Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
NTRK2Q16620 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NTRK2Q16620 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NTRK2Q16620 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NTRK2Q16620 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NTRK2Q16620 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NTRK2Q16620 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NTRK2Q16620 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
NTRK2Q16620 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
NTRK2Q16620 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
NTRK2Q16620 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
NTRK2Q16620 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
NTRK2Q16620 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NTRK2Q16620 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NTRK2Q16620 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NTRK2Q16620 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NTRK2Q16620 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NTRK2Q16620 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NTRK2Q16620 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NTRK2Q16620 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NTRK2Q16620 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NTRK2Q16620 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NTRK2Q16620 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NTRK2Q16620 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NTRK2Q16620 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NTRK2Q16620 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NTRK2Q16620 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NTRK2Q16620 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NTRK2Q16620 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NTRK2Q16620 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
NTRK2Q16620 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NTRK2Q16620 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NTRK2Q16620 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
NTRK2Q16620 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
NTRK2Q16620 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NTRK2Q16620 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NTRK2Q16620 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NTRK2Q16620 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
NTRK2Q16620 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NTRK2Q16620 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NTRK2Q16620 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NTRK2Q16620 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NTRK2Q16620 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
NTRK2Q16620 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NTRK2Q16620 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NTRK2Q16620 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NTRK2Q16620 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NTRK2Q16620 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NTRK2Q16620 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NTRK2Q16620 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NTRK2Q16620 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
NTRK2Q16620 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NTRK2Q16620 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
NTRK2Q16620 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NTRK2Q16620 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NTRK2Q16620 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NTRK2Q16620 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NTRK2Q16620 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NTRK2Q16620 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NTRK2Q16620 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NTRK2Q16620 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NTRK2Q16620 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NTRK2Q16620 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NTRK2Q16620 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NTRK2Q16620 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NTRK2Q16620 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NTRK2Q16620 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NTRK2Q16620 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NTRK2Q16620 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NTRK2Q16620 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NTRK2Q16620 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NTRK2Q16620 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NTRK2Q16620 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NTRK2Q16620 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NTRK2Q16620 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NTRK2Q16620 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NTRK2Q16620 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NTRK2Q16620 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NTRK2Q16620 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NTRK2Q16620 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NTRK2Q16620 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NTRK2Q16620 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NTRK2Q16620 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NTRK2Q16620 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NTRK2Q16620 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NTRK2Q16620 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NTRK2Q16620 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NTRK2Q16620 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NTRK2Q16620 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NTRK2Q16620 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NTRK2Q16620 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NTRK2Q16620 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NTRK2Q16620 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NTRK2Q16620 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NTRK2Q16620 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NTRK2Q16620 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NTRK2Q16620 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NTRK2Q16620 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NTRK2Q16620 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NTRK2Q16620 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
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