Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR46

SH3GLB2, Endophilin-B2, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GLB2Q9NR46 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH3GLB2Q9NR46 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH3GLB2Q9NR46 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH3GLB2Q9NR46 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH3GLB2Q9NR46 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SH3GLB2Q9NR46 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH3GLB2Q9NR46 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3GLB2Q9NR46 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3GLB2Q9NR46 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3GLB2Q9NR46 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3GLB2Q9NR46 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3GLB2Q9NR46 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3GLB2Q9NR46 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3GLB2Q9NR46 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3GLB2Q9NR46 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3GLB2Q9NR46 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3GLB2Q9NR46 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3GLB2Q9NR46 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3GLB2Q9NR46 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3GLB2Q9NR46 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3GLB2Q9NR46 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3GLB2Q9NR46 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3GLB2Q9NR46 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3GLB2Q9NR46 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3GLB2Q9NR46 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3GLB2Q9NR46 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3GLB2Q9NR46 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3GLB2Q9NR46 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3GLB2Q9NR46 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3GLB2Q9NR46 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3GLB2Q9NR46 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3GLB2Q9NR46 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3GLB2Q9NR46 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3GLB2Q9NR46 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SH3GLB2Q9NR46 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SH3GLB2Q9NR46 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SH3GLB2Q9NR46 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SH3GLB2Q9NR46 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SH3GLB2Q9NR46 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SH3GLB2Q9NR46 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SH3GLB2Q9NR46 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SH3GLB2Q9NR46 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SH3GLB2Q9NR46 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SH3GLB2Q9NR46 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SH3GLB2Q9NR46 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SH3GLB2Q9NR46 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SH3GLB2Q9NR46 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SH3GLB2Q9NR46 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SH3GLB2Q9NR46 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SH3GLB2Q9NR46 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SH3GLB2Q9NR46 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SH3GLB2Q9NR46 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SH3GLB2Q9NR46 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SH3GLB2Q9NR46 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SH3GLB2Q9NR46 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH3GLB2Q9NR46 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH3GLB2Q9NR46 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH3GLB2Q9NR46 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH3GLB2Q9NR46 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH3GLB2Q9NR46 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH3GLB2Q9NR46 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH3GLB2Q9NR46 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH3GLB2Q9NR46 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH3GLB2Q9NR46 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH3GLB2Q9NR46 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH3GLB2Q9NR46 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH3GLB2Q9NR46 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH3GLB2Q9NR46 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH3GLB2Q9NR46 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH3GLB2Q9NR46 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH3GLB2Q9NR46 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH3GLB2Q9NR46 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH3GLB2Q9NR46 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH3GLB2Q9NR46 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH3GLB2Q9NR46 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH3GLB2Q9NR46 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH3GLB2Q9NR46 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH3GLB2Q9NR46 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH3GLB2Q9NR46 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH3GLB2Q9NR46 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH3GLB2Q9NR46 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH3GLB2Q9NR46 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH3GLB2Q9NR46 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH3GLB2Q9NR46 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH3GLB2Q9NR46 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH3GLB2Q9NR46 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH3GLB2Q9NR46 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH3GLB2Q9NR46 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH3GLB2Q9NR46 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH3GLB2Q9NR46 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH3GLB2Q9NR46 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH3GLB2Q9NR46 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SH3GLB2Q9NR46 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SH3GLB2Q9NR46 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SH3GLB2Q9NR46 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SH3GLB2Q9NR46 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SH3GLB2Q9NR46 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SH3GLB2Q9NR46 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SH3GLB2Q9NR46 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SH3GLB2Q9NR46 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms