00000617573 258 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 AC010722.1-202ENST00000618284 573 ntTSL 4 BASIC9.58□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 CU634019.6-201ENST00000623165 710 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 ANKMY2-205ENST00000627859 210 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 SAMMSON-214ENST00000641395 1264 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 ENSA-204ENST00000356527 2546 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 FPR3-201ENST00000339223 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 KCNMB2-201ENST00000358316 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 TPTE2P2-201ENST00000403471 1466 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 AC010200.1-201ENST00000547380 1454 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 C9orf131-205ENST00000421362 3259 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC9.58□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 KLRC1-203ENST00000408006 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 ZNF225-201ENST00000262894 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 MTND5P24-201ENST00000438892 1767 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 CD101-202ENST00000369470 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 NEK2P4-201ENST00000425793 1329 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 LINC01260-201ENST00000415889 1416 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 TRIM48-201ENST00000417545 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 AC019197.1-202ENST00000414885 2639 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 SMARCA2-252ENST00000636559 6853 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 MDM4-205ENST00000391947 10008 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 CEACAMP3-201ENST00000473762 1548 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 SSBP2-212ENST00000509053 1534 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 KIAA0753-201ENST00000361413 4859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 TMEM200A-203ENST00000545622 2918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 GCNT3-209ENST00000560585 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 SLC2A14-215ENST00000542546 3120 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 ZNF229-204ENST00000614049 4507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 MAPK10-313ENST00000641405 2469 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 MAPK10-333ENST00000641607 2481 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 RAB11A-201ENST00000261890 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 SH3BGRL-201ENST00000373212 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 ALS2-201ENST00000264276 6644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 OR4D9-201ENST00000329328 945 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-252P-201ENST00000363232 107 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 AL354864.1-201ENST00000373226 539 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 G6PC2-202ENST00000375363 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 TRAV10-201ENST00000390432 379 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 TANK-206ENST00000406287 875 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 AL133264.1-201ENST00000407157 562 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 SULT1C4-202ENST00000409309 1045 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 ABCC5-AS1-201ENST00000422946 469 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 AC073342.1-201ENST00000427392 592 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 AC117944.1-201ENST00000430748 641 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 SLC25A24P1-202ENST00000434803 1220 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 TMEM127-203ENST00000435268 582 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 NANOGP2-201ENST00000435391 727 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 AL023584.1-201ENST00000437067 349 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 CLUHP5-201ENST00000438421 774 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 AC005008.2-202ENST00000447776 439 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 FTH1P27-201ENST00000449509 551 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 AC114755.1-201ENST00000453101 868 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 AL450263.1-202ENST00000453199 643 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 BZW1P2-201ENST00000473537 826 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 AC117392.1-201ENST00000487061 596 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 NAA50-206ENST00000493454 964 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 LINC01332-201ENST00000506612 502 ntTSL 4 BASIC9.57□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-943P-201ENST00000516960 98 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 MAL2-207ENST00000522828 603 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 AC091820.1-201ENST00000523497 648 ntTSL 4 BASIC9.57□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 AP002469.1-201ENST00000526011 1043 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 PWRN1-206ENST00000565512 433 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 TEX46-202ENST00000566855 510 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 AC006362.1-201ENST00000567392 174 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 AC007952.7-201ENST00000583141 757 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 SLC14A1-214ENST00000589700 1022 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 ZNF235-204ENST00000589799 955 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 LGALS17A-205ENST00000598736 1111 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 AC072039.2-201ENST00000608883 439 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 KCNQ1OT1_2.1-201ENST00000619507 196 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 AC010608.2-201ENST00000624830 470 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 SELENOP-203ENST00000506577 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 INTS4-211ENST00000535943 1382 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 AL353753.1-201ENST00000612217 2320 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 AC105411.1-201ENST00000568776 1470 ntTSL 4 BASIC9.57□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 Z99129.3-201ENST00000624363 6430 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 CASC19-281ENST00000642118 1554 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 SLC4A8-203ENST00000453097 11824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 NAT1-206ENST00000518029 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
CSPP1Q1MSJ5 IL31RA-206ENST00000447346 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.9 ms