Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
COPS7AQ9UBW8 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
COPS7AQ9UBW8 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
COPS7AQ9UBW8 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
COPS7AQ9UBW8 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
COPS7AQ9UBW8 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
COPS7AQ9UBW8 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
COPS7AQ9UBW8 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
COPS7AQ9UBW8 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
COPS7AQ9UBW8 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
COPS7AQ9UBW8 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
COPS7AQ9UBW8 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
COPS7AQ9UBW8 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
COPS7AQ9UBW8 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
COPS7AQ9UBW8 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
COPS7AQ9UBW8 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
COPS7AQ9UBW8 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
COPS7AQ9UBW8 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
COPS7AQ9UBW8 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
COPS7AQ9UBW8 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
COPS7AQ9UBW8 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
COPS7AQ9UBW8 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
COPS7AQ9UBW8 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
COPS7AQ9UBW8 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
COPS7AQ9UBW8 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
COPS7AQ9UBW8 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
COPS7AQ9UBW8 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
COPS7AQ9UBW8 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
COPS7AQ9UBW8 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
COPS7AQ9UBW8 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
COPS7AQ9UBW8 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
COPS7AQ9UBW8 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
COPS7AQ9UBW8 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
COPS7AQ9UBW8 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
COPS7AQ9UBW8 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
COPS7AQ9UBW8 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
COPS7AQ9UBW8 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
COPS7AQ9UBW8 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
COPS7AQ9UBW8 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
COPS7AQ9UBW8 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
COPS7AQ9UBW8 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
COPS7AQ9UBW8 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
COPS7AQ9UBW8 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
COPS7AQ9UBW8 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
COPS7AQ9UBW8 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
COPS7AQ9UBW8 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
COPS7AQ9UBW8 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
COPS7AQ9UBW8 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
COPS7AQ9UBW8 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
COPS7AQ9UBW8 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
COPS7AQ9UBW8 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
COPS7AQ9UBW8 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
COPS7AQ9UBW8 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
COPS7AQ9UBW8 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
COPS7AQ9UBW8 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
COPS7AQ9UBW8 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
COPS7AQ9UBW8 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
COPS7AQ9UBW8 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
COPS7AQ9UBW8 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
COPS7AQ9UBW8 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
COPS7AQ9UBW8 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
COPS7AQ9UBW8 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
COPS7AQ9UBW8 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
COPS7AQ9UBW8 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
COPS7AQ9UBW8 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
COPS7AQ9UBW8 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
COPS7AQ9UBW8 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
COPS7AQ9UBW8 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
COPS7AQ9UBW8 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
COPS7AQ9UBW8 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
COPS7AQ9UBW8 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COPS7AQ9UBW8 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COPS7AQ9UBW8 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COPS7AQ9UBW8 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
COPS7AQ9UBW8 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COPS7AQ9UBW8 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COPS7AQ9UBW8 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COPS7AQ9UBW8 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
COPS7AQ9UBW8 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
COPS7AQ9UBW8 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COPS7AQ9UBW8 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COPS7AQ9UBW8 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
COPS7AQ9UBW8 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
COPS7AQ9UBW8 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COPS7AQ9UBW8 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
COPS7AQ9UBW8 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COPS7AQ9UBW8 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
COPS7AQ9UBW8 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COPS7AQ9UBW8 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
COPS7AQ9UBW8 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
COPS7AQ9UBW8 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COPS7AQ9UBW8 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
COPS7AQ9UBW8 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COPS7AQ9UBW8 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
COPS7AQ9UBW8 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COPS7AQ9UBW8 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
COPS7AQ9UBW8 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
COPS7AQ9UBW8 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COPS7AQ9UBW8 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
COPS7AQ9UBW8 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
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