Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PTP4A2Q12974 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTP4A2Q12974 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTP4A2Q12974 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTP4A2Q12974 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTP4A2Q12974 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTP4A2Q12974 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTP4A2Q12974 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTP4A2Q12974 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTP4A2Q12974 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTP4A2Q12974 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTP4A2Q12974 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PTP4A2Q12974 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PTP4A2Q12974 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PTP4A2Q12974 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21■□□□□ 0.95
PTP4A2Q12974 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTP4A2Q12974 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PTP4A2Q12974 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTP4A2Q12974 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTP4A2Q12974 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21■□□□□ 0.95
PTP4A2Q12974 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PTP4A2Q12974 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PTP4A2Q12974 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTP4A2Q12974 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTP4A2Q12974 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTP4A2Q12974 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PTP4A2Q12974 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PTP4A2Q12974 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PTP4A2Q12974 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTP4A2Q12974 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PTP4A2Q12974 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTP4A2Q12974 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTP4A2Q12974 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTP4A2Q12974 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTP4A2Q12974 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTP4A2Q12974 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTP4A2Q12974 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTP4A2Q12974 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTP4A2Q12974 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTP4A2Q12974 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTP4A2Q12974 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTP4A2Q12974 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
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PTP4A2Q12974 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
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PTP4A2Q12974 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTP4A2Q12974 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
PTP4A2Q12974 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTP4A2Q12974 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTP4A2Q12974 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTP4A2Q12974 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
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PTP4A2Q12974 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
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PTP4A2Q12974 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
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PTP4A2Q12974 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTP4A2Q12974 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTP4A2Q12974 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTP4A2Q12974 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
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PTP4A2Q12974 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTP4A2Q12974 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTP4A2Q12974 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTP4A2Q12974 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTP4A2Q12974 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTP4A2Q12974 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTP4A2Q12974 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
PTP4A2Q12974 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
PTP4A2Q12974 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
PTP4A2Q12974 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
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PTP4A2Q12974 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
PTP4A2Q12974 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTP4A2Q12974 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTP4A2Q12974 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTP4A2Q12974 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTP4A2Q12974 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTP4A2Q12974 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
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