Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D6

ARFGEF1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,849 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF1Q9Y6D6 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARFGEF1Q9Y6D6 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARFGEF1Q9Y6D6 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARFGEF1Q9Y6D6 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARFGEF1Q9Y6D6 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARFGEF1Q9Y6D6 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARFGEF1Q9Y6D6 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARFGEF1Q9Y6D6 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARFGEF1Q9Y6D6 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARFGEF1Q9Y6D6 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARFGEF1Q9Y6D6 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARFGEF1Q9Y6D6 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARFGEF1Q9Y6D6 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARFGEF1Q9Y6D6 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARFGEF1Q9Y6D6 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARFGEF1Q9Y6D6 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARFGEF1Q9Y6D6 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARFGEF1Q9Y6D6 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARFGEF1Q9Y6D6 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARFGEF1Q9Y6D6 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARFGEF1Q9Y6D6 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARFGEF1Q9Y6D6 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARFGEF1Q9Y6D6 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARFGEF1Q9Y6D6 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARFGEF1Q9Y6D6 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARFGEF1Q9Y6D6 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ARFGEF1Q9Y6D6 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ARFGEF1Q9Y6D6 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ARFGEF1Q9Y6D6 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARFGEF1Q9Y6D6 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARFGEF1Q9Y6D6 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARFGEF1Q9Y6D6 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARFGEF1Q9Y6D6 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARFGEF1Q9Y6D6 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARFGEF1Q9Y6D6 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARFGEF1Q9Y6D6 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARFGEF1Q9Y6D6 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARFGEF1Q9Y6D6 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARFGEF1Q9Y6D6 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARFGEF1Q9Y6D6 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARFGEF1Q9Y6D6 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARFGEF1Q9Y6D6 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARFGEF1Q9Y6D6 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARFGEF1Q9Y6D6 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARFGEF1Q9Y6D6 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARFGEF1Q9Y6D6 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARFGEF1Q9Y6D6 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ARFGEF1Q9Y6D6 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARFGEF1Q9Y6D6 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ARFGEF1Q9Y6D6 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARFGEF1Q9Y6D6 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARFGEF1Q9Y6D6 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ARFGEF1Q9Y6D6 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARFGEF1Q9Y6D6 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARFGEF1Q9Y6D6 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARFGEF1Q9Y6D6 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARFGEF1Q9Y6D6 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARFGEF1Q9Y6D6 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARFGEF1Q9Y6D6 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ARFGEF1Q9Y6D6 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARFGEF1Q9Y6D6 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARFGEF1Q9Y6D6 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARFGEF1Q9Y6D6 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARFGEF1Q9Y6D6 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARFGEF1Q9Y6D6 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARFGEF1Q9Y6D6 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARFGEF1Q9Y6D6 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARFGEF1Q9Y6D6 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARFGEF1Q9Y6D6 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARFGEF1Q9Y6D6 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARFGEF1Q9Y6D6 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARFGEF1Q9Y6D6 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARFGEF1Q9Y6D6 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARFGEF1Q9Y6D6 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARFGEF1Q9Y6D6 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARFGEF1Q9Y6D6 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARFGEF1Q9Y6D6 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARFGEF1Q9Y6D6 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARFGEF1Q9Y6D6 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARFGEF1Q9Y6D6 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARFGEF1Q9Y6D6 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARFGEF1Q9Y6D6 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARFGEF1Q9Y6D6 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARFGEF1Q9Y6D6 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARFGEF1Q9Y6D6 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARFGEF1Q9Y6D6 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARFGEF1Q9Y6D6 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ARFGEF1Q9Y6D6 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARFGEF1Q9Y6D6 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARFGEF1Q9Y6D6 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARFGEF1Q9Y6D6 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARFGEF1Q9Y6D6 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARFGEF1Q9Y6D6 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARFGEF1Q9Y6D6 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARFGEF1Q9Y6D6 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ARFGEF1Q9Y6D6 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARFGEF1Q9Y6D6 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARFGEF1Q9Y6D6 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARFGEF1Q9Y6D6 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ARFGEF1Q9Y6D6 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms