Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD62

CTR9, RNA polymerase-associated protein CTR9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTR9Q6PD62 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTR9Q6PD62 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTR9Q6PD62 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTR9Q6PD62 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTR9Q6PD62 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTR9Q6PD62 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTR9Q6PD62 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTR9Q6PD62 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CTR9Q6PD62 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CTR9Q6PD62 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTR9Q6PD62 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTR9Q6PD62 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTR9Q6PD62 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTR9Q6PD62 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CTR9Q6PD62 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTR9Q6PD62 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTR9Q6PD62 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTR9Q6PD62 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTR9Q6PD62 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTR9Q6PD62 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTR9Q6PD62 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTR9Q6PD62 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTR9Q6PD62 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTR9Q6PD62 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTR9Q6PD62 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTR9Q6PD62 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTR9Q6PD62 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTR9Q6PD62 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTR9Q6PD62 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTR9Q6PD62 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTR9Q6PD62 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTR9Q6PD62 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTR9Q6PD62 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTR9Q6PD62 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTR9Q6PD62 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTR9Q6PD62 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTR9Q6PD62 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTR9Q6PD62 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CTR9Q6PD62 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTR9Q6PD62 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTR9Q6PD62 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTR9Q6PD62 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTR9Q6PD62 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTR9Q6PD62 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTR9Q6PD62 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTR9Q6PD62 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTR9Q6PD62 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTR9Q6PD62 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTR9Q6PD62 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTR9Q6PD62 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTR9Q6PD62 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTR9Q6PD62 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTR9Q6PD62 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTR9Q6PD62 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTR9Q6PD62 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTR9Q6PD62 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTR9Q6PD62 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTR9Q6PD62 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTR9Q6PD62 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTR9Q6PD62 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTR9Q6PD62 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTR9Q6PD62 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTR9Q6PD62 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTR9Q6PD62 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTR9Q6PD62 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTR9Q6PD62 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTR9Q6PD62 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTR9Q6PD62 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTR9Q6PD62 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTR9Q6PD62 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTR9Q6PD62 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CTR9Q6PD62 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTR9Q6PD62 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTR9Q6PD62 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTR9Q6PD62 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTR9Q6PD62 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTR9Q6PD62 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTR9Q6PD62 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTR9Q6PD62 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTR9Q6PD62 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTR9Q6PD62 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTR9Q6PD62 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTR9Q6PD62 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTR9Q6PD62 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTR9Q6PD62 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTR9Q6PD62 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTR9Q6PD62 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTR9Q6PD62 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CTR9Q6PD62 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTR9Q6PD62 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CTR9Q6PD62 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTR9Q6PD62 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTR9Q6PD62 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CTR9Q6PD62 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTR9Q6PD62 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTR9Q6PD62 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTR9Q6PD62 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CTR9Q6PD62 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CTR9Q6PD62 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CTR9Q6PD62 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms