Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP6AP1Q15904 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP6AP1Q15904 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP6AP1Q15904 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP6AP1Q15904 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP6AP1Q15904 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP6AP1Q15904 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP6AP1Q15904 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP6AP1Q15904 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP6AP1Q15904 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP6AP1Q15904 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP6AP1Q15904 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP6AP1Q15904 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP6AP1Q15904 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP6AP1Q15904 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP6AP1Q15904 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP6AP1Q15904 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP6AP1Q15904 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP6AP1Q15904 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP6AP1Q15904 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP6AP1Q15904 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP6AP1Q15904 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP6AP1Q15904 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP6AP1Q15904 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP6AP1Q15904 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP6AP1Q15904 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP6AP1Q15904 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP6AP1Q15904 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP6AP1Q15904 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP6AP1Q15904 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP6AP1Q15904 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP6AP1Q15904 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP6AP1Q15904 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP6AP1Q15904 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP6AP1Q15904 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP6AP1Q15904 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP6AP1Q15904 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP6AP1Q15904 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP6AP1Q15904 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP6AP1Q15904 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP6AP1Q15904 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP6AP1Q15904 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATP6AP1Q15904 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP6AP1Q15904 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP6AP1Q15904 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP6AP1Q15904 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP6AP1Q15904 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP6AP1Q15904 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP6AP1Q15904 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP6AP1Q15904 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP6AP1Q15904 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP6AP1Q15904 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP6AP1Q15904 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP6AP1Q15904 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP6AP1Q15904 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP6AP1Q15904 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP6AP1Q15904 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP6AP1Q15904 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP6AP1Q15904 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP6AP1Q15904 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP6AP1Q15904 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP6AP1Q15904 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP6AP1Q15904 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP6AP1Q15904 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP6AP1Q15904 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP6AP1Q15904 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP6AP1Q15904 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP6AP1Q15904 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP6AP1Q15904 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP6AP1Q15904 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP6AP1Q15904 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP6AP1Q15904 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP6AP1Q15904 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP6AP1Q15904 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP6AP1Q15904 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP6AP1Q15904 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP6AP1Q15904 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP6AP1Q15904 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP6AP1Q15904 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP6AP1Q15904 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP6AP1Q15904 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP6AP1Q15904 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP6AP1Q15904 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP6AP1Q15904 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP6AP1Q15904 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP6AP1Q15904 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP6AP1Q15904 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP6AP1Q15904 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP6AP1Q15904 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ATP6AP1Q15904 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ATP6AP1Q15904 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ATP6AP1Q15904 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP6AP1Q15904 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP6AP1Q15904 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP6AP1Q15904 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP6AP1Q15904 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP6AP1Q15904 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP6AP1Q15904 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP6AP1Q15904 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP6AP1Q15904 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
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