Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQS7

INCENP, Inner centromere protein, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INCENPQ9NQS7 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
INCENPQ9NQS7 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
INCENPQ9NQS7 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
INCENPQ9NQS7 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
INCENPQ9NQS7 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
INCENPQ9NQS7 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
INCENPQ9NQS7 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
INCENPQ9NQS7 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
INCENPQ9NQS7 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
INCENPQ9NQS7 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
INCENPQ9NQS7 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
INCENPQ9NQS7 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
INCENPQ9NQS7 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
INCENPQ9NQS7 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
INCENPQ9NQS7 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
INCENPQ9NQS7 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
INCENPQ9NQS7 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
INCENPQ9NQS7 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
INCENPQ9NQS7 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
INCENPQ9NQS7 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
INCENPQ9NQS7 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
INCENPQ9NQS7 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
INCENPQ9NQS7 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
INCENPQ9NQS7 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
INCENPQ9NQS7 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
INCENPQ9NQS7 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
INCENPQ9NQS7 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
INCENPQ9NQS7 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
INCENPQ9NQS7 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
INCENPQ9NQS7 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
INCENPQ9NQS7 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
INCENPQ9NQS7 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
INCENPQ9NQS7 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
INCENPQ9NQS7 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
INCENPQ9NQS7 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
INCENPQ9NQS7 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
INCENPQ9NQS7 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
INCENPQ9NQS7 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
INCENPQ9NQS7 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
INCENPQ9NQS7 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
INCENPQ9NQS7 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
INCENPQ9NQS7 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
INCENPQ9NQS7 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
INCENPQ9NQS7 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
INCENPQ9NQS7 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
INCENPQ9NQS7 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
INCENPQ9NQS7 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
INCENPQ9NQS7 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
INCENPQ9NQS7 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
INCENPQ9NQS7 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
INCENPQ9NQS7 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
INCENPQ9NQS7 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
INCENPQ9NQS7 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
INCENPQ9NQS7 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
INCENPQ9NQS7 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
INCENPQ9NQS7 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
INCENPQ9NQS7 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
INCENPQ9NQS7 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
INCENPQ9NQS7 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
INCENPQ9NQS7 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
INCENPQ9NQS7 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
INCENPQ9NQS7 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
INCENPQ9NQS7 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
INCENPQ9NQS7 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
INCENPQ9NQS7 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
INCENPQ9NQS7 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
INCENPQ9NQS7 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
INCENPQ9NQS7 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
INCENPQ9NQS7 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
INCENPQ9NQS7 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
INCENPQ9NQS7 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
INCENPQ9NQS7 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
INCENPQ9NQS7 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
INCENPQ9NQS7 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
INCENPQ9NQS7 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
INCENPQ9NQS7 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
INCENPQ9NQS7 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
INCENPQ9NQS7 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
INCENPQ9NQS7 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
INCENPQ9NQS7 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
INCENPQ9NQS7 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
INCENPQ9NQS7 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
INCENPQ9NQS7 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
INCENPQ9NQS7 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
INCENPQ9NQS7 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
INCENPQ9NQS7 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
INCENPQ9NQS7 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
INCENPQ9NQS7 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
INCENPQ9NQS7 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
INCENPQ9NQS7 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
INCENPQ9NQS7 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
INCENPQ9NQS7 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
INCENPQ9NQS7 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
INCENPQ9NQS7 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
INCENPQ9NQS7 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
INCENPQ9NQS7 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
INCENPQ9NQS7 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
INCENPQ9NQS7 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
INCENPQ9NQS7 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
INCENPQ9NQS7 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms