Protein–RNA interactions for Protein: Q925E8

Sptssb, Serine palmitoyltransferase small subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 76 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptssbQ925E8 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms