Protein–RNA interactions for Protein: Q03989

ARID5A, AT-rich interactive domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID5AQ03989 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ARID5AQ03989 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ARID5AQ03989 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ARID5AQ03989 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ARID5AQ03989 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ARID5AQ03989 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ARID5AQ03989 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ARID5AQ03989 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ARID5AQ03989 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ARID5AQ03989 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ARID5AQ03989 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ARID5AQ03989 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ARID5AQ03989 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ARID5AQ03989 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ARID5AQ03989 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ARID5AQ03989 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ARID5AQ03989 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARID5AQ03989 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARID5AQ03989 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARID5AQ03989 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARID5AQ03989 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARID5AQ03989 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ARID5AQ03989 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ARID5AQ03989 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARID5AQ03989 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARID5AQ03989 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARID5AQ03989 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ARID5AQ03989 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARID5AQ03989 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARID5AQ03989 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARID5AQ03989 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARID5AQ03989 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARID5AQ03989 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARID5AQ03989 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARID5AQ03989 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARID5AQ03989 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARID5AQ03989 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARID5AQ03989 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARID5AQ03989 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARID5AQ03989 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARID5AQ03989 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARID5AQ03989 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARID5AQ03989 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARID5AQ03989 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARID5AQ03989 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARID5AQ03989 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARID5AQ03989 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARID5AQ03989 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARID5AQ03989 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARID5AQ03989 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARID5AQ03989 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARID5AQ03989 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARID5AQ03989 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARID5AQ03989 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ARID5AQ03989 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ARID5AQ03989 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARID5AQ03989 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARID5AQ03989 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ARID5AQ03989 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARID5AQ03989 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARID5AQ03989 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARID5AQ03989 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARID5AQ03989 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARID5AQ03989 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARID5AQ03989 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARID5AQ03989 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARID5AQ03989 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARID5AQ03989 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARID5AQ03989 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARID5AQ03989 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARID5AQ03989 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARID5AQ03989 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARID5AQ03989 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARID5AQ03989 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARID5AQ03989 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARID5AQ03989 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARID5AQ03989 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARID5AQ03989 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARID5AQ03989 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARID5AQ03989 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARID5AQ03989 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ARID5AQ03989 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ARID5AQ03989 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ARID5AQ03989 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARID5AQ03989 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARID5AQ03989 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARID5AQ03989 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARID5AQ03989 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARID5AQ03989 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARID5AQ03989 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARID5AQ03989 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARID5AQ03989 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARID5AQ03989 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARID5AQ03989 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARID5AQ03989 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARID5AQ03989 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARID5AQ03989 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARID5AQ03989 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ARID5AQ03989 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARID5AQ03989 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms