Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y496

KIF3A, Kinesin-like protein KIF3A, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF3AQ9Y496 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KIF3AQ9Y496 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KIF3AQ9Y496 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KIF3AQ9Y496 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KIF3AQ9Y496 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
KIF3AQ9Y496 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
KIF3AQ9Y496 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
KIF3AQ9Y496 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KIF3AQ9Y496 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
KIF3AQ9Y496 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KIF3AQ9Y496 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KIF3AQ9Y496 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KIF3AQ9Y496 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KIF3AQ9Y496 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KIF3AQ9Y496 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KIF3AQ9Y496 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KIF3AQ9Y496 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
KIF3AQ9Y496 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KIF3AQ9Y496 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KIF3AQ9Y496 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KIF3AQ9Y496 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KIF3AQ9Y496 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KIF3AQ9Y496 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KIF3AQ9Y496 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
KIF3AQ9Y496 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
KIF3AQ9Y496 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KIF3AQ9Y496 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KIF3AQ9Y496 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KIF3AQ9Y496 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KIF3AQ9Y496 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KIF3AQ9Y496 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KIF3AQ9Y496 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KIF3AQ9Y496 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KIF3AQ9Y496 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KIF3AQ9Y496 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KIF3AQ9Y496 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KIF3AQ9Y496 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KIF3AQ9Y496 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KIF3AQ9Y496 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KIF3AQ9Y496 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KIF3AQ9Y496 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KIF3AQ9Y496 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KIF3AQ9Y496 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KIF3AQ9Y496 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KIF3AQ9Y496 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KIF3AQ9Y496 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KIF3AQ9Y496 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KIF3AQ9Y496 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KIF3AQ9Y496 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KIF3AQ9Y496 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KIF3AQ9Y496 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KIF3AQ9Y496 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KIF3AQ9Y496 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KIF3AQ9Y496 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KIF3AQ9Y496 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KIF3AQ9Y496 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KIF3AQ9Y496 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KIF3AQ9Y496 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
KIF3AQ9Y496 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
KIF3AQ9Y496 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KIF3AQ9Y496 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KIF3AQ9Y496 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
KIF3AQ9Y496 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
KIF3AQ9Y496 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KIF3AQ9Y496 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KIF3AQ9Y496 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KIF3AQ9Y496 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KIF3AQ9Y496 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KIF3AQ9Y496 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KIF3AQ9Y496 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KIF3AQ9Y496 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KIF3AQ9Y496 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KIF3AQ9Y496 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KIF3AQ9Y496 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KIF3AQ9Y496 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KIF3AQ9Y496 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
KIF3AQ9Y496 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KIF3AQ9Y496 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KIF3AQ9Y496 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
KIF3AQ9Y496 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
KIF3AQ9Y496 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KIF3AQ9Y496 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KIF3AQ9Y496 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KIF3AQ9Y496 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KIF3AQ9Y496 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KIF3AQ9Y496 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KIF3AQ9Y496 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KIF3AQ9Y496 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KIF3AQ9Y496 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KIF3AQ9Y496 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
KIF3AQ9Y496 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KIF3AQ9Y496 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KIF3AQ9Y496 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KIF3AQ9Y496 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KIF3AQ9Y496 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
KIF3AQ9Y496 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KIF3AQ9Y496 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KIF3AQ9Y496 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KIF3AQ9Y496 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KIF3AQ9Y496 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms