Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRH9

TTC39A, Tetratricopeptide repeat protein 39A, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC39AQ5SRH9 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTC39AQ5SRH9 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTC39AQ5SRH9 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTC39AQ5SRH9 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTC39AQ5SRH9 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTC39AQ5SRH9 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTC39AQ5SRH9 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TTC39AQ5SRH9 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TTC39AQ5SRH9 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TTC39AQ5SRH9 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TTC39AQ5SRH9 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TTC39AQ5SRH9 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TTC39AQ5SRH9 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TTC39AQ5SRH9 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TTC39AQ5SRH9 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TTC39AQ5SRH9 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TTC39AQ5SRH9 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TTC39AQ5SRH9 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TTC39AQ5SRH9 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TTC39AQ5SRH9 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TTC39AQ5SRH9 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TTC39AQ5SRH9 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TTC39AQ5SRH9 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TTC39AQ5SRH9 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TTC39AQ5SRH9 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TTC39AQ5SRH9 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TTC39AQ5SRH9 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TTC39AQ5SRH9 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TTC39AQ5SRH9 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TTC39AQ5SRH9 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TTC39AQ5SRH9 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TTC39AQ5SRH9 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TTC39AQ5SRH9 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TTC39AQ5SRH9 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TTC39AQ5SRH9 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTC39AQ5SRH9 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTC39AQ5SRH9 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTC39AQ5SRH9 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TTC39AQ5SRH9 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTC39AQ5SRH9 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TTC39AQ5SRH9 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTC39AQ5SRH9 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTC39AQ5SRH9 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTC39AQ5SRH9 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTC39AQ5SRH9 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTC39AQ5SRH9 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTC39AQ5SRH9 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTC39AQ5SRH9 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTC39AQ5SRH9 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTC39AQ5SRH9 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTC39AQ5SRH9 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TTC39AQ5SRH9 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TTC39AQ5SRH9 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TTC39AQ5SRH9 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TTC39AQ5SRH9 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TTC39AQ5SRH9 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TTC39AQ5SRH9 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TTC39AQ5SRH9 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TTC39AQ5SRH9 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TTC39AQ5SRH9 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TTC39AQ5SRH9 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TTC39AQ5SRH9 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TTC39AQ5SRH9 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TTC39AQ5SRH9 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TTC39AQ5SRH9 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TTC39AQ5SRH9 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TTC39AQ5SRH9 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TTC39AQ5SRH9 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TTC39AQ5SRH9 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TTC39AQ5SRH9 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TTC39AQ5SRH9 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TTC39AQ5SRH9 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TTC39AQ5SRH9 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TTC39AQ5SRH9 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TTC39AQ5SRH9 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TTC39AQ5SRH9 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TTC39AQ5SRH9 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TTC39AQ5SRH9 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TTC39AQ5SRH9 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TTC39AQ5SRH9 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TTC39AQ5SRH9 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TTC39AQ5SRH9 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TTC39AQ5SRH9 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TTC39AQ5SRH9 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TTC39AQ5SRH9 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TTC39AQ5SRH9 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TTC39AQ5SRH9 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTC39AQ5SRH9 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTC39AQ5SRH9 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTC39AQ5SRH9 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTC39AQ5SRH9 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTC39AQ5SRH9 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTC39AQ5SRH9 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTC39AQ5SRH9 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTC39AQ5SRH9 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTC39AQ5SRH9 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTC39AQ5SRH9 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TTC39AQ5SRH9 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTC39AQ5SRH9 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTC39AQ5SRH9 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms