Protein–RNA interactions for Protein: Q14596

NBR1, Next to BRCA1 gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 966 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBR1Q14596 AC034102.7-201ENST00000550840 470 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
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NBR1Q14596 AC092325.1-201ENST00000566449 554 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
NBR1Q14596 AC013290.1-201ENST00000586960 537 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
NBR1Q14596 AC119751.8-201ENST00000597032 156 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
NBR1Q14596 CEACAM8-202ENST00000599005 544 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
NBR1Q14596 FO704657.1-201ENST00000607013 400 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
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NBR1Q14596 CCL4L2-212ENST00000615418 954 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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NBR1Q14596 CCL4L2-215ENST00000620055 537 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
NBR1Q14596 CCL4L2-216ENST00000620098 836 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
NBR1Q14596 CCL4L2-217ENST00000620250 667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
NBR1Q14596 AC239585.2-201ENST00000624269 557 ntTSL 4 BASIC10.38□□□□□ -0.75
NBR1Q14596 TTTY3B-201ENST00000631331 344 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
NBR1Q14596 AL357060.1-201ENST00000638039 977 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
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NBR1Q14596 REV3L-203ENST00000368805 10461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
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NBR1Q14596 AL096816.1-201ENST00000623300 2920 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
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NBR1Q14596 STARD4-AS1-201ENST00000500779 5525 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
NBR1Q14596 ZNFX1-202ENST00000371752 7212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
NBR1Q14596 AC105383.1-202ENST00000505289 2820 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
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NBR1Q14596 GHRH-203ENST00000373614 570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
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NBR1Q14596 LINC02449-202ENST00000399866 517 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
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NBR1Q14596 NR1I3-204ENST00000367982 1322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
NBR1Q14596 SCAND2P-201ENST00000348993 8975 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
NBR1Q14596 PIGN-231ENST00000639174 4095 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
NBR1Q14596 EFCAB5-208ENST00000536908 2826 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
NBR1Q14596 SLC4A4-203ENST00000351898 3771 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
NBR1Q14596 SRSF11-202ENST00000370950 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
NBR1Q14596 E2F8-201ENST00000250024 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
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