Protein–RNA interactions for Protein: Q02820

NCE101, Non-classical export protein 1, yeast

Predictions only

Length 53 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NCE101	Q02820	BIL1	YOR304C-A	231 nt		-6.18	□□□□□ -3.4
NCE101	Q02820	YJR157W	YJR157W	363 nt		-6.19	□□□□□ -3.4
NCE101	Q02820	snR57	snR57	88 nt		-6.2	□□□□□ -3.4
NCE101	Q02820	YOR072W-B	YOR072W-B	162 nt		-6.2	□□□□□ -3.4
NCE101	Q02820	YIL115W-A	YIL115W-A	372 nt		-6.23	□□□□□ -3.41
NCE101	Q02820	YOL013W-B	YOL013W-B	291 nt		-6.24	□□□□□ -3.41
NCE101	Q02820	snR41	snR41	95 nt		-6.24	□□□□□ -3.41
NCE101	Q02820	YLR163W-A	YLR163W-A	114 nt		-6.26	□□□□□ -3.41
NCE101	Q02820	YFL032W	YFL032W	321 nt		-6.31	□□□□□ -3.42
NCE101	Q02820	ATP6	Q0085	780 nt		-6.33	□□□□□ -3.42
NCE101	Q02820	YLR299C-A	YLR299C-A	93 nt		-6.36	□□□□□ -3.43
NCE101	Q02820	YDL016C	YDL016C	303 nt		-6.42	□□□□□ -3.44
NCE101	Q02820	YDR413C	YDR413C	576 nt		-6.42	□□□□□ -3.44
NCE101	Q02820	snR87	snR87	109 nt		-6.52	□□□□□ -3.45
NCE101	Q02820	Q0255	Q0255	1419 nt		-6.59	□□□□□ -3.47
NCE101	Q02820	CSN9	YDR179C	489 nt		-6.61	□□□□□ -3.47
NCE101	Q02820	MPC1	YGL080W	393 nt		-6.61	□□□□□ -3.47
NCE101	Q02820	YOR381W-A	YOR381W-A	168 nt		-6.64	□□□□□ -3.47
NCE101	Q02820	YOR329W-A	YOR329W-A	210 nt		-6.7	□□□□□ -3.48
NCE101	Q02820	snR78	snR78	87 nt		-6.71	□□□□□ -3.48
NCE101	Q02820	YAL016C-B	YAL016C-B	186 nt		-6.74	□□□□□ -3.49
NCE101	Q02820	YJL136W-A	YJL136W-A	84 nt		-6.88	□□□□□ -3.51
NCE101	Q02820	YBR109W-A	YBR109W-A	225 nt		-6.9	□□□□□ -3.51
NCE101	Q02820	YGR035C	YGR035C	351 nt		-6.91	□□□□□ -3.52
NCE101	Q02820	snR60	snR60	104 nt		-7.02	□□□□□ -3.53
NCE101	Q02820	YGL041C	YGL041C	204 nt		-7.02	□□□□□ -3.53
NCE101	Q02820	YLR222C-A	YLR222C-A	231 nt		-7.06	□□□□□ -3.54
NCE101	Q02820	YEL014C	YEL014C	306 nt		-7.16	□□□□□ -3.56
NCE101	Q02820	YNL324W	YNL324W	396 nt		-7.2	□□□□□ -3.56
NCE101	Q02820	YLR434C	YLR434C	384 nt		-7.25	□□□□□ -3.57
NCE101	Q02820	YNL028W	YNL028W	318 nt		-7.27	□□□□□ -3.57
NCE101	Q02820	YDR406W-A	YDR406W-A	246 nt		-7.36	□□□□□ -3.59
NCE101	Q02820	YOR102W	YOR102W	351 nt		-7.36	□□□□□ -3.59
NCE101	Q02820	YBR296C-A	YBR296C-A	120 nt		-7.37	□□□□□ -3.59
NCE101	Q02820	YLR120W-A	YLR120W-A	102 nt		-7.39	□□□□□ -3.59
NCE101	Q02820	RPL41A	YDL184C	78 nt		-7.48	□□□□□ -3.61
NCE101	Q02820	YMR001C-A	YMR001C-A	231 nt		-7.51	□□□□□ -3.61
NCE101	Q02820	snR85	snR85	171 nt		-7.52	□□□□□ -3.61
NCE101	Q02820	YNL097C-B	YNL097C-B	123 nt		-7.55	□□□□□ -3.62
NCE101	Q02820	YBL100W-C	YBL100W-C	120 nt		-7.58	□□□□□ -3.62
NCE101	Q02820	AI5_BETA	Q0075	1065 nt		-7.59	□□□□□ -3.62
NCE101	Q02820	snR38	snR38	95 nt		-7.63	□□□□□ -3.63
NCE101	Q02820	YER006C-A	YER006C-A	318 nt		-7.67	□□□□□ -3.64
NCE101	Q02820	YGL188C-A	YGL188C-A	141 nt		-7.67	□□□□□ -3.64
NCE101	Q02820	YCR095W-A	YCR095W-A	159 nt		-7.72	□□□□□ -3.65
NCE101	Q02820	GIM4	YEL003W	336 nt		-7.77	□□□□□ -3.65
NCE101	Q02820	snR54	snR54	86 nt		-7.82	□□□□□ -3.66
NCE101	Q02820	tV(UAC)Q	tV(UAC)Q	76 nt		-7.83	□□□□□ -3.66
NCE101	Q02820	YDR118W-A	YDR118W-A	117 nt		-7.85	□□□□□ -3.67
NCE101	Q02820	YDR157W	YDR157W	402 nt		-7.85	□□□□□ -3.67
NCE101	Q02820	snR48	snR48	113 nt		-7.86	□□□□□ -3.67
NCE101	Q02820	tW(UCA)Q	tW(UCA)Q	74 nt		-7.88	□□□□□ -3.67
NCE101	Q02820	HTL1	YCR020W-B	237 nt		-7.9	□□□□□ -3.67
NCE101	Q02820	YKL118W	YKL118W	312 nt		-7.91	□□□□□ -3.68
NCE101	Q02820	YDL114W-A	YDL114W-A	114 nt		-7.92	□□□□□ -3.68
NCE101	Q02820	snR58	snR58	96 nt		-7.93	□□□□□ -3.68
NCE101	Q02820	tL(UAA)Q	tL(UAA)Q	85 nt		-7.95	□□□□□ -3.68
NCE101	Q02820	snR56	snR56	88 nt		-7.96	□□□□□ -3.68
NCE101	Q02820	YNL170W	YNL170W	396 nt		-8	□□□□□ -3.69
NCE101	Q02820	YBR131C-A	YBR131C-A	90 nt		-8.03	□□□□□ -3.69
NCE101	Q02820	RPL39	YJL189W	156 nt		-8.09	□□□□□ -3.7
NCE101	Q02820	YNL122C	YNL122C	348 nt		-8.12	□□□□□ -3.71
NCE101	Q02820	YKL096C-B	YKL096C-B	150 nt		-8.18	□□□□□ -3.72
NCE101	Q02820	tF(GAA)Q	tF(GAA)Q	75 nt		-8.34	□□□□□ -3.74
NCE101	Q02820	YAL063C-A	YAL063C-A	291 nt		-8.34	□□□□□ -3.74
NCE101	Q02820	snR34	snR34	203 nt		-8.39	□□□□□ -3.75
NCE101	Q02820	YPL038W-A	YPL038W-A	192 nt		-8.51	□□□□□ -3.77
NCE101	Q02820	YBL053W	YBL053W	375 nt		-8.61	□□□□□ -3.79
NCE101	Q02820	YDL159W-A	YDL159W-A	132 nt		-8.64	□□□□□ -3.79
NCE101	Q02820	YHL015W-A	YHL015W-A	84 nt		-8.64	□□□□□ -3.79
NCE101	Q02820	SPG3	YDR504C	384 nt		-8.71	□□□□□ -3.8
NCE101	Q02820	YOL164W-A	YOL164W-A	183 nt		-8.73	□□□□□ -3.81
NCE101	Q02820	snR47	snR47	99 nt		-8.73	□□□□□ -3.81
NCE101	Q02820	YBL071C-B	YBL071C-B	99 nt		-8.75	□□□□□ -3.81
NCE101	Q02820	SOM1	YEL059C-A	225 nt		-8.86	□□□□□ -3.83
NCE101	Q02820	YKL123W	YKL123W	381 nt		-8.87	□□□□□ -3.83
NCE101	Q02820	YHR175W-A	YHR175W-A	150 nt		-8.92	□□□□□ -3.84
NCE101	Q02820	YDR183C-A	YDR183C-A	258 nt		-8.96	□□□□□ -3.84
NCE101	Q02820	YKL225W	YKL225W	348 nt		-8.99	□□□□□ -3.85
NCE101	Q02820	YGR151C	YGR151C	336 nt		-9.11	□□□□□ -3.87
NCE101	Q02820	YAL066W	YAL066W	309 nt		-9.14	□□□□□ -3.87
NCE101	Q02820	YEL050W-A	YEL050W-A	192 nt		-9.16	□□□□□ -3.88
NCE101	Q02820	snR52	snR52	92 nt		-9.16	□□□□□ -3.88
NCE101	Q02820	YDR034C-A	YDR034C-A	177 nt		-9.2	□□□□□ -3.88
NCE101	Q02820	tC(GCA)Q	tC(GCA)Q	76 nt		-9.22	□□□□□ -3.89
NCE101	Q02820	YLR412C-A	YLR412C-A	207 nt		-9.31	□□□□□ -3.9
NCE101	Q02820	YGR122C-A	YGR122C-A	129 nt		-9.37	□□□□□ -3.91
NCE101	Q02820	tS(GCU)Q1	tS(GCU)Q1	86 nt		-9.42	□□□□□ -3.92
NCE101	Q02820	YAL037C-A	YAL037C-A	93 nt		-9.47	□□□□□ -3.93
NCE101	Q02820	YOR302W	YOR302W	78 nt		-9.51	□□□□□ -3.93
NCE101	Q02820	YNL277W-A	YNL277W-A	189 nt		-9.63	□□□□□ -3.95
NCE101	Q02820	YJL047C-A	YJL047C-A	135 nt		-9.83	□□□□□ -3.98
NCE101	Q02820	Q0143	Q0143	153 nt		-9.86	□□□□□ -3.99
NCE101	Q02820	YLR285C-A	YLR285C-A	171 nt		-10.15	□□□□□ -4.03
NCE101	Q02820	YOR225W	YOR225W	330 nt		-10.31	□□□□□ -4.06
NCE101	Q02820	snR40	snR40	97 nt		-10.39	□□□□□ -4.07
NCE101	Q02820	YGL007C-A	YGL007C-A	87 nt		-10.44	□□□□□ -4.08
NCE101	Q02820	YLR294C	YLR294C	330 nt		-10.53	□□□□□ -4.1
NCE101	Q02820	snR64	snR64	101 nt		-10.62	□□□□□ -4.11
NCE101	Q02820	YPL152W-A	YPL152W-A	99 nt		-10.69	□□□□□ -4.12

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 12.5 ms