Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
POLKQ9UBT6 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
POLKQ9UBT6 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
POLKQ9UBT6 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
POLKQ9UBT6 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
POLKQ9UBT6 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
POLKQ9UBT6 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
POLKQ9UBT6 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
POLKQ9UBT6 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
POLKQ9UBT6 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
POLKQ9UBT6 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
POLKQ9UBT6 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
POLKQ9UBT6 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
POLKQ9UBT6 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
POLKQ9UBT6 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
POLKQ9UBT6 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
POLKQ9UBT6 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
POLKQ9UBT6 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
POLKQ9UBT6 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
POLKQ9UBT6 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
POLKQ9UBT6 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
POLKQ9UBT6 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
POLKQ9UBT6 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
POLKQ9UBT6 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
POLKQ9UBT6 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
POLKQ9UBT6 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
POLKQ9UBT6 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
POLKQ9UBT6 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
POLKQ9UBT6 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
POLKQ9UBT6 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
POLKQ9UBT6 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
POLKQ9UBT6 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
POLKQ9UBT6 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
POLKQ9UBT6 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
POLKQ9UBT6 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
POLKQ9UBT6 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
POLKQ9UBT6 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
POLKQ9UBT6 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
POLKQ9UBT6 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
POLKQ9UBT6 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
POLKQ9UBT6 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
POLKQ9UBT6 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
POLKQ9UBT6 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
POLKQ9UBT6 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
POLKQ9UBT6 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
POLKQ9UBT6 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
POLKQ9UBT6 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
POLKQ9UBT6 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
POLKQ9UBT6 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
POLKQ9UBT6 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
POLKQ9UBT6 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
POLKQ9UBT6 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
POLKQ9UBT6 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
POLKQ9UBT6 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
POLKQ9UBT6 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
POLKQ9UBT6 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
POLKQ9UBT6 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
POLKQ9UBT6 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
POLKQ9UBT6 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
POLKQ9UBT6 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
POLKQ9UBT6 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
POLKQ9UBT6 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
POLKQ9UBT6 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
POLKQ9UBT6 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
POLKQ9UBT6 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
POLKQ9UBT6 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
POLKQ9UBT6 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
POLKQ9UBT6 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
POLKQ9UBT6 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
POLKQ9UBT6 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
POLKQ9UBT6 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
POLKQ9UBT6 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
POLKQ9UBT6 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
POLKQ9UBT6 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
POLKQ9UBT6 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
POLKQ9UBT6 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
POLKQ9UBT6 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
POLKQ9UBT6 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
POLKQ9UBT6 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
POLKQ9UBT6 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
POLKQ9UBT6 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
POLKQ9UBT6 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
POLKQ9UBT6 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
POLKQ9UBT6 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
POLKQ9UBT6 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
POLKQ9UBT6 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
POLKQ9UBT6 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
POLKQ9UBT6 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
POLKQ9UBT6 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
POLKQ9UBT6 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
POLKQ9UBT6 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
POLKQ9UBT6 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
POLKQ9UBT6 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
POLKQ9UBT6 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
POLKQ9UBT6 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
POLKQ9UBT6 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
POLKQ9UBT6 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
POLKQ9UBT6 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
POLKQ9UBT6 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
POLKQ9UBT6 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms