Protein–RNA interactions for Protein: Q12457

NSI1, RNA polymerase I termination factor, yeastyeast

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Length 570 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NSI1Q12457 BEM3YPL115C 3387 nt1.43□□□□□ -2.18
NSI1Q12457 YLR149C-AYLR149C-A 87 nt1.42□□□□□ -2.18
NSI1Q12457 BUL2YML111W 2763 nt1.42□□□□□ -2.18
NSI1Q12457 HKR1YDR420W 5409 nt1.41□□□□□ -2.18
NSI1Q12457 YDL159W-AYDL159W-A 132 nt1.41□□□□□ -2.18
NSI1Q12457 YML054C-AYML054C-A 159 nt1.41□□□□□ -2.18
NSI1Q12457 RDS3YPR094W 324 nt1.38□□□□□ -2.19
NSI1Q12457 YNL284C-BYNL284C-B 5268 nt1.36□□□□□ -2.19
NSI1Q12457 NIP1YMR309C 2439 nt1.36□□□□□ -2.19
NSI1Q12457 YGR130CYGR130C 2451 nt1.34□□□□□ -2.19
NSI1Q12457 HUG1YML058W-A 207 nt1.34□□□□□ -2.19
NSI1Q12457 PAU12YGR294W 363 nt1.32□□□□□ -2.2
NSI1Q12457 RPL41AYDL184C 78 nt1.3□□□□□ -2.2
NSI1Q12457 YHR180C-BYHR180C-B 105 nt1.3□□□□□ -2.2
NSI1Q12457 YBR296C-AYBR296C-A 120 nt1.3□□□□□ -2.2
NSI1Q12457 YLL006W-AYLL006W-A 177 nt1.29□□□□□ -2.2
NSI1Q12457 RKR1YMR247C 4689 nt1.27□□□□□ -2.21
NSI1Q12457 YKL096C-BYKL096C-B 150 nt1.27□□□□□ -2.21
NSI1Q12457 SPT7YBR081C 3999 nt1.25□□□□□ -2.21
NSI1Q12457 YPR117WYPR117W 7470 nt1.25□□□□□ -2.21
NSI1Q12457 tH(GUG)E1tH(GUG)E1 72 nt1.24□□□□□ -2.21
NSI1Q12457 tH(GUG)E2tH(GUG)E2 72 nt1.24□□□□□ -2.21
NSI1Q12457 tH(GUG)G1tH(GUG)G1 72 nt1.24□□□□□ -2.21
NSI1Q12457 tH(GUG)G2tH(GUG)G2 72 nt1.24□□□□□ -2.21
NSI1Q12457 tH(GUG)HtH(GUG)H 72 nt1.24□□□□□ -2.21
NSI1Q12457 tH(GUG)KtH(GUG)K 72 nt1.24□□□□□ -2.21
NSI1Q12457 tH(GUG)MtH(GUG)M 72 nt1.24□□□□□ -2.21
NSI1Q12457 SIP4YJL089W 2490 nt1.24□□□□□ -2.21
NSI1Q12457 IML1YJR138W 4755 nt1.23□□□□□ -2.21
NSI1Q12457 YJL077W-AYJL077W-A 87 nt1.22□□□□□ -2.21
NSI1Q12457 YER078W-AYER078W-A 165 nt1.2□□□□□ -2.22
NSI1Q12457 SKI7YOR076C 2244 nt1.19□□□□□ -2.22
NSI1Q12457 YOR192C-BYOR192C-B 5313 nt1.18□□□□□ -2.22
NSI1Q12457 tV(UAC)BtV(UAC)B 74 nt1.18□□□□□ -2.22
NSI1Q12457 tV(UAC)DtV(UAC)D 74 nt1.18□□□□□ -2.22
NSI1Q12457 YGR122C-AYGR122C-A 129 nt1.17□□□□□ -2.22
NSI1Q12457 YER090C-AYER090C-A 90 nt1.16□□□□□ -2.22
NSI1Q12457 tQ(UUG)QtQ(UUG)Q 76 nt1.15□□□□□ -2.23
NSI1Q12457 VAM6YDL077C 3150 nt1.14□□□□□ -2.23
NSI1Q12457 YJR029WYJR029W 5268 nt1.14□□□□□ -2.23
NSI1Q12457 YPR137C-BYPR137C-B 5268 nt1.14□□□□□ -2.23
NSI1Q12457 snR75snR75 89 nt1.12□□□□□ -2.23
NSI1Q12457 SCC2YDR180W 4482 nt1.08□□□□□ -2.24
NSI1Q12457 DOP1YDR141C 5097 nt1.05□□□□□ -2.24
NSI1Q12457 BEM2YER155C 6504 nt1.03□□□□□ -2.24
NSI1Q12457 YBL100W-BYBL100W-B 5313 nt1.03□□□□□ -2.24
NSI1Q12457 PET111YMR257C 2403 nt1.01□□□□□ -2.25
NSI1Q12457 LTE1YAL024C 4308 nt1□□□□□ -2.25
NSI1Q12457 YMR160WYMR160W 2451 nt0.99□□□□□ -2.25
NSI1Q12457 PAU24YBR301W 363 nt0.98□□□□□ -2.25
NSI1Q12457 EMT1tM(CAU)D 73 nt0.97□□□□□ -2.25
NSI1Q12457 EMT5tM(CAU)J1 73 nt0.97□□□□□ -2.25
NSI1Q12457 EMT3tM(CAU)J2 73 nt0.97□□□□□ -2.25
NSI1Q12457 EMT4tM(CAU)M 73 nt0.97□□□□□ -2.25
NSI1Q12457 EMT2tM(CAU)O2 73 nt0.97□□□□□ -2.25
NSI1Q12457 snR67snR67 82 nt0.94□□□□□ -2.26
NSI1Q12457 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt0.89□□□□□ -2.27
NSI1Q12457 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt0.89□□□□□ -2.27
NSI1Q12457 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt0.89□□□□□ -2.27
NSI1Q12457 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt0.89□□□□□ -2.27
NSI1Q12457 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt0.89□□□□□ -2.27
NSI1Q12457 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt0.89□□□□□ -2.27
NSI1Q12457 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt0.89□□□□□ -2.27
NSI1Q12457 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt0.89□□□□□ -2.27
NSI1Q12457 UTP20YBL004W 7482 nt0.86□□□□□ -2.27
NSI1Q12457 MLP2YIL149C 5040 nt0.84□□□□□ -2.27
NSI1Q12457 tV(UAC)QtV(UAC)Q 76 nt0.83□□□□□ -2.28
NSI1Q12457 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.8□□□□□ -2.28
NSI1Q12457 MLP1YKR095W 5628 nt0.77□□□□□ -2.29
NSI1Q12457 YDL114W-AYDL114W-A 114 nt0.76□□□□□ -2.29
NSI1Q12457 YKL106C-AYKL106C-A 120 nt0.76□□□□□ -2.29
NSI1Q12457 ESP1YGR098C 4893 nt0.75□□□□□ -2.29
NSI1Q12457 IQG1YPL242C 4488 nt0.75□□□□□ -2.29
NSI1Q12457 YOL014WYOL014W 375 nt0.74□□□□□ -2.29
NSI1Q12457 YML100W-AYML100W-A 174 nt0.72□□□□□ -2.29
NSI1Q12457 SOV1YMR066W 2697 nt0.71□□□□□ -2.3
NSI1Q12457 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.69□□□□□ -2.3
NSI1Q12457 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.69□□□□□ -2.3
NSI1Q12457 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.69□□□□□ -2.3
NSI1Q12457 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.69□□□□□ -2.3
NSI1Q12457 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.69□□□□□ -2.3
NSI1Q12457 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.69□□□□□ -2.3
NSI1Q12457 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.69□□□□□ -2.3
NSI1Q12457 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.69□□□□□ -2.3
NSI1Q12457 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.69□□□□□ -2.3
NSI1Q12457 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.69□□□□□ -2.3
NSI1Q12457 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.69□□□□□ -2.3
NSI1Q12457 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt0.69□□□□□ -2.3
NSI1Q12457 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.68□□□□□ -2.3
NSI1Q12457 YOR376W-AYOR376W-A 156 nt0.68□□□□□ -2.3
NSI1Q12457 THO2YNL139C 4794 nt0.64□□□□□ -2.31
NSI1Q12457 UTP10YJL109C 5310 nt0.64□□□□□ -2.31
NSI1Q12457 FMP27YLR454W 7887 nt0.61□□□□□ -2.31
NSI1Q12457 YOR186C-AYOR186C-A 210 nt0.56□□□□□ -2.32
NSI1Q12457 YOR316C-AYOR316C-A 210 nt0.53□□□□□ -2.32
NSI1Q12457 snR77snR77 88 nt0.5□□□□□ -2.33
NSI1Q12457 snR40snR40 97 nt0.44□□□□□ -2.34
NSI1Q12457 SBH2YER019C-A 267 nt0.41□□□□□ -2.34
NSI1Q12457 YOL013W-AYOL013W-A 192 nt0.33□□□□□ -2.36
NSI1Q12457 snR128snR128 126 nt0.33□□□□□ -2.36
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