Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH90

FBXO40, F-box only protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO40Q9UH90 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FBXO40Q9UH90 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FBXO40Q9UH90 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FBXO40Q9UH90 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
FBXO40Q9UH90 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FBXO40Q9UH90 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FBXO40Q9UH90 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
FBXO40Q9UH90 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FBXO40Q9UH90 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FBXO40Q9UH90 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FBXO40Q9UH90 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FBXO40Q9UH90 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FBXO40Q9UH90 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FBXO40Q9UH90 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FBXO40Q9UH90 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FBXO40Q9UH90 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FBXO40Q9UH90 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FBXO40Q9UH90 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
FBXO40Q9UH90 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FBXO40Q9UH90 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FBXO40Q9UH90 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FBXO40Q9UH90 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FBXO40Q9UH90 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FBXO40Q9UH90 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FBXO40Q9UH90 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FBXO40Q9UH90 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FBXO40Q9UH90 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FBXO40Q9UH90 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FBXO40Q9UH90 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FBXO40Q9UH90 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FBXO40Q9UH90 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FBXO40Q9UH90 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FBXO40Q9UH90 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FBXO40Q9UH90 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FBXO40Q9UH90 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FBXO40Q9UH90 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
FBXO40Q9UH90 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FBXO40Q9UH90 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FBXO40Q9UH90 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FBXO40Q9UH90 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FBXO40Q9UH90 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FBXO40Q9UH90 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FBXO40Q9UH90 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FBXO40Q9UH90 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FBXO40Q9UH90 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FBXO40Q9UH90 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FBXO40Q9UH90 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FBXO40Q9UH90 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FBXO40Q9UH90 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FBXO40Q9UH90 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FBXO40Q9UH90 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FBXO40Q9UH90 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FBXO40Q9UH90 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FBXO40Q9UH90 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FBXO40Q9UH90 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FBXO40Q9UH90 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FBXO40Q9UH90 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
FBXO40Q9UH90 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FBXO40Q9UH90 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
FBXO40Q9UH90 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FBXO40Q9UH90 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
FBXO40Q9UH90 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
FBXO40Q9UH90 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FBXO40Q9UH90 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FBXO40Q9UH90 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FBXO40Q9UH90 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FBXO40Q9UH90 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FBXO40Q9UH90 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FBXO40Q9UH90 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FBXO40Q9UH90 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FBXO40Q9UH90 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FBXO40Q9UH90 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FBXO40Q9UH90 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
FBXO40Q9UH90 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
FBXO40Q9UH90 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
FBXO40Q9UH90 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FBXO40Q9UH90 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FBXO40Q9UH90 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FBXO40Q9UH90 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FBXO40Q9UH90 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
FBXO40Q9UH90 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FBXO40Q9UH90 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
FBXO40Q9UH90 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FBXO40Q9UH90 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FBXO40Q9UH90 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FBXO40Q9UH90 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FBXO40Q9UH90 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FBXO40Q9UH90 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FBXO40Q9UH90 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
FBXO40Q9UH90 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FBXO40Q9UH90 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FBXO40Q9UH90 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FBXO40Q9UH90 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FBXO40Q9UH90 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FBXO40Q9UH90 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FBXO40Q9UH90 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
FBXO40Q9UH90 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FBXO40Q9UH90 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
FBXO40Q9UH90 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FBXO40Q9UH90 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms