Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXE3Q13461 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXE3Q13461 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXE3Q13461 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXE3Q13461 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXE3Q13461 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXE3Q13461 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXE3Q13461 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXE3Q13461 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXE3Q13461 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXE3Q13461 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXE3Q13461 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXE3Q13461 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXE3Q13461 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXE3Q13461 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXE3Q13461 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXE3Q13461 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXE3Q13461 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXE3Q13461 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXE3Q13461 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXE3Q13461 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXE3Q13461 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXE3Q13461 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXE3Q13461 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXE3Q13461 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXE3Q13461 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXE3Q13461 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXE3Q13461 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXE3Q13461 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXE3Q13461 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXE3Q13461 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXE3Q13461 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXE3Q13461 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXE3Q13461 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXE3Q13461 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXE3Q13461 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXE3Q13461 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXE3Q13461 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXE3Q13461 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXE3Q13461 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXE3Q13461 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXE3Q13461 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXE3Q13461 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXE3Q13461 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXE3Q13461 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXE3Q13461 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXE3Q13461 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXE3Q13461 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXE3Q13461 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXE3Q13461 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXE3Q13461 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXE3Q13461 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXE3Q13461 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXE3Q13461 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXE3Q13461 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXE3Q13461 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXE3Q13461 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXE3Q13461 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXE3Q13461 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXE3Q13461 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXE3Q13461 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXE3Q13461 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXE3Q13461 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXE3Q13461 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXE3Q13461 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXE3Q13461 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXE3Q13461 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXE3Q13461 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXE3Q13461 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXE3Q13461 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXE3Q13461 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXE3Q13461 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXE3Q13461 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXE3Q13461 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXE3Q13461 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXE3Q13461 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXE3Q13461 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXE3Q13461 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXE3Q13461 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXE3Q13461 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXE3Q13461 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXE3Q13461 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXE3Q13461 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXE3Q13461 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXE3Q13461 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXE3Q13461 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXE3Q13461 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXE3Q13461 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXE3Q13461 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXE3Q13461 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXE3Q13461 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXE3Q13461 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXE3Q13461 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXE3Q13461 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXE3Q13461 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXE3Q13461 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXE3Q13461 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXE3Q13461 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXE3Q13461 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXE3Q13461 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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