Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GRIK3Q13003 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GRIK3Q13003 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GRIK3Q13003 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GRIK3Q13003 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GRIK3Q13003 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GRIK3Q13003 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIK3Q13003 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIK3Q13003 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIK3Q13003 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIK3Q13003 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIK3Q13003 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIK3Q13003 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIK3Q13003 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIK3Q13003 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIK3Q13003 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIK3Q13003 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIK3Q13003 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIK3Q13003 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIK3Q13003 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIK3Q13003 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIK3Q13003 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIK3Q13003 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIK3Q13003 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIK3Q13003 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GRIK3Q13003 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GRIK3Q13003 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GRIK3Q13003 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GRIK3Q13003 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GRIK3Q13003 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GRIK3Q13003 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GRIK3Q13003 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GRIK3Q13003 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GRIK3Q13003 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
GRIK3Q13003 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GRIK3Q13003 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GRIK3Q13003 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GRIK3Q13003 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GRIK3Q13003 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRIK3Q13003 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRIK3Q13003 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRIK3Q13003 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRIK3Q13003 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRIK3Q13003 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRIK3Q13003 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRIK3Q13003 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRIK3Q13003 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRIK3Q13003 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRIK3Q13003 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRIK3Q13003 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRIK3Q13003 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRIK3Q13003 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRIK3Q13003 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRIK3Q13003 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRIK3Q13003 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRIK3Q13003 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRIK3Q13003 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRIK3Q13003 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRIK3Q13003 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRIK3Q13003 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRIK3Q13003 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
GRIK3Q13003 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRIK3Q13003 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRIK3Q13003 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
GRIK3Q13003 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRIK3Q13003 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
GRIK3Q13003 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GRIK3Q13003 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GRIK3Q13003 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GRIK3Q13003 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GRIK3Q13003 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GRIK3Q13003 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GRIK3Q13003 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
GRIK3Q13003 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GRIK3Q13003 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GRIK3Q13003 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GRIK3Q13003 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GRIK3Q13003 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GRIK3Q13003 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GRIK3Q13003 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GRIK3Q13003 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GRIK3Q13003 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GRIK3Q13003 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GRIK3Q13003 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GRIK3Q13003 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GRIK3Q13003 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GRIK3Q13003 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GRIK3Q13003 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRIK3Q13003 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRIK3Q13003 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRIK3Q13003 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRIK3Q13003 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRIK3Q13003 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRIK3Q13003 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRIK3Q13003 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRIK3Q13003 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRIK3Q13003 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRIK3Q13003 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRIK3Q13003 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRIK3Q13003 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
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