Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD9

ZNF608, Zinc finger protein 608, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF608Q9ULD9 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
ZNF608Q9ULD9 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
ZNF608Q9ULD9 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
ZNF608Q9ULD9 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
ZNF608Q9ULD9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
ZNF608Q9ULD9 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
ZNF608Q9ULD9 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
ZNF608Q9ULD9 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
ZNF608Q9ULD9 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
ZNF608Q9ULD9 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
ZNF608Q9ULD9 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
ZNF608Q9ULD9 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
ZNF608Q9ULD9 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
ZNF608Q9ULD9 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC33.23■■■□□ 2.91
ZNF608Q9ULD9 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
ZNF608Q9ULD9 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
ZNF608Q9ULD9 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
ZNF608Q9ULD9 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
ZNF608Q9ULD9 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
ZNF608Q9ULD9 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
ZNF608Q9ULD9 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
ZNF608Q9ULD9 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC33.23■■■□□ 2.91
ZNF608Q9ULD9 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
ZNF608Q9ULD9 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
ZNF608Q9ULD9 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
ZNF608Q9ULD9 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
ZNF608Q9ULD9 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
ZNF608Q9ULD9 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
ZNF608Q9ULD9 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.22■■■□□ 2.91
ZNF608Q9ULD9 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC33.22■■■□□ 2.91
ZNF608Q9ULD9 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
ZNF608Q9ULD9 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
ZNF608Q9ULD9 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
ZNF608Q9ULD9 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
ZNF608Q9ULD9 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
ZNF608Q9ULD9 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
ZNF608Q9ULD9 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
ZNF608Q9ULD9 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
ZNF608Q9ULD9 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
ZNF608Q9ULD9 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
ZNF608Q9ULD9 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
ZNF608Q9ULD9 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
ZNF608Q9ULD9 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC33.21■■■□□ 2.91
ZNF608Q9ULD9 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
ZNF608Q9ULD9 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
ZNF608Q9ULD9 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
ZNF608Q9ULD9 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
ZNF608Q9ULD9 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
ZNF608Q9ULD9 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
ZNF608Q9ULD9 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
ZNF608Q9ULD9 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
ZNF608Q9ULD9 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
ZNF608Q9ULD9 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
ZNF608Q9ULD9 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC33.2■■■□□ 2.91
ZNF608Q9ULD9 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
ZNF608Q9ULD9 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
ZNF608Q9ULD9 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
ZNF608Q9ULD9 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
ZNF608Q9ULD9 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC33.19■■■□□ 2.9
ZNF608Q9ULD9 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
ZNF608Q9ULD9 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
ZNF608Q9ULD9 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC33.19■■■□□ 2.9
ZNF608Q9ULD9 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
ZNF608Q9ULD9 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
ZNF608Q9ULD9 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
ZNF608Q9ULD9 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
ZNF608Q9ULD9 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
ZNF608Q9ULD9 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC33.18■■■□□ 2.9
ZNF608Q9ULD9 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
ZNF608Q9ULD9 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC33.18■■■□□ 2.9
ZNF608Q9ULD9 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
ZNF608Q9ULD9 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC33.18■■■□□ 2.9
ZNF608Q9ULD9 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
ZNF608Q9ULD9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
ZNF608Q9ULD9 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
ZNF608Q9ULD9 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
ZNF608Q9ULD9 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
ZNF608Q9ULD9 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
ZNF608Q9ULD9 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
ZNF608Q9ULD9 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
ZNF608Q9ULD9 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
ZNF608Q9ULD9 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
ZNF608Q9ULD9 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
ZNF608Q9ULD9 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
ZNF608Q9ULD9 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.18■■■□□ 2.9
ZNF608Q9ULD9 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC33.18■■■□□ 2.9
ZNF608Q9ULD9 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.18■■■□□ 2.9
ZNF608Q9ULD9 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
ZNF608Q9ULD9 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
ZNF608Q9ULD9 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
ZNF608Q9ULD9 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
ZNF608Q9ULD9 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
ZNF608Q9ULD9 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
ZNF608Q9ULD9 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
ZNF608Q9ULD9 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
ZNF608Q9ULD9 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
ZNF608Q9ULD9 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
ZNF608Q9ULD9 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
ZNF608Q9ULD9 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
ZNF608Q9ULD9 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.7 ms