Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4N3

Defb12, Beta-defensin 12, mousemouse

Predictions only

Length 78 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defb12Q8K4N3 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Defb12Q8K4N3 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Defb12Q8K4N3 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Defb12Q8K4N3 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Defb12Q8K4N3 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Defb12Q8K4N3 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Defb12Q8K4N3 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Defb12Q8K4N3 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Defb12Q8K4N3 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Defb12Q8K4N3 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Defb12Q8K4N3 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Defb12Q8K4N3 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Defb12Q8K4N3 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Defb12Q8K4N3 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Defb12Q8K4N3 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Defb12Q8K4N3 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Defb12Q8K4N3 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Defb12Q8K4N3 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Defb12Q8K4N3 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defb12Q8K4N3 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defb12Q8K4N3 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defb12Q8K4N3 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defb12Q8K4N3 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defb12Q8K4N3 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defb12Q8K4N3 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Defb12Q8K4N3 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defb12Q8K4N3 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defb12Q8K4N3 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defb12Q8K4N3 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defb12Q8K4N3 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Defb12Q8K4N3 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Defb12Q8K4N3 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Defb12Q8K4N3 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defb12Q8K4N3 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Defb12Q8K4N3 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Defb12Q8K4N3 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Defb12Q8K4N3 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Defb12Q8K4N3 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defb12Q8K4N3 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defb12Q8K4N3 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defb12Q8K4N3 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defb12Q8K4N3 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defb12Q8K4N3 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Defb12Q8K4N3 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defb12Q8K4N3 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC11□□□□□ -0.65
Defb12Q8K4N3 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Defb12Q8K4N3 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defb12Q8K4N3 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defb12Q8K4N3 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defb12Q8K4N3 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defb12Q8K4N3 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defb12Q8K4N3 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defb12Q8K4N3 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defb12Q8K4N3 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defb12Q8K4N3 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defb12Q8K4N3 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defb12Q8K4N3 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defb12Q8K4N3 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defb12Q8K4N3 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defb12Q8K4N3 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defb12Q8K4N3 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defb12Q8K4N3 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defb12Q8K4N3 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defb12Q8K4N3 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defb12Q8K4N3 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defb12Q8K4N3 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defb12Q8K4N3 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defb12Q8K4N3 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
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Defb12Q8K4N3 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defb12Q8K4N3 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defb12Q8K4N3 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defb12Q8K4N3 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defb12Q8K4N3 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defb12Q8K4N3 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defb12Q8K4N3 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defb12Q8K4N3 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defb12Q8K4N3 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defb12Q8K4N3 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defb12Q8K4N3 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defb12Q8K4N3 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defb12Q8K4N3 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defb12Q8K4N3 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defb12Q8K4N3 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defb12Q8K4N3 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defb12Q8K4N3 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defb12Q8K4N3 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defb12Q8K4N3 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defb12Q8K4N3 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defb12Q8K4N3 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defb12Q8K4N3 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defb12Q8K4N3 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defb12Q8K4N3 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defb12Q8K4N3 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defb12Q8K4N3 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defb12Q8K4N3 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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