Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3C6

ATG9A, Autophagy-related protein 9A, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG9AQ7Z3C6 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATG9AQ7Z3C6 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATG9AQ7Z3C6 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATG9AQ7Z3C6 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATG9AQ7Z3C6 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATG9AQ7Z3C6 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATG9AQ7Z3C6 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATG9AQ7Z3C6 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATG9AQ7Z3C6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATG9AQ7Z3C6 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATG9AQ7Z3C6 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATG9AQ7Z3C6 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATG9AQ7Z3C6 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATG9AQ7Z3C6 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATG9AQ7Z3C6 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATG9AQ7Z3C6 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATG9AQ7Z3C6 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATG9AQ7Z3C6 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATG9AQ7Z3C6 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATG9AQ7Z3C6 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATG9AQ7Z3C6 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATG9AQ7Z3C6 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATG9AQ7Z3C6 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATG9AQ7Z3C6 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATG9AQ7Z3C6 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATG9AQ7Z3C6 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATG9AQ7Z3C6 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
ATG9AQ7Z3C6 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
ATG9AQ7Z3C6 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATG9AQ7Z3C6 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATG9AQ7Z3C6 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATG9AQ7Z3C6 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATG9AQ7Z3C6 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATG9AQ7Z3C6 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATG9AQ7Z3C6 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATG9AQ7Z3C6 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATG9AQ7Z3C6 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ATG9AQ7Z3C6 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATG9AQ7Z3C6 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATG9AQ7Z3C6 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ATG9AQ7Z3C6 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATG9AQ7Z3C6 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATG9AQ7Z3C6 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATG9AQ7Z3C6 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATG9AQ7Z3C6 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATG9AQ7Z3C6 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATG9AQ7Z3C6 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATG9AQ7Z3C6 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATG9AQ7Z3C6 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATG9AQ7Z3C6 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATG9AQ7Z3C6 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATG9AQ7Z3C6 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ATG9AQ7Z3C6 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATG9AQ7Z3C6 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATG9AQ7Z3C6 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATG9AQ7Z3C6 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATG9AQ7Z3C6 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATG9AQ7Z3C6 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATG9AQ7Z3C6 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ATG9AQ7Z3C6 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATG9AQ7Z3C6 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATG9AQ7Z3C6 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ATG9AQ7Z3C6 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATG9AQ7Z3C6 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATG9AQ7Z3C6 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATG9AQ7Z3C6 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATG9AQ7Z3C6 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATG9AQ7Z3C6 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATG9AQ7Z3C6 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATG9AQ7Z3C6 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATG9AQ7Z3C6 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATG9AQ7Z3C6 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATG9AQ7Z3C6 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATG9AQ7Z3C6 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATG9AQ7Z3C6 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATG9AQ7Z3C6 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ATG9AQ7Z3C6 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ATG9AQ7Z3C6 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATG9AQ7Z3C6 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ATG9AQ7Z3C6 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATG9AQ7Z3C6 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATG9AQ7Z3C6 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATG9AQ7Z3C6 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATG9AQ7Z3C6 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ATG9AQ7Z3C6 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATG9AQ7Z3C6 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATG9AQ7Z3C6 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATG9AQ7Z3C6 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ATG9AQ7Z3C6 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATG9AQ7Z3C6 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATG9AQ7Z3C6 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATG9AQ7Z3C6 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATG9AQ7Z3C6 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATG9AQ7Z3C6 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATG9AQ7Z3C6 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATG9AQ7Z3C6 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATG9AQ7Z3C6 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATG9AQ7Z3C6 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATG9AQ7Z3C6 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATG9AQ7Z3C6 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms