Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J1

PDP1, [Pyruvate dehydrogenase [acetyl-transferring]]-phosphatase 1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDP1Q9P0J1 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PDP1Q9P0J1 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDP1Q9P0J1 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDP1Q9P0J1 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDP1Q9P0J1 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDP1Q9P0J1 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDP1Q9P0J1 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDP1Q9P0J1 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDP1Q9P0J1 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDP1Q9P0J1 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDP1Q9P0J1 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDP1Q9P0J1 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDP1Q9P0J1 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDP1Q9P0J1 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDP1Q9P0J1 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDP1Q9P0J1 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDP1Q9P0J1 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDP1Q9P0J1 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDP1Q9P0J1 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDP1Q9P0J1 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDP1Q9P0J1 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDP1Q9P0J1 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDP1Q9P0J1 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDP1Q9P0J1 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDP1Q9P0J1 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDP1Q9P0J1 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDP1Q9P0J1 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDP1Q9P0J1 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDP1Q9P0J1 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDP1Q9P0J1 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDP1Q9P0J1 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDP1Q9P0J1 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PDP1Q9P0J1 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDP1Q9P0J1 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDP1Q9P0J1 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDP1Q9P0J1 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDP1Q9P0J1 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDP1Q9P0J1 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDP1Q9P0J1 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDP1Q9P0J1 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDP1Q9P0J1 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDP1Q9P0J1 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDP1Q9P0J1 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PDP1Q9P0J1 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDP1Q9P0J1 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDP1Q9P0J1 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDP1Q9P0J1 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDP1Q9P0J1 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDP1Q9P0J1 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDP1Q9P0J1 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDP1Q9P0J1 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PDP1Q9P0J1 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDP1Q9P0J1 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PDP1Q9P0J1 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDP1Q9P0J1 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDP1Q9P0J1 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PDP1Q9P0J1 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PDP1Q9P0J1 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PDP1Q9P0J1 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PDP1Q9P0J1 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PDP1Q9P0J1 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PDP1Q9P0J1 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PDP1Q9P0J1 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDP1Q9P0J1 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDP1Q9P0J1 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDP1Q9P0J1 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDP1Q9P0J1 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDP1Q9P0J1 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDP1Q9P0J1 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDP1Q9P0J1 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDP1Q9P0J1 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDP1Q9P0J1 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDP1Q9P0J1 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDP1Q9P0J1 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDP1Q9P0J1 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDP1Q9P0J1 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDP1Q9P0J1 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDP1Q9P0J1 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDP1Q9P0J1 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDP1Q9P0J1 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDP1Q9P0J1 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDP1Q9P0J1 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDP1Q9P0J1 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDP1Q9P0J1 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDP1Q9P0J1 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDP1Q9P0J1 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDP1Q9P0J1 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDP1Q9P0J1 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDP1Q9P0J1 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDP1Q9P0J1 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDP1Q9P0J1 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDP1Q9P0J1 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDP1Q9P0J1 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDP1Q9P0J1 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDP1Q9P0J1 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDP1Q9P0J1 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDP1Q9P0J1 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDP1Q9P0J1 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDP1Q9P0J1 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDP1Q9P0J1 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms