Protein–RNA interactions for Protein: Q08345

DDR1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1Q08345 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DDR1Q08345 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DDR1Q08345 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DDR1Q08345 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DDR1Q08345 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DDR1Q08345 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DDR1Q08345 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
DDR1Q08345 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DDR1Q08345 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DDR1Q08345 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
DDR1Q08345 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DDR1Q08345 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DDR1Q08345 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DDR1Q08345 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DDR1Q08345 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDR1Q08345 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDR1Q08345 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDR1Q08345 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDR1Q08345 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDR1Q08345 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDR1Q08345 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDR1Q08345 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDR1Q08345 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDR1Q08345 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDR1Q08345 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDR1Q08345 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDR1Q08345 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDR1Q08345 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDR1Q08345 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDR1Q08345 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDR1Q08345 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDR1Q08345 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DDR1Q08345 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DDR1Q08345 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DDR1Q08345 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DDR1Q08345 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
DDR1Q08345 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DDR1Q08345 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DDR1Q08345 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DDR1Q08345 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DDR1Q08345 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DDR1Q08345 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DDR1Q08345 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DDR1Q08345 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DDR1Q08345 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DDR1Q08345 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DDR1Q08345 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DDR1Q08345 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DDR1Q08345 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DDR1Q08345 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DDR1Q08345 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DDR1Q08345 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DDR1Q08345 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
DDR1Q08345 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DDR1Q08345 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DDR1Q08345 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
DDR1Q08345 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DDR1Q08345 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DDR1Q08345 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DDR1Q08345 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DDR1Q08345 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DDR1Q08345 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
DDR1Q08345 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DDR1Q08345 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DDR1Q08345 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DDR1Q08345 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DDR1Q08345 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DDR1Q08345 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DDR1Q08345 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DDR1Q08345 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DDR1Q08345 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DDR1Q08345 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DDR1Q08345 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DDR1Q08345 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DDR1Q08345 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DDR1Q08345 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DDR1Q08345 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
DDR1Q08345 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
DDR1Q08345 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DDR1Q08345 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DDR1Q08345 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DDR1Q08345 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DDR1Q08345 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
DDR1Q08345 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
DDR1Q08345 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
DDR1Q08345 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
DDR1Q08345 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
DDR1Q08345 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
DDR1Q08345 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
DDR1Q08345 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
DDR1Q08345 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
DDR1Q08345 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
DDR1Q08345 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
DDR1Q08345 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
DDR1Q08345 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
DDR1Q08345 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
DDR1Q08345 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
DDR1Q08345 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DDR1Q08345 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DDR1Q08345 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms