Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 71 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPTSSAQ969W0 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPTSSAQ969W0 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPTSSAQ969W0 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPTSSAQ969W0 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SPTSSAQ969W0 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SPTSSAQ969W0 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPTSSAQ969W0 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPTSSAQ969W0 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPTSSAQ969W0 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPTSSAQ969W0 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPTSSAQ969W0 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SPTSSAQ969W0 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SPTSSAQ969W0 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPTSSAQ969W0 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SPTSSAQ969W0 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SPTSSAQ969W0 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPTSSAQ969W0 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPTSSAQ969W0 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPTSSAQ969W0 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPTSSAQ969W0 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPTSSAQ969W0 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPTSSAQ969W0 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPTSSAQ969W0 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPTSSAQ969W0 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPTSSAQ969W0 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPTSSAQ969W0 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPTSSAQ969W0 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPTSSAQ969W0 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPTSSAQ969W0 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPTSSAQ969W0 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPTSSAQ969W0 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SPTSSAQ969W0 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPTSSAQ969W0 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPTSSAQ969W0 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPTSSAQ969W0 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPTSSAQ969W0 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPTSSAQ969W0 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPTSSAQ969W0 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPTSSAQ969W0 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SPTSSAQ969W0 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPTSSAQ969W0 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPTSSAQ969W0 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPTSSAQ969W0 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPTSSAQ969W0 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPTSSAQ969W0 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPTSSAQ969W0 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPTSSAQ969W0 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPTSSAQ969W0 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPTSSAQ969W0 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPTSSAQ969W0 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPTSSAQ969W0 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPTSSAQ969W0 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPTSSAQ969W0 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPTSSAQ969W0 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SPTSSAQ969W0 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPTSSAQ969W0 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPTSSAQ969W0 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SPTSSAQ969W0 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPTSSAQ969W0 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPTSSAQ969W0 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPTSSAQ969W0 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPTSSAQ969W0 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SPTSSAQ969W0 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPTSSAQ969W0 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPTSSAQ969W0 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPTSSAQ969W0 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPTSSAQ969W0 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPTSSAQ969W0 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPTSSAQ969W0 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPTSSAQ969W0 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SPTSSAQ969W0 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPTSSAQ969W0 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPTSSAQ969W0 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPTSSAQ969W0 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPTSSAQ969W0 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPTSSAQ969W0 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPTSSAQ969W0 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPTSSAQ969W0 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPTSSAQ969W0 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPTSSAQ969W0 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPTSSAQ969W0 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPTSSAQ969W0 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPTSSAQ969W0 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPTSSAQ969W0 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPTSSAQ969W0 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPTSSAQ969W0 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPTSSAQ969W0 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPTSSAQ969W0 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPTSSAQ969W0 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPTSSAQ969W0 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPTSSAQ969W0 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPTSSAQ969W0 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPTSSAQ969W0 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPTSSAQ969W0 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPTSSAQ969W0 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPTSSAQ969W0 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPTSSAQ969W0 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPTSSAQ969W0 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPTSSAQ969W0 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms