Protein–RNA interactions for Protein: Q12675

DNF2, Phospholipid-transporting ATPase DNF2, yeastyeast

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DNF2Q12675 YOL155W-AYOL155W-A 135 nt-3.84□□□□□ -3.02
DNF2Q12675 YER006C-AYER006C-A 318 nt-3.84□□□□□ -3.02
DNF2Q12675 snR55snR55 98 nt-3.86□□□□□ -3.03
DNF2Q12675 YNL028WYNL028W 318 nt-3.88□□□□□ -3.03
DNF2Q12675 YOR381W-AYOR381W-A 168 nt-3.89□□□□□ -3.03
DNF2Q12675 YJR157WYJR157W 363 nt-3.9□□□□□ -3.03
DNF2Q12675 YNL324WYNL324W 396 nt-3.91□□□□□ -3.03
DNF2Q12675 YLR406C-AYLR406C-A 150 nt-3.92□□□□□ -3.04
DNF2Q12675 YOL013W-BYOL013W-B 291 nt-3.94□□□□□ -3.04
DNF2Q12675 ATP6Q0085 780 nt-3.95□□□□□ -3.04
DNF2Q12675 YOL038C-AYOL038C-A 96 nt-3.95□□□□□ -3.04
DNF2Q12675 YHR180C-BYHR180C-B 105 nt-3.96□□□□□ -3.04
DNF2Q12675 YPR012WYPR012W 255 nt-3.97□□□□□ -3.04
DNF2Q12675 YAL016C-BYAL016C-B 186 nt-3.99□□□□□ -3.05
DNF2Q12675 snR41snR41 95 nt-3.99□□□□□ -3.05
DNF2Q12675 snR73snR73 106 nt-4.03□□□□□ -3.05
DNF2Q12675 YAL066WYAL066W 309 nt-4.03□□□□□ -3.06
DNF2Q12675 YLR299C-AYLR299C-A 93 nt-4.05□□□□□ -3.06
DNF2Q12675 snR80snR80 171 nt-4.06□□□□□ -3.06
DNF2Q12675 YNL198CYNL198C 303 nt-4.06□□□□□ -3.06
DNF2Q12675 YGL041CYGL041C 204 nt-4.06□□□□□ -3.06
DNF2Q12675 YMR001C-AYMR001C-A 231 nt-4.06□□□□□ -3.06
DNF2Q12675 YJL150WYJL150W 303 nt-4.09□□□□□ -3.06
DNF2Q12675 YKL106C-AYKL106C-A 120 nt-4.13□□□□□ -3.07
DNF2Q12675 YLR120W-AYLR120W-A 102 nt-4.13□□□□□ -3.07
DNF2Q12675 YLR434CYLR434C 384 nt-4.13□□□□□ -3.07
DNF2Q12675 YOR329W-AYOR329W-A 210 nt-4.13□□□□□ -3.07
DNF2Q12675 YOR335W-AYOR335W-A 81 nt-4.13□□□□□ -3.07
DNF2Q12675 snR78snR78 87 nt-4.14□□□□□ -3.07
DNF2Q12675 YEL014CYEL014C 306 nt-4.21□□□□□ -3.08
DNF2Q12675 RPL41BYDL133C-A 78 nt-4.25□□□□□ -3.09
DNF2Q12675 tW(UCA)QtW(UCA)Q 74 nt-4.25□□□□□ -3.09
DNF2Q12675 HTL1YCR020W-B 237 nt-4.28□□□□□ -3.1
DNF2Q12675 YDR413CYDR413C 576 nt-4.3□□□□□ -3.1
DNF2Q12675 BIL1YOR304C-A 231 nt-4.35□□□□□ -3.11
DNF2Q12675 YJL047C-AYJL047C-A 135 nt-4.39□□□□□ -3.11
DNF2Q12675 YOR102WYOR102W 351 nt-4.42□□□□□ -3.12
DNF2Q12675 YLR222C-AYLR222C-A 231 nt-4.43□□□□□ -3.12
DNF2Q12675 Q0255Q0255 1419 nt-4.44□□□□□ -3.12
DNF2Q12675 snR87snR87 109 nt-4.5□□□□□ -3.13
DNF2Q12675 YNL122CYNL122C 348 nt-4.51□□□□□ -3.13
DNF2Q12675 YBR109W-AYBR109W-A 225 nt-4.56□□□□□ -3.14
DNF2Q12675 YKL123WYKL123W 381 nt-4.63□□□□□ -3.15
DNF2Q12675 YGR035CYGR035C 351 nt-4.66□□□□□ -3.16
DNF2Q12675 YBR131C-AYBR131C-A 90 nt-4.67□□□□□ -3.16
DNF2Q12675 YGL188C-AYGL188C-A 141 nt-4.68□□□□□ -3.16
DNF2Q12675 snR48snR48 113 nt-4.72□□□□□ -3.17
DNF2Q12675 YKL118WYKL118W 312 nt-4.74□□□□□ -3.17
DNF2Q12675 YAL063C-AYAL063C-A 291 nt-4.77□□□□□ -3.17
DNF2Q12675 RPL41AYDL184C 78 nt-4.8□□□□□ -3.18
DNF2Q12675 tF(GAA)QtF(GAA)Q 75 nt-4.8□□□□□ -3.18
DNF2Q12675 YDR183C-AYDR183C-A 258 nt-4.83□□□□□ -3.18
DNF2Q12675 YBR296C-AYBR296C-A 120 nt-4.83□□□□□ -3.18
DNF2Q12675 YDR406W-AYDR406W-A 246 nt-4.87□□□□□ -3.19
DNF2Q12675 snR38snR38 95 nt-4.88□□□□□ -3.19
DNF2Q12675 tL(UAA)QtL(UAA)Q 85 nt-4.92□□□□□ -3.2
DNF2Q12675 YLR285C-AYLR285C-A 171 nt-4.94□□□□□ -3.2
DNF2Q12675 YNL097C-BYNL097C-B 123 nt-4.96□□□□□ -3.2
DNF2Q12675 GIM4YEL003W 336 nt-4.97□□□□□ -3.21
DNF2Q12675 snR56snR56 88 nt-4.98□□□□□ -3.21
DNF2Q12675 YPL038W-AYPL038W-A 192 nt-4.99□□□□□ -3.21
DNF2Q12675 snR85snR85 171 nt-5.01□□□□□ -3.21
DNF2Q12675 YJL136W-AYJL136W-A 84 nt-5.02□□□□□ -3.21
DNF2Q12675 tV(UAC)QtV(UAC)Q 76 nt-5.09□□□□□ -3.22
DNF2Q12675 YDL114W-AYDL114W-A 114 nt-5.22□□□□□ -3.24
DNF2Q12675 YCR095W-AYCR095W-A 159 nt-5.27□□□□□ -3.25
DNF2Q12675 YHL015W-AYHL015W-A 84 nt-5.3□□□□□ -3.26
DNF2Q12675 snR58snR58 96 nt-5.31□□□□□ -3.26
DNF2Q12675 RPL39YJL189W 156 nt-5.31□□□□□ -3.26
DNF2Q12675 YNR025CYNR025C 360 nt-5.34□□□□□ -3.26
DNF2Q12675 YDR157WYDR157W 402 nt-5.36□□□□□ -3.27
DNF2Q12675 YDR118W-AYDR118W-A 117 nt-5.41□□□□□ -3.28
DNF2Q12675 YBL100W-CYBL100W-C 120 nt-5.41□□□□□ -3.28
DNF2Q12675 snR52snR52 92 nt-5.43□□□□□ -3.28
DNF2Q12675 SOM1YEL059C-A 225 nt-5.47□□□□□ -3.28
DNF2Q12675 YNL277W-AYNL277W-A 189 nt-5.51□□□□□ -3.29
DNF2Q12675 YKL096C-BYKL096C-B 150 nt-5.52□□□□□ -3.29
DNF2Q12675 YOR302WYOR302W 78 nt-5.55□□□□□ -3.3
DNF2Q12675 YOL164W-AYOL164W-A 183 nt-5.58□□□□□ -3.3
DNF2Q12675 snR47snR47 99 nt-5.6□□□□□ -3.31
DNF2Q12675 YBL071C-BYBL071C-B 99 nt-5.61□□□□□ -3.31
DNF2Q12675 YNL170WYNL170W 396 nt-5.68□□□□□ -3.32
DNF2Q12675 YBL053WYBL053W 375 nt-5.7□□□□□ -3.32
DNF2Q12675 YGR151CYGR151C 336 nt-5.75□□□□□ -3.33
DNF2Q12675 SPG3YDR504C 384 nt-5.77□□□□□ -3.33
DNF2Q12675 YDL159W-AYDL159W-A 132 nt-5.79□□□□□ -3.34
DNF2Q12675 YHR175W-AYHR175W-A 150 nt-5.81□□□□□ -3.34
DNF2Q12675 YKL225WYKL225W 348 nt-5.83□□□□□ -3.34
DNF2Q12675 YDL240C-AYDL240C-A 138 nt-5.94□□□□□ -3.36
DNF2Q12675 YAL037C-AYAL037C-A 93 nt-6.03□□□□□ -3.38
DNF2Q12675 YEL050W-AYEL050W-A 192 nt-6.05□□□□□ -3.38
DNF2Q12675 tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 86 nt-6.07□□□□□ -3.38
DNF2Q12675 YDR034C-AYDR034C-A 177 nt-6.17□□□□□ -3.4
DNF2Q12675 YGR122C-AYGR122C-A 129 nt-6.17□□□□□ -3.4
DNF2Q12675 tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 73 nt-6.17□□□□□ -3.4
DNF2Q12675 YPL152W-AYPL152W-A 99 nt-6.23□□□□□ -3.41
DNF2Q12675 tC(GCA)QtC(GCA)Q 76 nt-6.3□□□□□ -3.42
DNF2Q12675 snR65snR65 100 nt-6.47□□□□□ -3.45
DNF2Q12675 YGL007C-AYGL007C-A 87 nt-6.79□□□□□ -3.5
DNF2Q12675 YOR225WYOR225W 330 nt-6.81□□□□□ -3.5
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 28.5 ms