Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC97Q96F63 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC97Q96F63 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC97Q96F63 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC97Q96F63 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC97Q96F63 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC97Q96F63 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC97Q96F63 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC97Q96F63 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC97Q96F63 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC97Q96F63 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC97Q96F63 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC97Q96F63 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC97Q96F63 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC97Q96F63 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC97Q96F63 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC97Q96F63 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC97Q96F63 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC97Q96F63 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC97Q96F63 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC97Q96F63 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC97Q96F63 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC97Q96F63 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC97Q96F63 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC97Q96F63 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC97Q96F63 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC97Q96F63 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC97Q96F63 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC97Q96F63 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC97Q96F63 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC97Q96F63 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC97Q96F63 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC97Q96F63 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC97Q96F63 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC97Q96F63 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC97Q96F63 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC97Q96F63 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC97Q96F63 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC97Q96F63 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC97Q96F63 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC97Q96F63 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC97Q96F63 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC97Q96F63 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC97Q96F63 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC97Q96F63 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC97Q96F63 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC97Q96F63 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC97Q96F63 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC97Q96F63 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC97Q96F63 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC97Q96F63 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC97Q96F63 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC97Q96F63 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC97Q96F63 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC97Q96F63 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC97Q96F63 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC97Q96F63 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC97Q96F63 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC97Q96F63 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC97Q96F63 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC97Q96F63 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC97Q96F63 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC97Q96F63 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC97Q96F63 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC97Q96F63 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC97Q96F63 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC97Q96F63 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC97Q96F63 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC97Q96F63 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC97Q96F63 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC97Q96F63 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC97Q96F63 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC97Q96F63 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC97Q96F63 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC97Q96F63 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC97Q96F63 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC97Q96F63 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC97Q96F63 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC97Q96F63 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC97Q96F63 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC97Q96F63 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC97Q96F63 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC97Q96F63 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC97Q96F63 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC97Q96F63 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC97Q96F63 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC97Q96F63 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC97Q96F63 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC97Q96F63 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC97Q96F63 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC97Q96F63 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC97Q96F63 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC97Q96F63 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC97Q96F63 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC97Q96F63 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC97Q96F63 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC97Q96F63 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC97Q96F63 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC97Q96F63 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC97Q96F63 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms