Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNHIT3Q15649 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNHIT3Q15649 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNHIT3Q15649 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNHIT3Q15649 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNHIT3Q15649 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNHIT3Q15649 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNHIT3Q15649 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNHIT3Q15649 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNHIT3Q15649 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNHIT3Q15649 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNHIT3Q15649 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNHIT3Q15649 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNHIT3Q15649 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNHIT3Q15649 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNHIT3Q15649 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNHIT3Q15649 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNHIT3Q15649 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNHIT3Q15649 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNHIT3Q15649 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNHIT3Q15649 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNHIT3Q15649 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNHIT3Q15649 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNHIT3Q15649 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNHIT3Q15649 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNHIT3Q15649 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNHIT3Q15649 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNHIT3Q15649 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNHIT3Q15649 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNHIT3Q15649 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNHIT3Q15649 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNHIT3Q15649 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNHIT3Q15649 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNHIT3Q15649 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNHIT3Q15649 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNHIT3Q15649 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNHIT3Q15649 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNHIT3Q15649 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNHIT3Q15649 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNHIT3Q15649 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNHIT3Q15649 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNHIT3Q15649 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNHIT3Q15649 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNHIT3Q15649 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNHIT3Q15649 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNHIT3Q15649 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNHIT3Q15649 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNHIT3Q15649 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNHIT3Q15649 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNHIT3Q15649 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNHIT3Q15649 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNHIT3Q15649 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNHIT3Q15649 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNHIT3Q15649 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNHIT3Q15649 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNHIT3Q15649 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNHIT3Q15649 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNHIT3Q15649 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNHIT3Q15649 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNHIT3Q15649 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNHIT3Q15649 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNHIT3Q15649 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNHIT3Q15649 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNHIT3Q15649 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNHIT3Q15649 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNHIT3Q15649 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNHIT3Q15649 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNHIT3Q15649 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNHIT3Q15649 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNHIT3Q15649 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNHIT3Q15649 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNHIT3Q15649 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNHIT3Q15649 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNHIT3Q15649 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZNHIT3Q15649 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZNHIT3Q15649 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZNHIT3Q15649 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZNHIT3Q15649 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZNHIT3Q15649 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZNHIT3Q15649 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZNHIT3Q15649 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZNHIT3Q15649 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZNHIT3Q15649 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZNHIT3Q15649 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZNHIT3Q15649 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZNHIT3Q15649 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZNHIT3Q15649 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZNHIT3Q15649 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZNHIT3Q15649 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNHIT3Q15649 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNHIT3Q15649 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNHIT3Q15649 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNHIT3Q15649 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNHIT3Q15649 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNHIT3Q15649 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNHIT3Q15649 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNHIT3Q15649 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNHIT3Q15649 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNHIT3Q15649 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNHIT3Q15649 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
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