Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
XPCQ01831 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
XPCQ01831 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
XPCQ01831 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
XPCQ01831 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
XPCQ01831 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
XPCQ01831 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
XPCQ01831 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
XPCQ01831 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
XPCQ01831 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
XPCQ01831 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
XPCQ01831 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
XPCQ01831 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
XPCQ01831 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
XPCQ01831 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
XPCQ01831 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
XPCQ01831 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
XPCQ01831 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
XPCQ01831 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
XPCQ01831 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
XPCQ01831 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
XPCQ01831 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
XPCQ01831 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
XPCQ01831 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
XPCQ01831 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
XPCQ01831 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
XPCQ01831 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
XPCQ01831 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
XPCQ01831 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
XPCQ01831 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
XPCQ01831 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
XPCQ01831 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
XPCQ01831 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
XPCQ01831 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
XPCQ01831 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
XPCQ01831 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
XPCQ01831 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
XPCQ01831 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
XPCQ01831 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
XPCQ01831 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
XPCQ01831 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
XPCQ01831 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
XPCQ01831 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
XPCQ01831 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
XPCQ01831 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
XPCQ01831 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
XPCQ01831 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
XPCQ01831 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
XPCQ01831 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
XPCQ01831 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
XPCQ01831 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
XPCQ01831 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
XPCQ01831 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
XPCQ01831 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
XPCQ01831 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
XPCQ01831 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
XPCQ01831 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
XPCQ01831 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
XPCQ01831 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
XPCQ01831 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
XPCQ01831 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
XPCQ01831 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
XPCQ01831 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
XPCQ01831 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
XPCQ01831 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
XPCQ01831 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
XPCQ01831 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
XPCQ01831 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
XPCQ01831 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
XPCQ01831 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
XPCQ01831 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
XPCQ01831 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
XPCQ01831 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
XPCQ01831 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
XPCQ01831 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
XPCQ01831 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
XPCQ01831 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
XPCQ01831 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
XPCQ01831 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
XPCQ01831 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
XPCQ01831 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
XPCQ01831 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
XPCQ01831 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
XPCQ01831 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
XPCQ01831 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
XPCQ01831 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
XPCQ01831 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
XPCQ01831 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
XPCQ01831 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
XPCQ01831 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
XPCQ01831 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
XPCQ01831 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
XPCQ01831 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
XPCQ01831 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
XPCQ01831 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
XPCQ01831 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
XPCQ01831 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
XPCQ01831 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
XPCQ01831 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
XPCQ01831 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms