Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM35Q9UPQ4 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM35Q9UPQ4 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM35Q9UPQ4 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM35Q9UPQ4 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM35Q9UPQ4 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM35Q9UPQ4 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM35Q9UPQ4 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM35Q9UPQ4 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM35Q9UPQ4 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM35Q9UPQ4 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM35Q9UPQ4 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM35Q9UPQ4 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM35Q9UPQ4 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM35Q9UPQ4 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM35Q9UPQ4 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM35Q9UPQ4 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM35Q9UPQ4 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM35Q9UPQ4 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM35Q9UPQ4 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM35Q9UPQ4 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM35Q9UPQ4 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM35Q9UPQ4 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM35Q9UPQ4 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM35Q9UPQ4 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM35Q9UPQ4 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM35Q9UPQ4 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM35Q9UPQ4 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRIM35Q9UPQ4 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRIM35Q9UPQ4 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRIM35Q9UPQ4 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRIM35Q9UPQ4 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRIM35Q9UPQ4 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRIM35Q9UPQ4 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRIM35Q9UPQ4 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRIM35Q9UPQ4 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRIM35Q9UPQ4 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRIM35Q9UPQ4 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRIM35Q9UPQ4 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRIM35Q9UPQ4 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRIM35Q9UPQ4 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRIM35Q9UPQ4 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRIM35Q9UPQ4 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRIM35Q9UPQ4 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
TRIM35Q9UPQ4 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM35Q9UPQ4 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM35Q9UPQ4 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM35Q9UPQ4 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM35Q9UPQ4 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM35Q9UPQ4 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM35Q9UPQ4 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM35Q9UPQ4 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM35Q9UPQ4 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM35Q9UPQ4 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM35Q9UPQ4 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM35Q9UPQ4 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM35Q9UPQ4 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC26■■□□□ 1.75
TRIM35Q9UPQ4 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM35Q9UPQ4 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM35Q9UPQ4 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM35Q9UPQ4 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM35Q9UPQ4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM35Q9UPQ4 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM35Q9UPQ4 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM35Q9UPQ4 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM35Q9UPQ4 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM35Q9UPQ4 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM35Q9UPQ4 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM35Q9UPQ4 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM35Q9UPQ4 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM35Q9UPQ4 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM35Q9UPQ4 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM35Q9UPQ4 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM35Q9UPQ4 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM35Q9UPQ4 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM35Q9UPQ4 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM35Q9UPQ4 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM35Q9UPQ4 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM35Q9UPQ4 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM35Q9UPQ4 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM35Q9UPQ4 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM35Q9UPQ4 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM35Q9UPQ4 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM35Q9UPQ4 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM35Q9UPQ4 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM35Q9UPQ4 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM35Q9UPQ4 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM35Q9UPQ4 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM35Q9UPQ4 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM35Q9UPQ4 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM35Q9UPQ4 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM35Q9UPQ4 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM35Q9UPQ4 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM35Q9UPQ4 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM35Q9UPQ4 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM35Q9UPQ4 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM35Q9UPQ4 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM35Q9UPQ4 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM35Q9UPQ4 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM35Q9UPQ4 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms